New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1102893 | 52 (0.990) | 6 (0.120) | 5/230 | NT | 10.9% | intergenic (+27/‑91) | ttg2E/ttg2F | toluene‑tolerance protein/BolA family protein |
? | NC_002947 | = 1102923 | 49 (1.000) | intergenic (+57/‑61) | ttg2E/ttg2F | toluene‑tolerance protein/BolA family protein |
CTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCG > NC_002947/1102744‑1103041 | cTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCG < 2:838976‑M1/150‑1 (MQ=255) tgctgGCTTACAGTCGGGAAGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCa < 2:1371849/150‑1 (MQ=255) tgctgGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTTGGTCa > 2:1320120/1‑150 (MQ=255) tgctgGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCa < 1:456255/150‑1 (MQ=255) ctgGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGc < 1:339637/150‑1 (MQ=255) gCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGaa < 2:193030/150‑1 (MQ=255) tACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGcc > 2:258820/1‑150 (MQ=255) cGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGtt < 2:393051/150‑1 (MQ=255) cGGGATGCTCACGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGCCATGCCTGATGATTTGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGTTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGtt < 1:710571/150‑1 (MQ=255) gATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTg < 2:1295132/148‑1 (MQ=255) gATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTg > 1:1295132/1‑148 (MQ=255) cACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccg > 2:509697‑M1/1‑118 (MQ=255) cACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGaa < 1:569702/127‑1 (MQ=255) cACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGaa > 2:569702/1‑127 (MQ=255) aCTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCCAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCGCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGcga > 2:656047‑M2/1‑147 (MQ=255) cTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgag < 2:713405‑M1/150‑35 (MQ=255) cTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgag < 1:689101‑M1/150‑35 (MQ=255) tGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGGAGCCGTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTACATGATGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGcgagg > 1:1022769‑M2/1‑145 (MQ=255) tGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgagg < 1:509697‑M1/150‑36 (MQ=255) tGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGcgagg < 1:35444‑M2/150‑6 (MQ=255) gCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGcgagggg > 1:1407830‑M2/1‑143 (MQ=255) aaGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgagggg > 1:935079‑M1/1‑111 (MQ=255) aaGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCt > 1:914383/1‑150 (MQ=255) aaGGCGTGCGAGGTGCGCGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgagggg < 2:935079‑M1/148‑38 (MQ=255) gTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCtttttt < 1:703870/150‑1 (MQ=255) gTGCGAGGTGCGCGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAGTTGCCGAGGTCTATTATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGCCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCtttttt < 1:172671/150‑1 (MQ=255) cGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTa < 1:358669/150‑1 (MQ=255) ggTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTatga < 1:762479/150‑1 (MQ=255) gTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTatgat > 2:1138790/1‑150 (MQ=255) gTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTatgat < 1:1138790/150‑1 (MQ=255) gcattgcTGAAGATATTGGGGAAAATGCCGGTGTTCTTGATCTCGGTGAAGGGCCGGCAAGCTAGTGGGCAGGCAAGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGAc < 1:1320120/144‑1 (MQ=255) gCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAg < 1:740717/121‑1 (MQ=255) gCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAg > 2:740717/1‑121 (MQ=255) tgatgaTATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAGGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTgcg > 1:987139/1‑150 (MQ=255) atgatATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCa < 2:914383/150‑1 (MQ=255) atGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCCAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCggg < 2:1029319/150‑1 (MQ=255) tGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTgc > 1:600939/1‑141 (MQ=255) tGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTgc < 2:600939/141‑1 (MQ=255) tGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGgc < 1:1074187/150‑1 (MQ=255) cGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGgcgc > 2:605026/1‑150 (MQ=255) gggAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTa > 2:534149/1‑121 (MQ=255) gggAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTa < 1:534149/121‑1 (MQ=255) gggAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGcc > 2:82935/1‑150 (MQ=255) gggAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGcc > 2:1199159/1‑150 (MQ=255) ggAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGcgagg < 1:624135‑M2/108‑6 (MQ=255) ggAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGcgagg > 2:624135‑M2/1‑103 (MQ=255) tGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAGGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAg < 2:987139/150‑1 (MQ=255) cgcggccTATGATCTCGAGGAAGGGCTGGCGAGCTAGTGGCCAGGCAGAGATGATATCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGGTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGtt > 2:764698/7‑150 (MQ=255) cGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGtt > 2:535474/1‑150 (MQ=255) aGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGa < 1:278679/150‑1 (MQ=255) tATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATg > 2:694153/1‑150 (MQ=255) tATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATg > 2:1091827/1‑150 (MQ=255) cGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGt < 2:1082419/150‑1 (MQ=255) tGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGa > 1:1352302/1‑150 (MQ=255) ggCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGATGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAg > 1:939592/1‑150 (MQ=255) tAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCtt < 1:535474/150‑1 (MQ=255) ggCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAag < 1:1091827/150‑1 (MQ=255) ccAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGa < 2:561014/146‑1 (MQ=255) ccAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGa > 1:561014/1‑146 (MQ=255) cAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAgaga < 2:1304765/150‑1 (MQ=255) gtaCGGTTGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTAGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAAt > 2:766134/3‑150 (MQ=255) gCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTgc > 1:1057252/1‑84 (MQ=255) gCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTgc < 2:1057252/84‑1 (MQ=255) ggATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGcc < 1:258820/150‑1 (MQ=255) ggATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGCCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGcc > 1:604367/1‑150 (MQ=255) gatgatGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCg < 1:82935/150‑1 (MQ=255) ccccTCGcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgaggggccatcatccgtgcctggccactagcttgccagcacttcatcgagatcatagacctcggcaatttcccgcatatcatcaggcatgccacgcacctcgcacgccttgc > 1:1407830‑M1/1‑7 (MQ=255) ccccTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGcgaggggccatcatccgtgcctggccactagcttgccagcacttcatcgagatcatagacctcggcaatttcccgcatatcatcaggcatgccgcgcacctcgcacgcctt < 2:935079‑M2/148‑112 (MQ=255) ccccTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGcgaggggccatcatccgtgcctggccactagcttgccagcacttcatcgagatcatagacctcggcaatttcccgcatatcatcaggcatgccacgcacctcgcacgcctt > 1:935079‑M2/1‑37 (MQ=255) cccTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCgg > 1:907400/1‑150 (MQ=255) cccTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCgg > 1:270362/1‑150 (MQ=255) ccTCGcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgaggggccatcatccgtgcctggccactagcttgccagcacttcatcgagatcatagacctcggcaatttcccgcatatcatcaggcatgccacgcacctcgcacgccttgcca < 1:35444‑M1/150‑146 (MQ=255) ccTCGcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgaggggccatcatccgtgcctggccactagcttgccagcacttcatcgagatcatagacctcggcaatttcc < 1:624135‑M1/108‑104 (MQ=255) ccTCGcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgaggggccatcatccgtgcctggccactagcttgccagcacttcatcgagatcatagacctcggcaatttcc > 2:624135‑M1/1‑5 (MQ=255) ccTCGcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgaggggccatcatccgtgcctggccactagcttgccagcacatcatgtagatcatagacctcggcaatttcccgcatatcatcacggctcccacgcacctcgcacgccttgcca > 1:1022769‑M1/1‑5 (MQ=255) ccTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGcgaggggccatcatccgtgcctggccactagcttgccagcacttcatcgagatcatagacctcggcaatttcccgcatatcatcaggcatgccacgcacctcgcacgccttgcca < 1:509697‑M2/150‑116 (MQ=255) cTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGcgaggggccatcatccgtgcctggccactagcttgccagcacttcatcgagatcatagacctcggcaatttcccgcatatcatcaggcatgccacgcacctcgcacgccttgccag < 2:713405‑M2/150‑117 (MQ=255) cTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGcgaggggccatcatccgtgcctggccactagcttgccagcacttcatcgagatcatagacctcggcaatttcccgcatatcatcaggcatgccacgcacctcgcacgccttgccag < 1:689101‑M2/150‑117 (MQ=255) tCGcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgaggcgccatcatccgtgcctggccactagctggccagcacttcatcgagatcatagacctcggcaatttcccgcatatcatcaggcatgccacgcacctcgcacgccttgccagt > 2:656047‑M1/1‑3 (MQ=255) tCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTc < 2:35444/150‑1 (MQ=255) cGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGcgaggggccatcatccgtgcctggccactagcttgccagcacttcatcgagatcatagacctcggcaatttcccgcatatcatcaggcatgccacgcacctcgcacgccttgccagtg > 2:509697‑M2/1‑32 (MQ=255) | CTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATGGCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCG > NC_002947/1102744‑1103041 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |