| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2472183 | 18 (0.340) | 12 (0.340) | 8/168 | NT | 45.1% | intergenic (+44/+105) | PP_2166/PP_2167 | anti‑anti‑sigma factor/PhoD‑like phosphatase |
| ? | NC_002947 | = 2472229 | 17 (0.480) | intergenic (+90/+59) | PP_2166/PP_2167 | anti‑anti‑sigma factor/PhoD‑like phosphatase | |||||
TGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGC > NC_002947/2472034‑2472329 | aggtgttttttgatgaacaggggcggccggcgcgggtgtaccagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgaggttcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTac < 2:1308960‑M1/39‑1 (MQ=255) gtgCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacgacg < 2:266024/150‑1 (MQ=255) gcgcTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGACGGCCTCTTCACGGGTAAAACACCTCCTACGACgga > 2:585586/1‑149 (MQ=255) aGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGccc > 2:1117428/1‑150 (MQ=255) tGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAacac > 2:649414/1‑150 (MQ=255) ggCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAt < 2:1300643/150‑1 (MQ=255) gcgcACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGGGCTGGATCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCATCCTCTTCTCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgatcgggtggggatagacatt > 2:1170478‑M1/1‑125 (MQ=255) aaGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAt < 2:974933/143‑1 (MQ=255) aaGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAt > 1:974933/1‑143 (MQ=255) aGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCGGCGCGGGTAAACCCGCTCCTACtcctgattgggggtggacacacattggtgttt < 1:964267‑M1/150‑33 (MQ=255) gATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCa > 1:201466/1‑150 (MQ=255) aTCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCAc < 1:649414/150‑1 (MQ=255) gtgtaccagctggatactggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCAcc < 1:283692‑M1/74‑1 (MQ=255) ccTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATATATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCAccc < 2:45283/150‑1 (MQ=255) tCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCAccccc > 2:313912/1‑150 (MQ=255) tGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCaaa < 1:164980/126‑1 (MQ=255) tGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCaaa > 2:164980/1‑126 (MQ=255) gCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAg < 1:585586/150‑1 (MQ=255) cTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGgt < 2:1203351/150‑1 (MQ=255) gAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAtgtgt < 1:320806/130‑1 (MQ=255) gAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAtgtgt > 2:320806/1‑130 (MQ=255) aaTNACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTCGGCAAGTTGCGGGAGCGGAGCTGATCTCTTCCGATCTG‑TTGCGGCGTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTa < 1:957872/150‑1 (MQ=12) aTGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtag < 2:1282071‑M1/150‑51 (MQ=255) gcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGc > 2:283692‑M1/58‑150 (MQ=255) cTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagc > 1:808189‑M1/1‑96 (MQ=255) ccAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgg < 2:808189‑M1/150‑57 (MQ=255) ccAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgg < 1:1100177‑M1/150‑57 (MQ=255) ccAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgg > 1:1117428‑M2/1‑140 (MQ=255) ccAACCGCGAAGCCTTCCACGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATATC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTATgccgaactgggggtggatacccattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgg < 1:1170478‑M1/150‑57 (MQ=255) cAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcggg > 2:76665‑M2/1‑139 (MQ=255) aaCCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTACAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgg > 1:1093053‑M1/1‑92 (MQ=255) aaCCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTACAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgg < 2:1093053‑M1/148‑57 (MQ=255) gAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttaccc < 1:1286158‑M1/150‑65 (MQ=255) gAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttaccc > 2:201466‑M2/1‑132 (MQ=255) cTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaa > 1:1045548‑M2/1‑127 (MQ=255) ttCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTATGACGGCCTgcgc > 2:979101/1‑92 (MQ=255) ttCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTATGACGGCCTgcgc < 1:979101/92‑1 (MQ=255) agagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCg < 2:289902‑M1/94‑1 (MQ=255) agagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCg > 1:289902‑M1/42‑135 (MQ=255) ccATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCAAGAGC‑CGGTGCCGGCCTCTTCCCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGAGGCCAAACACCAAAGCGTGACCACCCCCAATCTGGTgtaggagcgggtttacccgcgaagag > 2:570986‑M2/1‑124 (MQ=255) tGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccg < 1:1030673‑M1/128‑66 (MQ=255) tGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccg > 2:1030673‑M1/1‑63 (MQ=255) ggagcTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtag > 1:901959‑M2/1‑98 (MQ=255) ggagcTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtag < 2:901959‑M2/102‑5 (MQ=255) aGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgta > 1:441066‑M1/1‑39 (MQ=255) aGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgta < 2:441066‑M1/88‑50 (MQ=255) gC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcag < 1:39174‑M1/78‑41 (MQ=255) gC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcag > 2:39174‑M1/1‑38 (MQ=255) GC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGccc < 2:1308891‑M1/150‑1 (MQ=255) c‑cTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgttt < 2:508262‑M1/69‑33 (MQ=255) c‑cTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgttt > 1:508262‑M1/1‑37 (MQ=255) CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCAc < 2:503419‑M1/135‑1 (MQ=255) CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCAc > 1:503419‑M1/1‑135 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttaccc > 1:1299451‑M2/1‑75 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttaccc < 2:1299451‑M2/93‑19 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaccagattgggggtggtcacgctttggtgtttggcctcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgggaagaggccggcaccggctcttgatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatgg > 2:570986‑M1/1‑26 (MQ=255) TCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTCCGCCCGGTTTTTAAActc < 2:181192‑M1/150‑1 (MQ=255) TCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAActc < 2:376092‑M1/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaag > 1:1045548‑M1/1‑23 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgca < 1:1030673‑M2/128‑64 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgca > 2:1030673‑M2/1‑65 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttc > 2:201466‑M1/1‑18 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggcc < 2:1299451‑M1/93‑76 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggcc > 1:1299451‑M1/1‑18 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttc < 1:1286158‑M2/150‑87 (MQ=255) cccGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggttg > 2:76665‑M1/1‑11 (MQ=255) ccGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggttgg > 1:1117428‑M1/1‑10 (MQ=255) ccGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctgtagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggtt > 1:1093053‑M2/1‑56 (MQ=255) ccGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctgtagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggtt < 2:1093053‑M2/148‑93 (MQ=255) ccGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggttgg < 1:1100177‑M2/150‑95 (MQ=255) ccGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggttgg < 2:808189‑M2/150‑95 (MQ=255) ccGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGGGTATCCACCCCCAGTTCGGCataggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggatatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcgtggaaggcttcgcggttgg < 1:1170478‑M2/150‑95 (MQ=255) gCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggttggag > 1:808189‑M2/1‑54 (MQ=255) cTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctcc > 1:901959‑M1/1‑4 (MQ=255) cTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctcc < 2:901959‑M1/102‑99 (MQ=255) cTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggttggagtcat < 2:1282071‑M2/150‑101 (MQ=255) CTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACGGGCTGTAAAAActct < 2:390034‑M1/100‑1 (MQ=255) CTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACGGGCTGTAAAAActct > 1:390034‑M1/1‑100 (MQ=255) CTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAGAAGAGCGTCGTGTCGGGACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGccatc < 2:398694‑M1/150‑3 (MQ=255) CTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAActct < 2:1099482‑M1/100‑1 (MQ=255) CTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAActct > 1:1099482‑M1/1‑100 (MQ=255) CTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTaaa > 2:1214869‑M1/1‑126 (MQ=255) CTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTaaa < 1:1214869‑M1/126‑1 (MQ=255) tACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggct > 1:441066‑M2/1‑49 (MQ=255) tACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggct < 2:441066‑M2/88‑40 (MQ=255) TACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAAc > 2:290886‑M1/1‑126 (MQ=255) TACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAAc < 1:290886‑M1/126‑1 (MQ=255) | TGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGC > NC_002947/2472034‑2472329 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |