New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2924275 = | 46 (0.880) | 3 (0.060) | 3/232 | NT | 6.0% | coding (1021/2772 nt) | PP_2563 | antibiotic biosynthesis protein |
? | NC_002947 | 2924307 = | 50 (1.010) | coding (989/2772 nt) | PP_2563 | antibiotic biosynthesis protein |
AACGGGTTGGCGATGAATTTGGCTTCGGTCAGCCCCGGGTCGTCCCAGTATCCCCGCGACAGGTAGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTCACATTGACGGCATTCGGTGCGATGGCGCGGACCTGCTGA > NC_002947/2924127‑2924411 | aaCGGGTTGGCGATGAATTTGGCTTCGGTCAGCCCCGGGTCGTCCCAGTATCCCCGCGACAGGTAGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCa < 2:1244404/150‑1 (MQ=255) cGGGTTGGCGATGAATTTGGCTTCGGTCAGCCCCGGGTCGTCCCAGTATCCCCGCGACAGGTAGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAAt < 2:696311/150‑1 (MQ=255) cctgttctgggggggcgatgcactcagcccgacacagtatcagcaggtccgcgccatcgcaccgaatgccgtcaatgtgaacttctacggcaccaccgaaaccccacaggccatggctttccataccctcgacccggaaatggaCAATGc < 2:1256930‑M1/6‑1 (MQ=255) gCGATGAATTTGGCTTCGGTCAGCCCCGGGTCGTCCCAGTATCCCCGCGACAGGTAGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑Tg < 2:52937/150‑1 (MQ=255) gATGAATTTGGCTTCGGTCAGCCCCGGGTCGTCCCAGTATCCCCGCGACAGGTAGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGcc < 1:366618/150‑1 (MQ=255) tGGCTTCGGTCAGCCCCGGGTCGTCCCAGTATCCCCGCGACAGGTAGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCa < 2:527402/150‑1 (MQ=255) ttCGGTCAGCCCCGGGTCGTCCCAGTATCCCCGCGACAGGTAGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCg > 2:615572/1‑150 (MQ=255) ttCGGTCAGCCCCGGGTCGTCCCAGTATAACAGCGACAGGGAGGTGTTGCGGAGCAGGATTTCGCCTTTCGCGCCCTCCCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGTGGACCCg > 1:811379/1‑150 (MQ=255) gtcCCAGTATCCCCGCGACAGGTAGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCgg < 1:615572/150‑1 (MQ=255) agcaggtccgcgccatcgcaccgaatgccgtcaatgtgaacttctacggcaccaccgaaaccccacaggccatggctttccataccctcgacccggaaatggaCAATGCCtt < 2:874217‑M1/9‑1 (MQ=255) agcaggtccgcgccatcgcaccgaatgccgtcaatgtgaacttctacggcaccaccgaaaccccacaggccatggctttccataccctcgacccggaaatggaCAATGCCtt > 1:874217‑M1/104‑112 (MQ=255) tATCCCCGCGACAGGTAGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAgg < 2:811379/150‑1 (MQ=255) ccGCGACAGGTAGGGGTTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATg > 2:876823/1‑150 (MQ=255) ccGCGACAGGTAGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATg > 2:961005/1‑150 (MQ=255) gACAGGTAGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGaaa < 2:480903/150‑1 (MQ=255) gACAGGTAGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGaaa < 1:1042281/150‑1 (MQ=255) ggTCGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCa > 2:55235/1‑150 (MQ=255) ggTAGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTcc > 2:856899/1‑122 (MQ=255) ggTAGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTcc < 1:856899/122‑1 (MQ=255) gTAGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCAt > 2:679153/1‑150 (MQ=255) ggggCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCTTTTCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGc < 2:1182061/150‑1 (MQ=255) ggATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAACCCCTCGCCTTTgggg > 2:8748/1‑150 (MQ=255) ggATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCgg < 1:55235/150‑1 (MQ=255) gtgaacttctacggcaccaccgaaaccccacaggccatggctttccataccctcgacccggaaatggaCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTc > 1:148253‑M1/69‑102 (MQ=255) gtgaacttctacggcaccaccgaaaccccacaggccatggctttccataccctcgacccggaaatggaCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTc < 2:148253‑M1/34‑1 (MQ=255) gATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCGATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGGCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGCGGGGTTTCggt > 2:191475/1‑150 (MQ=255) gATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCagt > 1:241655/1‑150 (MQ=255) aTTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCggtg < 1:876823/150‑1 (MQ=255) ttCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCggtggt < 1:346875/150‑1 (MQ=255) cTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGt > 1:772898/1‑150 (MQ=255) tcGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAg > 2:1381695/1‑150 (MQ=255) cccTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTc > 2:745464/1‑150 (MQ=255) tCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTcaca > 1:1256930/1‑150 (MQ=255) tGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTCACAtt < 2:500802/148‑1 (MQ=255) tGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTCACAtt > 1:500802/1‑148 (MQ=255) aCCAGCTGGTTGGACGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTCACATTGACg < 1:649049/150‑1 (MQ=255) gTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTCACATTGACGGCATTCgg > 1:847084/1‑150 (MQ=255) cGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTCACATTAACGGCATTCGGTGCGAt > 2:286307/1‑150 (MQ=255) cGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATAGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTCACATTGACg < 1:861177/136‑1 (MQ=255) cGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATAGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTCACATTGACg > 2:861177/1‑136 (MQ=255) ttATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAggg > 2:489724/1‑75 (MQ=255) ttATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAggg < 1:489724/75‑1 (MQ=255) ttATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTCACATTGACGGCATTCGGTGCGATGgcgc < 2:772898/150‑1 (MQ=255) aTCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTa > 2:310423/1‑75 (MQ=255) aTCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTa < 1:310423/75‑1 (MQ=255) taccctcgacccggaaatggaCAATGCCCGGGTGCCCTTGGGCAAA‑‑GGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTCACATTGACGGCATTCGGTGCGATGGCGCGGa < 2:452739‑M1/129‑1 (MQ=255) tCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTCACATTGACGGCATTCGGTGCGATGGCGCGGa > 1:980207/1‑150 (MQ=255) ccAGCAATTGTGCATCGGCAATGGCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCggt < 1:95407/100‑1 (MQ=255) ccAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCggt > 2:95407/1‑100 (MQ=255) ccAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTCACATTGACGGCATTCGGTGCGATGGCGCGGACct < 2:980207/150‑1 (MQ=255) cAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAg > 1:993685/1‑66 (MQ=255) cAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAg < 2:993685/66‑1 (MQ=255) aGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTCACATTGACGGCATTCGGTGCGATGGCGCGGACctgc < 2:847084/150‑1 (MQ=255) aaTTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCAACTGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTCACATTGACGGCATTCGGTGCGATGGCGCGGACCTGCTGa < 1:8748/150‑1 (MQ=255) | AACGGGTTGGCGATGAATTTGGCTTCGGTCAGCCCCGGGTCGTCCCAGTATCCCCGCGACAGGTAGGGGCTGCGGATCAGGATTTCGCCTGTCTCGCCCTCGCTGACCAGCTGGTTGGCCGGGTTTATCACCAGCAATTGTGCATCGGCAATGCCTT‑‑TGCCCAAGGGCACCCGGGCATTGTCCATTTCCGGGTCGAGGGTATGGAAAGCCATGGCCTGTGGGGTTTCGGTGGTGCCGTAGAAGTTCACATTGACGGCATTCGGTGCGATGGCGCGGACCTGCTGA > NC_002947/2924127‑2924411 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |