| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,227,322 | Δ1 bp | 5.6% | coding (1785/2391 nt) | PP_4606 ← | ferric siderophore receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,227,322 | 0 | A | . | 5.6% | 209.8 / 7.0 | 71 | coding (1785/2391 nt) | PP_4606 | ferric siderophore receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/32); new base . (2/2); total (37/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.15e-01 | |||||||||||
TTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTGGCCA > NC_002947/5227179‑5227469 | ccgatctAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGGTCGAGACCAGTACAGTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCTCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGcc < 1:1046061/144‑1 (MQ=255) gCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCAc < 1:438197/150‑1 (MQ=255) tAGACCGTCTCGCTTGTGGAGGCGACAAAGTTCGAGACCATTACACTGTGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGCCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑gag < 2:211577/150‑1 (MQ=255) tAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑gag < 1:1213100/150‑1 (MQ=255) gACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑gagga < 2:233181/150‑1 (MQ=255) gACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCACCCAGGTGCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCaagatcgg > 2:1046061/1‑143 (MQ=255) tctcGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTCGATCTTCCGAACTATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGa < 2:1107345/150‑1 (MQ=255) ctcGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTC‑GGTGGCACCTgaggagggcaa < 2:325411/150‑6 (MQ=255) ttGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGc > 1:528371/1‑146 (MQ=255) ttGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGc < 2:528371/146‑1 (MQ=255) tgtgACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCATTGCCGTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGAc < 1:336445/150‑1 (MQ=255) ggCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCGGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCGCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGcc < 1:608644/150‑1 (MQ=255) tCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTc > 2:334221/1‑150 (MQ=255) aaaGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACTCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGa < 1:670551/137‑1 (MQ=255) aaaGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGa > 2:670551/1‑137 (MQ=255) aaaGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAg > 1:159497/1‑150 (MQ=255) aaaGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTC‑GGTGGCAcctgatga < 2:355021/126‑7 (MQ=255) aaaGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTC‑GGTGGCACCTgagga > 1:355021/1‑126 (MQ=255) aaGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAgc < 1:334221/150‑1 (MQ=255) gTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAgcgg > 2:951542/1‑150 (MQ=255) ttCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAgcggc > 2:449492/1‑150 (MQ=255) gagaCCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGGGATGCGTAATGGCATGTCGCGGTTGGACCAAAAAAGATACCTACAACCCGTTTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGTGCAGCGGcgcg > 1:1033313/1‑150 (MQ=255) cAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGt > 1:731463/1‑150 (MQ=255) aGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTc > 1:686511/1‑150 (MQ=255) 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gATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGa < 1:951542/150‑1 (MQ=255) gATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGa < 2:27011/150‑1 (MQ=255) atCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑ga > 1:1348383/1‑90 (MQ=255) atCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑ga < 2:1348383/90‑1 (MQ=255) tCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCg > 2:1324633/1‑150 (MQ=255) tCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCg > 2:72244/1‑150 (MQ=255) tCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGACTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCg > 2:50430/1‑150 (MQ=255) tCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGATTGGCGCCCAGCTCCAACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGCCGAGTGGGGCTTGGACGACTCg > 2:631990/1‑150 (MQ=255) tCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTAGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCg > 1:1363706/1‑150 (MQ=255) gAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCt < 2:744697/150‑1 (MQ=255) aGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCa > 1:1348946/1‑150 (MQ=255) gTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAg > 2:964921/1‑150 (MQ=255) cTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGa > 2:631498/1‑112 (MQ=255) cTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGa < 1:631498/112‑1 (MQ=255) tgtgATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGAt > 2:625899/1‑105 (MQ=255) tgtgATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGAt < 1:625899/105‑1 (MQ=255) cGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGACCGAGCGCTgg < 2:1348946/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGa > 1:344264/1‑103 (MQ=255) ggCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGa < 2:344264/103‑1 (MQ=255) gCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTgggc < 1:50430/150‑3 (MQ=255) gTCTAGCTTGGCGCTCAGTTCCCACGCCTTGCCCTCTTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGTACGACATTGCCGGTCAGCGGTTCAATGGTCGATTTGTTCTTGAACGACTCGCTTTATCTGCCTGAGAACGTTATCTGGTCTTCTACtgt < 2:11683/150‑3 (MQ=255) tCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTg > 1:22106/1‑150 (MQ=255) tCGAGCTTGGCGCCCAGCTACCACGCCGTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTg > 2:837132/1‑150 (MQ=255) gCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTaaa < 1:231346/150‑1 (MQ=255) cTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAAc < 2:731463/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACg > 1:458454/1‑150 (MQ=255) cTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTg > 2:780179/1‑150 (MQ=255) ccccACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGCGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGa < 2:209451/149‑1 (MQ=255) ccACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGAc > 1:766127/1‑126 (MQ=255) ccACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGAc < 2:766127/126‑1 (MQ=255) ccACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTg > 1:1319813/1‑130 (MQ=255) ccACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTg < 2:1319813/130‑1 (MQ=255) ccACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAgg > 2:77449/1‑150 (MQ=255) ccACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAgg > 2:1109805/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTAccc > 2:1236725/1‑150 (MQ=255) cTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGCCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTg < 2:96591/111‑1 (MQ=255) cTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGCCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTg > 1:96591/1‑111 (MQ=255) gCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGc < 1:1109805/150‑1 (MQ=255) gactcctc‑GGTGGCACCTGAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGcc > 2:1273259/3‑150 (MQ=255) cctcAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTGGc < 1:1324633/150‑1 (MQ=255) tcAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTGGCCa > 1:955204/1‑150 (MQ=255) tcAGGTGCCACC‑GAGGAGTAGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTggacc > 1:622480/1‑147 (MQ=255) | TTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTGGCCA > NC_002947/5227179‑5227469 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |