| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1919930 = | 48 (0.910) | 3 (0.060) | 3/232 | NT | 6.1% | coding (569/2115 nt) | prc | tail‑specific protease Prc |
| ? | NC_002947 | 1919965 = | 47 (0.950) | coding (534/2115 nt) | prc | tail‑specific protease Prc | |||||
TGGTGTGTGGGTCGTAGGACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTCAGCTCGGCCAGG > NC_002947/1919781‑1920079 | acctcgaccgcgtcaagcaacgcctggacttcgccctggccgagctgaacaagggtgtggacaagattgacttcaccaccaaggaaaccttgctgatcgaccgcaaggacgcgccgtggatgaagaaccaggccgagctcgacgacttgt > 2:553472‑M1/150‑150 (MQ=255) cctcgaccgcgtcaagcaacgcctggacttcgccctggccgagctgaacaagggtgtggacaagattgacttcaccaccaaggaaaccttgctgatcgaccgcaaggacgcgccgtggatgaagaaccaggccgagctcgacgacttgtg < 1:1117226‑M1/2‑1 (MQ=255) tcgaccgcgtcaagcaacgcctggacttcgccctggccgagctgaacaagggtgtggacaagattgacttcaccaccaaggaaaccttgctgatcgaccgcaaggacgcgccgtggatgaagaaccaggccgagctcgacgacttgTGgc > 2:301130‑M1/147‑150 (MQ=255) gtcaagcaacgcctggacttcgccctggccgagctgaacaagggtgtggacaagattgacttcaccaccaaggaaaccttgctgatcgaccgcaaggacgcgccgtggatgaagaaccaggccgagctcgacgacttgTGGCGCAGCACt > 1:857018‑M1/139‑150 (MQ=255) aGGACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGt < 2:1003574/150‑1 (MQ=255) tGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTg > 1:220913/1‑150 (MQ=255) ggCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGAtcttct < 1:1321635/128‑1 (MQ=255) ggCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGAtcttct > 2:1321635/1‑128 (MQ=255) aaaGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGAcgcg > 1:1280161/1‑150 (MQ=255) aaGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGt > 1:937766/1‑150 (MQ=255) tgtTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTgc < 1:149485/150‑1 (MQ=255) gtTGATCTAGGCCTGGAAGATGTCCTTGACACGGGTCTGGTGCAGGCGCGTGAGCTGGGTCTTGTAGAGCTTGATCCGGGTTTCATGGATTTACTTGGGTTCCTTGCAGAAGGTCTTCTAGCGCACCAATTAGTCTTTGCAGCGtttaag > 2:587740/1‑147 (MQ=255) ggccgagctgaacaagggtgtggacaagattgacttcaccaccaaggaaaccttgctgatcgaccgcaaggacgcgccgtggatgaagaaccaggccgagctcgacgacttgTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACaa > 2:1117226‑M1/113‑150 (MQ=255) gTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACaa < 2:1066661/150‑1 (MQ=255) tAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGCCCAACGGCAGTGAGTACTACCTGGTGTCGCTTGATCAGGGGAGCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATGTTCTGGCGCAGTATTTCGTGTTTGACGCGTTTGCGCCACAAg > 1:603067/1‑150 (MQ=255) ggAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGa < 1:1089577/150‑1 (MQ=255) tCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGcc > 1:290817/1‑150 (MQ=255) gacaagattgacttcaccaccaaggaaaccttgctgatcgaccgcaaggacgcgccgtggatgaagaaccaggccgagctcgacgacttgTGgcg > 2:1288306‑M1/91‑95 (MQ=255) gacaagattgacttcaccaccaaggaaaccttgctgatcgaccgcaaggacgcgccgtggatgaagaaccaggccgagctcgacgacttgTGgcg < 1:1288306‑M1/5‑1 (MQ=255) gacaagattgacttcaccaccaaggaaaccttgctgatcgaccgcaaggacgcgccgtggatgaagaaccaggccgagctcgacgacttgTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGttc > 1:990580‑M1/91‑150 (MQ=255) gacaagattgacttcaccaccaaggaaaccttgctgatcgaccgcaaggacgcgccgtggatgaagaaccaggccgagctcgacgacttgTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGttc < 2:990580‑M1/60‑1 (MQ=255) gTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATc < 2:236584/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGgcgc < 1:945164/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGgcgc < 2:220913/150‑1 (MQ=255) gagTGAACTGGGTGTAGGAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCAGCTTGTTGTCGTTGCCAGCGATCTTCTGACGCAGTAGTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCGGGTGCTTCATCCTCTGCGCGACCt > 2:85711/3‑150 (MQ=255) aGCTGGTTCTTGTCGCGCTTGAGCAGTGTTTCCTGGAGCTGGTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCgg < 1:668709/150‑1 (MQ=255) cTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTc > 2:400039/1‑150 (MQ=255) ttCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATc > 2:1280231/1‑150 (MQ=255) ttGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGc > 2:920692/1‑150 (MQ=255) tAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACaa > 2:158497/1‑92 (MQ=255) tAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACaa < 1:158497/92‑1 (MQ=255) tAGCGCTTCATCAGGGTTTCCTGTATCTGCTTGGGTTGCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAg < 2:640558/150‑1 (MQ=255) ttGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTcc < 2:937766/150‑1 (MQ=255) tGATCAGGGTTTCCTTTATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAGGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCt < 2:1149526/150‑1 (MQ=255) cAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTtggt < 2:1296798/150‑1 (MQ=255) aGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTTCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTtggtg < 1:1003725/150‑1 (MQ=255) aGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTtggtg > 2:846118/1‑150 (MQ=255) gggTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTtggtgg > 2:971838/1‑150 (MQ=255) ttCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGaa < 1:1280231/150‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCaa > 2:1361856/1‑130 (MQ=255) ccTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTGCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCaa < 1:1361856/130‑1 (MQ=255) cTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTc > 1:1337480/1‑150 (MQ=255) tGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTtggt < 1:626304/140‑1 (MQ=255) tGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTtggt > 2:626304/1‑140 (MQ=255) ggATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCaa < 2:1337480/150‑1 (MQ=255) gtttGGGTTCCTTGCGGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGt < 1:85711/148‑1 (MQ=255) cTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTtgg < 1:402598/131‑1 (MQ=255) cTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTtgg > 2:402598/1‑131 (MQ=255) cTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTc > 2:522186/1‑150 (MQ=255) ttGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTcc > 2:1327998/1‑150 (MQ=255) gggTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCcac > 1:103146/1‑150 (MQ=255) gTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCacac < 1:1060318/150‑1 (MQ=255) ttGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGt > 2:844244/1‑113 (MQ=255) ttGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGt < 1:844244/113‑1 (MQ=255) ttGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTg < 2:290817/150‑1 (MQ=255) cGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTCa > 2:189952/1‑150 (MQ=255) gCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACACTTGTTCAGc < 1:1327998/150‑1 (MQ=255) cGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTCAGCt > 1:472637/1‑150 (MQ=255) aTCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTCAGCTCg < 1:971838/150‑1 (MQ=255) TGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTCAGCTCGGCCAgg > 1:920692‑M1/1‑150 (MQ=255) | TGGTGTGTGGGTCGTAGGACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCGAGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTCAGCTCGGCCAGG > NC_002947/1919781‑1920079 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |