| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 914,647:1 | +C | 5.3% | coding (1355/1743 nt) | fruA → | PTS fructose transporter subunit IIBC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 914,647 | 1 | . | C | 5.3% | 315.2 / 9.9 | 76 | coding (1355/1743 nt) | fruA | PTS fructose transporter subunit IIBC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (38/34); new base C (2/2); total (40/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.10e-01 | |||||||||||
GCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAGGACCC > NC_002947/914502‑914788 | gCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑gccg > 2:585559/1‑150 (MQ=255) cATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑gccgcc > 1:224701/1‑150 (MQ=255) tCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGCCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGa < 1:497420/150‑1 (MQ=255) ctgctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGAtt < 2:830839/150‑1 (MQ=255) ctgctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑AATGGT‑GCCGCCGAtt < 2:928794/150‑1 (MQ=255) ctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGGCGACCTTGGCGGGCCGATCAAAAAGGCCGCCTATGCGTTCTTGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGc < 1:528966/150‑1 (MQ=255) ggggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGGTGCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCtt > 1:797425/1‑150 (MQ=255) ggggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCtt < 1:779934/150‑1 (MQ=255) ttGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑gccgc < 2:582727/133‑1 (MQ=255) ttGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑gccgc > 1:582727/1‑133 (MQ=255) tGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTg < 1:638309/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGc < 1:704028/150‑1 (MQ=255) tGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCGTGGGTATTGccc > 2:957455/1‑149 (MQ=255) ggcATGATGTGCGTGGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCGGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTc < 2:1163414/150‑1 (MQ=255) gCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGG‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGgc < 2:389520/150‑1 (MQ=255) aCCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGt > 2:984165/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGtt > 1:1399090/1‑150 (MQ=255) cTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTgg > 2:212809/1‑136 (MQ=255) cTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTgg < 1:212809/136‑1 (MQ=255) ttGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCg > 1:1101218/1‑150 (MQ=255) ggCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGcc > 2:1112275/1‑150 (MQ=255) ggCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGcc > 2:1112278/1‑150 (MQ=255) gggCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTTGTGCAGCGACACGCCAAT‑GGCTTCTACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCag > 1:387448/1‑150 (MQ=255) ccGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagc > 1:1411853/1‑150 (MQ=255) gATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGGTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCaga > 1:1152292/1‑146 (MQ=255) gATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCaga < 2:1152292/146‑1 (MQ=255) gATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcga > 2:1117191/1‑150 (MQ=255) gATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcga > 2:854449/1‑150 (MQ=255) tCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCAGCCTTCCTTGCCCGGCGCAAATTCGCCCAgatcgatc > 1:74576/1‑148 (MQ=255) acaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGGTGGCTTCGTCGAGCTACTCGCCAAT‑GGGGGCGACCATTGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTGGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGGTCGCCCAGAGCGAGcgcg > 1:636521/1‑150 (MQ=255) acaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGcgcg > 1:1116483/1‑150 (MQ=255) cacggCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGTGCTAGGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGAGTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGa < 2:57630/147‑1 (MQ=255) ccgccTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCgg < 1:1228573/150‑1 (MQ=255) ccgccTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCAAGCCGGCAGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCgg < 1:88586/150‑1 (MQ=255) cgccTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCggg < 2:1116483/150‑1 (MQ=255) gccTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGc > 2:500736/1‑150 (MQ=255) cTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCaa > 2:782368/1‑150 (MQ=255) tATGCGTTCTCGGTGGTGCTGGTGGCCTCATCGAGCTACGCGCCTAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAg > 2:274044/1‑150 (MQ=255) tATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAg < 2:797425/150‑1 (MQ=255) aTGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAgg > 2:572764/1‑150 (MQ=255) cGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGCTTGGAGAGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAggcgg > 1:798959/1‑150 (MQ=255) cGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTgg < 2:998412/87‑1 (MQ=255) cGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTgg > 1:998412/1‑87 (MQ=255) nttCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGAACATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCCAggcggc > 2:947364/2‑150 (MQ=255) tcGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCggcgctg < 2:1101218/150‑1 (MQ=255) ctgctgGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCTGCGCTGGCGCTgggg < 2:387448/150‑1 (MQ=255) ctgctgGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTgggg > 2:379532/1‑150 (MQ=255) tgGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCtgt > 1:1103320/1‑150 (MQ=255) gCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGc < 1:500736/150‑1 (MQ=255) gCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGc > 2:616768/1‑150 (MQ=255) gCCGCGTCGATCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGc > 2:1124510/1‑150 (MQ=255) ccTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTAtt < 1:744776/71‑1 (MQ=255) ccTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTAtt > 2:744776/1‑71 (MQ=255) tcgtcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTc > 1:1271894/1‑150 (MQ=255) tcgtcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCAGGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTc < 1:605278/150‑1 (MQ=255) gtcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAgcgc < 1:195318/109‑1 (MQ=255) gtcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAgcgc > 2:195318/1‑109 (MQ=255) gtcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCAt > 1:1250861/1‑150 (MQ=255) tcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCAtc < 1:572764/150‑1 (MQ=255) tcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCAGCTGGAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCAtc > 1:88114/1‑150 (MQ=255) gAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGcc > 1:662300/1‑67 (MQ=255) gAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGcc < 2:662300/67‑1 (MQ=255) cTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGa < 1:1345029/150‑1 (MQ=255) cTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGa < 2:1103320/150‑1 (MQ=255) caagcCAATCGGCGGC‑ACCAT‑GCCGGCGGCCATGGTCGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAgg > 2:1074981/4‑150 (MQ=37) aatcggcggc‑ACCATGCCGGCGGC‑CATGGTCGCCGCC‑ATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTc > 1:559871/5‑133 (MQ=25) aatcggcggc‑ACCATGCCGGCGGC‑CATGGTCGCCGCC‑ATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTc < 2:559871/129‑1 (MQ=25) aT‑GCCGGCGGCCATGGTCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCgg > 2:1156065/1‑100 (MQ=255) aagccggcggCCATGGTCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCgg < 1:1156065/96‑1 (MQ=255) cggcgACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGGGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGt < 1:1112278/150‑1 (MQ=255) cggcgACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGt < 1:1112275/150‑1 (MQ=255) cATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGa > 2:891665/1‑129 (MQ=255) cATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGa < 1:891665/129‑1 (MQ=255) ggCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCaa < 1:782368/150‑1 (MQ=255) gcggccATGGTCGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAGGa < 1:1074981/145‑1 (MQ=255) ccgG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAgg > 1:1297413/1‑123 (MQ=255) ccgG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAgg < 2:1297413/123‑1 (MQ=255) cgG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAGGAccc > 2:324958/1‑150 (MQ=255) tGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAggg < 1:363368/118‑1 (MQ=255) tGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAggg > 2:363368/1‑118 (MQ=255) | GCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAGGACCC > NC_002947/914502‑914788 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |