| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,882,291:1 | +G | 6.2% | coding (906/1416 nt) | oprN → | multidrug RND transporter outer membrane protein OprN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,882,291 | 1 | . | G | 6.2% | 261.1 / 10.5 | 64 | coding (906/1416 nt) | oprN | multidrug RND transporter outer membrane protein OprN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (27/33); new base G (2/2); total (29/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.03e-01 | |||||||||||
GACGCGCTCAGCGTAGACCTGTCGCCCAAGGCCCTGCCGGCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTGGGCACTGGGCCCGAGCATTACCTGGGCGGCCTTCGACCT > NC_002947/3882145‑3882431 | gACGCGCTCAGCGTAGACCTGTCGCCCAAGGCCATCATAGCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGTGGCCA‑CGCCAACGTTGGC‑ggtg < 1:1142916/150‑4 (MQ=255) aCGCGCTCAGCGTAGACCTGTCGCCCAAGGCCCTGCCGGCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACAGCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTgg < 2:555606/150‑1 (MQ=255) cgcgCTCAGCGTAGACCTGTCGCCCAAGGCCCTGCCGGCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGc < 2:390956/150‑1 (MQ=255) gTAGACCTGTCGCCCAAGGCCCTGCCGGCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGAc < 1:1192650/150‑1 (MQ=255) gTAGACCTGTCGCCCAAGGCCCTGCCGGCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGAc > 1:331219/1‑150 (MQ=255) acatGTCGCCCAAGGCCCTGCCAGCCATCGCCAGGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGt > 2:55274/4‑150 (MQ=255) cGCCCAAGGCCCTGCCGGCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCcgc < 2:1403869/150‑1 (MQ=255) ccAAGGCCCTGCCGGCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCcgcgcg > 1:1269158/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCCTGCCGGCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGt > 1:634338/1‑150 (MQ=255) aGGCCCTGCCGGCCATCGCAAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCa > 2:203118/1‑150 (MQ=255) cccTGCCGGCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGcc > 2:1253121/1‑150 (MQ=255) ccTGCCGGCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCCAAGAGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCTTGGCCAACATTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCt > 1:674021/1‑150 (MQ=255) gCCGGCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAg < 1:1050010/150‑1 (MQ=255) ccGGCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGt < 2:690614/150‑1 (MQ=255) ccGGCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGt < 2:1234449/150‑1 (MQ=255) ccGGCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGAGGAACTGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGt < 1:1085616/150‑1 (MQ=255) gCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCA‑CGCCAACGTTGGCGGTGgccgccgccagctg > 2:916096/1‑120 (MQ=38) gCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCA‑CGCCAACGTTGGCGGTGgccgccgccagctg < 1:916096/125‑6 (MQ=38) ccATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCt < 1:437211/150‑1 (MQ=255) aTCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTc > 1:1240881/1‑150 (MQ=255) aTCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTc > 2:1222342/1‑150 (MQ=255) tCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGc > 1:1118371/1‑109 (MQ=255) tCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGc < 2:1118371/109‑1 (MQ=255) gCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCAGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACATGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTc > 2:303402/1‑150 (MQ=255) ccAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCg > 2:602561/1‑150 (MQ=255) cAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTg > 1:1079353/1‑103 (MQ=255) cAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTg < 2:1079353/103‑1 (MQ=255) cAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCgg < 1:892830/150‑1 (MQ=255) aaGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGc < 1:120757/150‑1 (MQ=255) aaGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGc < 2:1269158/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCtt < 1:567703/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCttt > 1:631953/1‑150 (MQ=255) ccGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTAccgcc < 1:983944/150‑1 (MQ=255) ggtcggtGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACcgccgc > 1:753013/1‑150 (MQ=255) tGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCgg < 1:514714/150‑1 (MQ=255) gctgctGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑Gt > 1:83717/1‑72 (MQ=255) gctgctGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑Gt < 2:83717/72‑1 (MQ=255) ctgctgCGCCGCCGCCCGGACCTCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGTA‑TCGTCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGc < 1:602561/150‑1 (MQ=255) tgctgcGTCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGct > 2:315332/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTc < 2:1099496/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTc < 1:1322403/150‑1 (MQ=255) ccgccgccCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTcggc < 2:1240881/150‑1 (MQ=255) cgccgccCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTcggcg < 2:1345567/150‑1 (MQ=255) ccgccCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCcg > 2:208516/1‑82 (MQ=255) ccgccCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCcg < 1:208516/82‑1 (MQ=255) ccgccCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCggcggc > 1:350497/1‑150 (MQ=255) aTCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTgg > 1:805018/1‑150 (MQ=255) tcagtaGCGCCGAGCGACTGCTAGCTGCGGCGACGGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTggg > 2:1156531/6‑150 (MQ=255) cGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTGGGCa < 1:1222342/150‑1 (MQ=255) gCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTACCCGGCTTTTCCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTGGGCAc > 2:1261661/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTc < 1:54678/114‑1 (MQ=255) cAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTc > 2:54678/1‑114 (MQ=255) gcCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTGGGCACTGGGc < 1:734716/150‑1 (MQ=255) gcCGAGCGCCAGCTCGCGGCGGCCACCGCCAATGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGCCCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACTGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCCGCCCTTCGGAGGCCAACGCCGGGGCACTGGGc > 2:124559/1‑150 (MQ=255) gcCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTGGGCACTGGGCCCGAGcc > 2:530436/1‑149 (MQ=255) gcCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTGGGCACTGGGCCCGAGCa < 2:631953/150‑1 (MQ=255) gcggcggcCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTGGGCACTGGGCCCGAGCATTACCTgg < 2:753013/150‑1 (MQ=255) cggcggcCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTGGGCACTGGGCCCGAGCATTACCTggg < 2:331219/150‑1 (MQ=255) ccacGCCAACGTTGGCGGTGGCCGCCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTGGGCACTGGGCCCGAGCATTACCTGggcg < 1:458997/143‑1 (MQ=255) ccacGCCAACGTTGGCGGTGGCCGCCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTGGGCACTGGGCCCGAGCATTACCTGggcg > 2:458997/4‑146 (MQ=255) cacGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTGGGCACTGGGCCCGAGCATTACCTGGGCGGCCTTc > 2:1244455/3‑150 (MQ=255) cGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGCCCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTGGGCACTGGGCCCGAGCATTACCTGGGCGGCCTTCGa < 2:232706/150‑1 (MQ=255) cAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTGGGCACTGGGCCCGAGCATTACCTGGGCGGCCTTCGACCt < 2:585367/150‑1 (MQ=255) cAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTGGGCACTGGGCCCGAGCATTACCTGGGCGGCCTTCGACCt > 1:505898/1‑150 (MQ=255) cAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTGGGCACTGGGCCCGAGCATTACCTGGGCGGCCTTCGACCt < 2:805018/150‑1 (MQ=255) | GACGCGCTCAGCGTAGACCTGTCGCCCAAGGCCCTGCCGGCCATCGCCAAGGCGCTGCCGGTCGGTGACCCGGGTGAGCTGCTGCGCCGCCGCCCGGACATCCGCAGCGCCGAGCGCCAGCTGGCGGCGGCCACCGCCAACGTTGGC‑GTGGCCACCGCCGACCTGTTCCCGCGCGTCAGCCTCAGTGGCTTCCTCGGCTTTACCGCCGCCCGCGGCTCGCAGATCGGCTCTTCGGCGGCCAACGCCTGGGCACTGGGCCCGAGCATTACCTGGGCGGCCTTCGACCT > NC_002947/3882145‑3882431 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |