| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1780127 | 31 (0.590) | 10 (0.230) | 10/208 | NT | 25.9% | intergenic (+44/+62) | PP_1587/dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase |
| ? | NC_002947 | = 1780151 | 31 (0.700) | intergenic (+68/+38) | PP_1587/dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase | |||||
GTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCG > NC_002947/1779984‑1780276 | gTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTActgcgct < 1:1295368/150‑1 (MQ=255) tACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTAct > 1:72302/1‑144 (MQ=255) tACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTAct < 2:72302/144‑1 (MQ=255) aaCCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACtgcgctgcgc > 2:942379/1‑150 (MQ=255) aaCCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACagcgctgatt > 2:597744‑M1/1‑140 (MQ=255) gCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGGGGTTAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGaa < 1:799729/150‑1 (MQ=255) tCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGAGAAAGGTGAAAATGAGTGAGGCGAACCGGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATc > 1:1106445/1‑150 (MQ=255) cgggtgccgggcgcgtgcgcatggcactggttgcaccgctggccgaatgcatcgaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaacCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATc > 2:290300‑M1/101‑150 (MQ=255) cAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAgcg > 1:631304/1‑150 (MQ=255) gCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACagcgctgatttcaagcgcagcgca < 2:35908‑M1/150‑25 (MQ=255) cACCTGGTGGGGGAGGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGCGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACagcgctgatttcaagcgcagcgcag < 1:596990‑M1/150‑26 (MQ=255) gggcgcgtgcgcatggcactggttgcaccgctggccgaatgcatcgaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaacCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGt > 2:33105‑M1/93‑150 (MQ=255) aCCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTgt > 2:203074‑M2/1‑148 (MQ=255) aCCTGGTGGGGGATGAGGTGGCGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACagcgctgatttcaagcgcagcgcagt > 1:1337965‑M1/1‑124 (MQ=255) ccTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACagcgctgatttcaagcgcagcgcagta < 2:1337965‑M1/150‑28 (MQ=255) tggGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACagcgctgatttcaagcgcagcgcagtacctgt < 2:152164‑M1/150‑33 (MQ=255) ggggATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACagcgctgatttcaagcgcagcgcagtacctgtgg < 1:280537‑M1/150‑35 (MQ=255) ggggATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTgtacctgtgg > 2:282760‑M2/1‑140 (MQ=255) catggcactggttgcaccgctggccgaatgcatcgaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaacCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGa > 1:876192‑M1/82‑149 (MQ=255) catggcactggttgcaccgctggccgaatgcatcgaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaacCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGa < 2:876192‑M1/68‑1 (MQ=255) aGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACagcgctgatttcaagcgcagcgcagtacctgtgggagcggg < 1:597744‑M1/150‑42 (MQ=255) gtggtgCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTgtacctgtgggagcgggcg < 2:1033999‑M2/150‑20 (MQ=255) gtggtgCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTgtacctgtgggagcgggcg < 2:369780‑M2/150‑20 (MQ=255) gtgCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGc > 1:635171/1‑150 (MQ=255) gCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTgtacctgtgg < 2:525005‑M2/133‑11 (MQ=255) gCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTgtacctgtgg > 1:525005‑M2/1‑123 (MQ=255) aaGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaa > 1:1059106/1‑150 (MQ=255) ggTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAgggcatga > 1:82129/1‑145 (MQ=255) gTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGaaa > 1:652255/1‑104 (MQ=255) gTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGaaa < 2:652255/104‑1 (MQ=255) gaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaacCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGa < 2:890418‑M1/68‑1 (MQ=255) gaagcggcggagcgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaacCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGa > 1:890418‑M1/48‑115 (MQ=255) atatGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGttt < 1:369780/150‑1 (MQ=255) gagtgagGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCa < 1:968289/150‑1 (MQ=255) gCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGgc > 2:483439/1‑150 (MQ=255) cgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaacCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCt > 1:804419‑M1/36‑97 (MQ=255) cgcattcgcgccttcctgcaaaaccgctgatcaacCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCt < 2:804419‑M1/62‑1 (MQ=255) gAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGgcgc < 1:472754/150‑1 (MQ=255) cgccttcctgcaaaaccgctgatcaacCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGt < 1:501774‑M1/58‑1 (MQ=255) cgccttcctgcaaaaccgctgatcaacCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGt > 2:501774‑M1/28‑85 (MQ=255) gTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACagcgctgatttcaagcgcagcgcagtac > 1:932822‑M1/1‑53 (MQ=255) gTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACagcgctgatttcaagcgcagcgcagtac < 2:932822‑M1/81‑29 (MQ=255) tCAAGTAGACCCTATCAAGTCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTccgcc > 2:1090777/1‑150 (MQ=255) tCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGt < 2:20046/110‑1 (MQ=255) tCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGt > 1:20046/1‑110 (MQ=255) gACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGa > 1:240986/1‑106 (MQ=255) gACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGa < 2:240986/106‑1 (MQ=255) aCCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGACGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGAt > 2:117637/1‑150 (MQ=255) gctgatcaacCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCt < 1:552993‑M1/62‑1 (MQ=255) gctgatcaacCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCt > 2:552993‑M1/11‑72 (MQ=255) ccTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAg < 2:1011235/96‑1 (MQ=255) ccTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAg > 1:1011235/1‑96 (MQ=255) cAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCg < 1:1090777/150‑1 (MQ=255) aaGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCgg > 2:694602/1‑150 (MQ=255) aaccccttcGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTgt > 2:395502‑M2/4‑59 (MQ=255) aaccccttcGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTgt < 1:395502‑M2/58‑3 (MQ=255) CTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCg > 1:483439‑M1/1‑150 (MQ=255) TTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGGCGGGGAAGGGGTTGATACGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCgg < 2:338410‑M1/150‑1 (MQ=255) TCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGcggg < 2:856737‑M1/150‑2 (MQ=255) cgcCCGCTCCCACAGGTACagcgctgatttcaagcgcagcgcagtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgccgcaccac < 2:1033999‑M1/150‑132 (MQ=255) cgcCCGCTCCCACAGGTACagcgctgatttcaagcgcagcgcagtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgccgcaccac < 2:369780‑M1/150‑132 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCt < 2:184594/41‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCt > 1:184594/1‑41 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgccgcaccacct < 1:597744‑M2/150‑110 (MQ=255) ccACAGGTACagcgctgatttcaagcgcagcgcagtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgccgcaccacctcatcccc > 2:282760‑M1/1‑10 (MQ=255) ccACAGGTACagcgctgatttcaagcgcagcgcagtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgc < 2:525005‑M1/133‑124 (MQ=255) ccACAGGTACagcgctgatttcaagcgcagcgcagtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgc > 1:525005‑M1/1‑10 (MQ=255) ccACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgccgcaccacctcatcccc < 1:280537‑M2/150‑117 (MQ=255) ccACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATgcgc > 2:1427008/1‑150 (MQ=255) cacaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCa < 1:694602/150‑1 (MQ=255) acaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgccgcaccacctcatccccca < 2:152164‑M2/150‑119 (MQ=255) acaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAc < 2:1189253/150‑1 (MQ=255) acaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAc > 1:1189253/1‑150 (MQ=255) acaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAc > 1:864778/1‑150 (MQ=255) gTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgac < 2:932822‑M2/81‑54 (MQ=255) gTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgac > 1:932822‑M2/1‑28 (MQ=255) gTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCa > 2:479983/1‑113 (MQ=255) gTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCa < 1:479983/113‑1 (MQ=255) tACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgccgcaccacctcatcccccaccagg < 2:1337965‑M2/150‑124 (MQ=255) aCagcgctgatttcaagcgcagcgcagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggtt < 1:395502‑M1/61‑60 (MQ=255) aCagcgctgatttcaagcgcagcgcagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggtt > 2:395502‑M1/1‑2 (MQ=255) aCagcgctgatttcaagcgcagcgcagtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgccgcaccacctcatcccccaccaggt > 2:203074‑M1/1‑2 (MQ=255) aCTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgccgcgccacctcatcccccaccaggt > 1:1337965‑M2/1‑26 (MQ=255) ctgcgctgcgCTTGAAATCAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcgctcatatccagctcacccagtacttgccgcaccacctcctcccccaccaggtg < 1:596990‑M2/150‑126 (MQ=255) | GTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCG > NC_002947/1779984‑1780276 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |