New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3038086 = | 55 (1.050) | 4 (0.080) | 4/234 | NT | 7.4% | coding (315/1143 nt) | gbd | 4‑hydroxybutyrate dehydrogenase |
? | NC_002947 | 3038112 = | 48 (0.960) | coding (341/1143 nt) | gbd | 4‑hydroxybutyrate dehydrogenase |
GACACCACACAACTGCCGATCTACGACGGTACGCCACCCAACCCCAACGAGCATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGACCACGGCCGGCACGGGGAGCGAGGTCGGGCGCGGTGCCA > NC_002947/3037937‑3038228 | gACACCACACAACTGCCGATCTACGACGGTACGCCACCCAACCCCAACGAGCATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTg > 2:202004/1‑150 (MQ=255) cacaACTGCCGATCTACGACGGTACGCCACCCAACCCCAACGAGCATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCgtgt < 1:1130770/150‑1 (MQ=255) caACTGCCGATCTACGACGGTACGCCACCCAACCCCAACGAGCATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCgtgtgt < 2:40920/150‑1 (MQ=255) aaCTGCCGATCTACGACGGTACGCCACCCAACCCCAACGAGCATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGtgtgtg < 1:202004/150‑1 (MQ=255) tGCCGATCTACGACGGTACGCCACCCAACCCCAACGAGCATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGccc > 2:809369/1‑150 (MQ=255) tGCCGATCTACGACGGTACGCCACCCAACCCCAACGAGCATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCAGCGCCATTTGTGGTGGCTCGGCGATAGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGccc > 1:501943/1‑150 (MQ=255) gATCTACGACGGTACGCCACCCAACCCCAACGAGCATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCa > 2:82154/1‑150 (MQ=255) acgacgGTACGCCACCCAACCCCAACGAGCATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCac‑g‑acg < 2:1161984/150‑1 (MQ=255) gacgGTACGCCACCCAACCCCAACGCGCATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATTGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGc > 1:38720/1‑150 (MQ=255) gTACGCCACCCAACCCCAACGAGCATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGt > 2:158008/1‑150 (MQ=255) gTACGCCACCCAACCCCAACGAGCATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGt > 1:535189/1‑150 (MQ=255) gCCACCCAACCCCAACGAGCATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGaa > 2:90000/1‑150 (MQ=255) gCCACCCAACCCCAACGAGCATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGaa < 1:158008/150‑1 (MQ=255) cccaacGAGCATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCg > 1:392086/1‑150 (MQ=255) cATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAg > 2:246378/1‑150 (MQ=255) aTGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAgg < 1:82154/150‑1 (MQ=255) ccGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGggcg < 1:1035443/150‑1 (MQ=255) cgtgcgtgAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGggcgg < 2:392086/150‑1 (MQ=255) gcgtgAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCt < 1:339164/150‑1 (MQ=255) gTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATc > 2:482123/1‑150 (MQ=255) cATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCAcccc > 2:287059/1‑150 (MQ=255) cATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCAcccc > 1:907740/1‑150 (MQ=255) ttCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAg < 1:1324097/123‑1 (MQ=255) ttCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAg > 2:1324097/1‑123 (MQ=255) aaGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAAcc > 2:1219438/1‑150 (MQ=255) gCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACcgcg > 2:567197/1‑150 (MQ=255) gCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGT‑CGTGCCGGGCaca > 1:182789/1‑83 (MQ=255) gCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGa > 1:1195586/1‑150 (MQ=255) tgATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCAcccc > 1:626359/1‑129 (MQ=255) tgATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCAcccc < 2:626359/129‑1 (MQ=255) gATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCg < 2:1159526/150‑1 (MQ=255) aTGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCgg > 1:1375471/1‑150 (MQ=255) gCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGc < 2:1120480/150‑1 (MQ=255) tcatcGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGc < 2:120264/109‑1 (MQ=255) tcatcGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGc > 1:120264/1‑109 (MQ=255) tcatcGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGa < 1:246378/150‑1 (MQ=255) catcGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGAc < 2:1195586/150‑1 (MQ=255) gatccgggccaggccgccctcgatcaccgcaaagctcttcaacgGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGc > 2:207973‑M1/45‑69 (MQ=255) gatccgggccaggccgccctcgatcaccgcaaagctcttcaacgGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGc < 1:207973‑M1/25‑1 (MQ=255) atccgggccaggccgccctcgatcaccgcaaagctcttcaacgGGc > 2:1395014‑M1/44‑46 (MQ=255) atccgggccaggccgccctcgatcaccgcaaagctcttcaacgGGc < 1:1395014‑M1/3‑1 (MQ=255) cATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGACCAcggc > 1:1234608/1‑150 (MQ=255) tggCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGACCACGGCCGGCACggg < 1:90000/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGACCACGGCCGGCACGGGGa < 2:1375471/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGAGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGACCACGGCCGGCACGGGGa > 1:530868/1‑150 (MQ=255) cTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGACCACGGCCGGCACGGGGAg < 1:1219438/150‑1 (MQ=255) tCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGTCGACCACGGCCGGCACGGGGAGc > 1:1316024/1‑150 (MQ=255) tCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGACCACGGCCGGCACGGGGAGc > 2:314212/1‑150 (MQ=255) tCGGCGATCGACCTCGCCAGAAGCGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCACGTTGAACAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGAGATTGCGGTGCCGACCACGGCGGGCAAGGGGAGc > 2:554362/1‑150 (MQ=255) gCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGACCACGGCCGGCACGGGGAGCGAg > 2:91544/1‑150 (MQ=255) gCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGACCACGGCCGGCACGGGGAGCGAg < 1:482123/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGACCACGGCCGGCACGGGGAGCGAGGTCGGgcg > 2:32694/1‑150 (MQ=255) tGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGAc < 2:1129555/118‑1 (MQ=255) tGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGAc > 1:1129555/1‑118 (MQ=255) ggCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGACCACGGCCGGCACGGGGAGCGAGGTCGGGCGCgg < 1:851914/150‑1 (MQ=255) gCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑T‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAg < 1:1182968/63‑1 (MQ=255) gCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAg > 2:1182968/1‑63 (MQ=255) aaGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGa > 2:1130898/1‑76 (MQ=255) aaGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGa < 1:1130898/76‑1 (MQ=255) ttcaacgGGCCGTC‑GTGCCGGGCACAC‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGACCAcg > 2:836751‑M1/8‑116 (MQ=255) ttcaacgGGCCGTC‑GTGCCGGGCAC‑ACACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGACCAcg < 1:836751‑M1/109‑1 (MQ=255) aGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGACCACGGCCGGCAAGGGGAGCGAGGTCGGGCGCGGTGCCa > 1:203586/1‑150 (MQ=255) | GACACCACACAACTGCCGATCTACGACGGTACGCCACCCAACCCCAACGAGCATGCCGTGCGTGAGGCCGTGGCCATGTTCAAGGCAAATGGCTGTGATGGCATCATCGCCATTGGTGGTGGCTCGGCGATCGACCTGGCCAAGGGGGTGGCCGTGTGTGCCCGGCAC‑G‑ACGGCCCGTTGAAGAGCTTTGCGGTGATCGAGGGCGGCCTGGCCCGGATCACCCCGGCAACCGCGCCGGTGATTGCGGTGCCGACCACGGCCGGCACGGGGAGCGAGGTCGGGCGCGGTGCCA > NC_002947/3037937‑3038228 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |