New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 359677 = | 69 (1.310) | 10 (0.200) | 9/232 | NT | 13.7% | intergenic (+34/+86) | gbdR/PP_0299 | AraC family transcriptional regulator/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 359721 = | 61 (1.230) | intergenic (+78/+42) | gbdR/PP_0299 | AraC family transcriptional regulator/hypothetical protein |
AGGTGGCCATGATGCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGC > NC_002947/359531‑359816 | agGTGGCCATGATGCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCca > 2:237952/1‑150 (MQ=255) tGGCCATGATGCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAg < 1:353026/150‑1 (MQ=255) ggCCATGATGCCGATCCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg < 2:523319/150‑1 (MQ=255) atgatgCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCAc < 1:395620/150‑1 (MQ=255) gatgCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCAccc > 2:293687/1‑150 (MQ=255) atgCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCg > 2:174796/1‑150 (MQ=255) gCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCt < 1:237952/150‑1 (MQ=255) caccggcagtgcgacgatcctgccggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgctCCCACAGGTCACCCGCt < 1:531926‑M1/17‑1 (MQ=255) ttCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCt < 1:988955/150‑1 (MQ=255) aGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGc‑c > 2:378948/1‑150 (MQ=255) tcctgccggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGATCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGt > 2:438313‑M1/117‑150 (MQ=255) gACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCtt < 2:284882/138‑1 (MQ=255) gACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCtt > 1:284882/1‑138 (MQ=255) ctgccggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGa < 2:573786‑M1/36‑1 (MQ=255) cccTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGAt < 1:1273244/150‑1 (MQ=255) ccTGTCGCCGCAAAGAGTACTGTTGGCGGCACTGAGATGGGCGTCCAACGATTCGACAGCCGCCAGTGTAACTCGCGGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATc > 2:727971/1‑150 (MQ=19) tGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCtg > 2:565736/1‑150 (MQ=255) ggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgctCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCtgt > 2:531926‑M1/110‑150 (MQ=255) cagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTgg > 1:573786‑M1/108‑150 (MQ=255) gccgcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCAc < 2:718298/118‑1 (MQ=255) gccgcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCAc > 1:718298/1‑118 (MQ=255) gccgcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGATCA‑CCGCTG‑GCTCAAGCTCAGCGGGTGACCTGTggg < 1:995258/150‑1 (MQ=25) gcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGgggc < 1:907075/150‑1 (MQ=255) gggCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTg < 1:378948/150‑1 (MQ=255) ggCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGt > 2:345450/1‑150 (MQ=255) aTGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCGCAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCcgc < 2:924460/150‑1 (MQ=255) aTGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCcgc < 1:418554/150‑1 (MQ=255) gcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCtgt > 2:5994‑M1/86‑126 (MQ=255) gcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCtgt < 1:5994‑M1/41‑1 (MQ=255) ccTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTc > 2:697550/1‑92 (MQ=255) ccTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTc < 1:697550/92‑1 (MQ=255) ccTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGc < 1:719082/150‑1 (MQ=255) aacttctgccagcgttggcgcagttcaacaaccgcgcgtaatccatttcccaaggaccggcctcttcgcgggcacgcccgctCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGc > 2:690683‑M1/83‑150 (MQ=255) tGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGATCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCg < 2:387847/150‑1 (MQ=255) tGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGATCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCg > 1:387847/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCt < 1:293687/150‑1 (MQ=255) aGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGa < 2:527146/99‑1 (MQ=255) aGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGa > 1:527146/1‑99 (MQ=255) ggCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTgg < 1:535057/150‑1 (MQ=255) gcAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTaaa > 2:687324/1‑150 (MQ=255) cAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAAt > 2:863869/1‑150 (MQ=255) cAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCACTGACACCGCGACGGCCGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGATGAGCTTGAGC‑AAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGTGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAAt > 2:190849/1‑150 (MQ=255) tGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAg < 1:84039/71‑1 (MQ=255) tGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAg > 2:84039/1‑71 (MQ=255) ggAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGa < 1:857219/149‑1 (MQ=255) tCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGc > 1:824038/1‑128 (MQ=255) tCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGc < 2:824038/128‑1 (MQ=255) tCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTAc > 1:843351/1‑150 (MQ=255) aCATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTAcgcg > 2:711856/1‑150 (MQ=255) cATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTAcgcgc > 1:256487/1‑150 (MQ=255) ccAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTttgt > 2:1035750/1‑150 (MQ=255) cAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTttgtt < 2:1244857/150‑1 (MQ=255) tAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCAGGGGGGGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACt < 1:727971/150‑1 (MQ=39) ccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGa < 1:1186582‑M1/36‑1 (MQ=255) ccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGa > 2:1186582‑M1/42‑77 (MQ=255) ctctGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGcc > 2:1088954/1‑150 (MQ=255) tctGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCtt > 2:165378/1‑91 (MQ=255) tctGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCtt < 1:165378/91‑1 (MQ=255) tctGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCa > 1:1244493/1‑150 (MQ=255) gACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGAt > 2:1251193/1‑122 (MQ=255) gACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGAt < 1:1251193/122‑1 (MQ=255) acacCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTAc > 2:109569/1‑124 (MQ=255) acacCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTAc < 1:109569/124‑1 (MQ=255) acacCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGc < 1:687324/150‑1 (MQ=255) acCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTc > 1:785671/1‑89 (MQ=255) acCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTc < 2:785671/89‑1 (MQ=255) acCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTgg > 2:650490/1‑109 (MQ=255) acCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTgg < 1:650490/109‑1 (MQ=255) acCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTg < 1:174796/150‑1 (MQ=255) acCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTg < 1:1035750/150‑1 (MQ=255) acCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTg < 1:362778/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTgg > 1:283800/1‑150 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGc < 1:280080/139‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGc > 2:280080/1‑139 (MQ=255) ctctTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGc < 1:565736/150‑1 (MQ=255) ccctTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGgggcgg > 1:474447/3‑70 (MQ=255) ccctTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGgggcgg < 2:474447/68‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACTCTGGCAACAGTTGCTTg > 2:17916/1‑150 (MQ=255) ggCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATg < 1:1010836/150‑1 (MQ=255) cACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGc > 2:605590/1‑150 (MQ=255) cGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGgggcgggc > 1:1188991/1‑55 (MQ=255) cGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGgggcgggc < 2:1188991/55‑1 (MQ=255) gCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACt < 1:139740/109‑1 (MQ=255) gCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACt > 2:139740/1‑109 (MQ=255) tCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTttgt > 1:1134068/1‑101 (MQ=255) tCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTttgt < 2:1134068/101‑1 (MQ=255) | AGGTGGCCATGATGCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGC > NC_002947/359531‑359816 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |