| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,909,956 | Δ1 bp | 6.2% | intergenic (+304/+175) | PP_4318 → / ← PP_4319 | transposase/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,909,956 | 0 | C | . | 6.2% | 237.0 / 10.9 | 80 | intergenic (+304/+175) | PP_4318/PP_4319 | transposase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/39); new base . (2/3); total (38/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.59e-01 | |||||||||||
GCGCATAGTCACCTTTCCGCCCTTACGGCGGGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGCCTTCTGAAGTCGCAATCTGCGTCGCCTGAACTACCGCGCGCTTACAAGCAAAAGCAGAAGCAGAAGCAG > NC_002947/4909807‑4910101 | gcgcATAGTCACCTTTCCGCCCTTACGGCGGGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGc > 1:181147/1‑150 (MQ=255) cgcATAGTCACCTTTCCGCCCTTACGGCGGGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCa < 2:332230/150‑1 (MQ=255) aaccgttCCGCCCTTACGGCGGGTCACTTTTTTTTTATTTCTTCAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCTCCTGCGCTACGCTCCGGGGCTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCCGGAGG‑A‑CGCGCTCCCGGCCccat > 2:319111/6‑150 (MQ=11) aCCTTTCCGCCCTTACGGCGGGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCccatc > 1:39070/1‑150 (MQ=39) ccTTTCCGCCCTTACGGCGGGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTACGGGGTTCCCTCGATACGGAGTT‑CGGCATGGCGTGA‑CGCGCGGCAGGCCccatcc > 2:155135/1‑150 (MQ=11) cTTTCCGCCCTTACGGCGGGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCccatcca > 2:118607/1‑150 (MQ=37) cTTTCCGCCCTTACGGCGGGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCccatcca > 1:866588/1‑150 (MQ=38) gCCCTTACGGCGGGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCccat > 2:1338212/1‑141 (MQ=32) gCCCTTACGGCGGGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCccat < 1:1338212/141‑1 (MQ=32) cccTTACGGCGGGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTTCGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCAAGGAGca < 2:634020/150‑2 (MQ=12) ccTTACGGCGGGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCt > 1:691779/1‑150 (MQ=32) ttACGGCGGGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTG‑AGGCCCCATGGATGGGGCCtgca < 2:980001/150‑4 (MQ=11) cgttctgcttctgcgtctgcgtctgcttctgcttttgctgttgcttctaagcgcgcgatagttcaggcgacgcagattgcgacttcaggaggccgagcgtagggcttgcTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑Ca < 2:1408857‑M2/41‑1 (MQ=255) ggcggGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTG‑AGGCCCCATGGATGGGGCCTGCAgcgc < 2:1079063/150‑1 (MQ=11) gcggGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATGGATGGGGCCTGCAgcgc < 1:155560/150‑1 (MQ=255) cggGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGTGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCtt < 2:691779/150‑1 (MQ=17) cACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACgg < 2:1289336/150‑1 (MQ=32) tttttGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCa > 2:768166/1‑150 (MQ=32) tttttGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCa < 1:488650/150‑1 (MQ=32) tCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATg > 2:1261902/1‑150 (MQ=32) aaaCGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGa > 2:597672/1‑136 (MQ=33) aaaCGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGa < 1:597672/136‑1 (MQ=33) aaCGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGccc < 2:39070/150‑1 (MQ=32) aaCGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGccc > 2:465798/1‑150 (MQ=32) aaCGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGccc > 1:504451/1‑150 (MQ=32) cgcgACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGt > 1:208368/1‑150 (MQ=32) ccaccAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCTCTCCTTTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTCAACTTTTGCTCCGGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATGGATGCCCGTc < 1:319111/146‑1 (MQ=11) gACAAAAAGTAACCAAAACACGCTAGATGTTATCACCTTGCCCTGGCTCGACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATGGATGCCCGTCaa < 2:866588/150‑2 (MQ=11) cAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATGGATGCCCGTCaagc < 1:322299/150‑4 (MQ=255) aaaGTAACCAACAACCGCTGGATCCTCTCGGCCGGCCGTTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTccc < 2:1224628/150‑1 (MQ=11) tgcttttgcttgtaagcgcgcggtagttcaggcgacgcagattgcgacttcagaaggccgagcgcagggcttgc‑GAAGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTc < 2:242732‑M2/76‑1 (MQ=255) gTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTc < 2:195798/150‑1 (MQ=34) aaCCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTc > 1:1038498/1‑148 (MQ=34) aaCCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTc < 2:1038498/148‑1 (MQ=33) aaaaaaCGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATggg > 1:1130204/1‑102 (MQ=33) aaaaaaCGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATggg < 2:1130204/102‑1 (MQ=33) ctaagtgcgcggtagttcaggcgacgcagattgcgacttcaggaggccgagcgcagggcttgcTCCCGGGAGG‑ACCGCGCTGCAGGCCCCATCC‑TGGGGCC‑‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTCCGCAAGCCCTgc < 1:399384‑M2/87‑1 (MQ=255) ctaagcgcgcgatagcccaggcgccgcggattgcgacttcaggaggccgagcgcagggcttgcTCCCGGGAGG‑ACCGCGCTGCAGGCCCCATCC‑TGGGGCC‑‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTgc < 2:98245‑M2/87‑1 (MQ=255) aCGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAgc > 2:1146106/1‑105 (MQ=33) aCGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAgc < 1:1146106/105‑1 (MQ=33) aCGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTgc > 1:109604/1‑150 (MQ=38) aCGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTgc < 1:155135/150‑1 (MQ=38) tCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGcc > 2:716317/1‑150 (MQ=38) tCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCACAACCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGcc > 1:956539/1‑150 (MQ=255) cTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTc > 1:204891/1‑119 (MQ=31) cTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTc < 2:204891/119‑1 (MQ=31) atcatcCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGCCTTCt < 2:113932/150‑1 (MQ=37) tcatcCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGCCTTCTg < 1:584024/150‑1 (MQ=38) ttcaggcgacgcagattgcgacttcaggaggccgagcgtagggcttgcTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGccc > 2:946522‑M2/49‑112 (MQ=255) ttcaggcgacgcagattgcgacttcaggaggccgagcgtagggcttgcTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGccc < 1:946522‑M2/64‑1 (MQ=255) cccTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGCCTTCTGAAGTCGCaa > 1:1081860/1‑150 (MQ=38) 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cTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGCCTTCTGAAGTCGCAATCTGCGTCGCCTGAACTACcgcgc > 2:712108/1‑150 (MQ=255) tCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCACCATCCATAGGGCCT‑CAGCGCTTTAGCGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGCCTTCTGAAGTCGCAATCTGCGTCGCCTGAAATACcgcgcg > 2:712315/1‑150 (MQ=14) tACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGCCTTCTGAGCTTGCAATCTGCGTCGCCTCAACTACCGCGCGCTTa > 2:1142891/1‑150 (MQ=255) ggTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGCCTTCTGAAGTCGCAATCTGCGTCGCCTGAACTACCGCGCGCTTACaa < 2:1341071/150‑1 (MQ=255) ggTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGCCTTCTGAAGTCGCAATCTGCGTCGCCTGAACTACCGCGCGCTTACaa < 1:465798/150‑1 (MQ=255) gTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCtt < 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1:1417160/5‑84 (MQ=11) tcaagcgcTG‑AGGCCCCATGGATGGGGCCTGCAGCGCGTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTc < 2:1417160/80‑1 (MQ=11) tcaagcgcTG‑AGGCCCCATGGATGGGGCCT‑‑‑GCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCAACTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGCCTTCTGAAGTCGCAATCTGCGTCGCCTGAACTACCGCGCGCTTACAAGCAAaagcagaagcagaag > 2:1406651/5‑150 (MQ=17) cgcgCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGCCTTCTGAAGTCGCAATCTGCGTCGCCTGAACTACCGCGCGCTTACAAGCAAaagcagaagcagaag > 2:721534/1‑150 (MQ=255) gcTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGCCTTCTGAAGTCGCAATCTGCGTCGCCTGAACTACCGCGCGCTTACaa > 2:746623/1‑128 (MQ=255) gcTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGCCTTCTGAAGTCGCAATCTGCGTCGCCTGAACTACCGCGCGCTTACaa < 1:746623/128‑1 (MQ=255) gcTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGCCTTCTGAAGTCGCAATCTGCGTCGCCTGAACTACCGCGCGCTTACAAGCAAaagcagaagcagaagcag < 2:1406906/150‑1 (MQ=255) | GCGCATAGTCACCTTTCCGCCCTTACGGCGGGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTACGGTCTTGCTCCCGGGAGT‑A‑CGCGCTGCAGGCCCCATCCATGGGGCCT‑CAGCGCTTGACGGGCATCCATGCCCGTCACCTCCCTTCGCAAGCCCTGCGCTCGGCCTTCTGAAGTCGCAATCTGCGTCGCCTGAACTACCGCGCGCTTACAAGCAAAAGCAGAAGCAGAAGCAG > NC_002947/4909807‑4910101 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |