New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3920914 = | 48 (0.910) | 4 (0.080) | 4/240 | NT | 7.4% | coding (896/1689 nt) | acs | acyl‑CoA synthetase |
? | NC_002947 | 3920968 = | 53 (1.030) | coding (842/1689 nt) | acs | acyl‑CoA synthetase |
ATCTGCACTTCGGCCATGTGCATCTCGCCAATCACCCGGCGCATCACCTCGATCGGGCAGGTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGC > NC_002947/3920767‑3921063 | ggtcggtgaaagcctgggccttaccgagcacgatcggctggtggtgccggtgccgctgtaccactgcttcggcatggtcatggccaaccttggctgcatgacacacggcagcgcactgatttaccccagcgatgccttcgacccgctGGc < 1:462485‑M1/3‑1 (MQ=255) ttCGGCCATGTGCATCTCGCCAATCACCCGGCGCATCACCTCGATCGGGCAGGTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATa > 1:1186036/1‑150 (MQ=255) gCCATGTGCATCTCGCCAATCACCCGGCGCATCACCTCGATCGGGCAGGTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAgc < 1:283029/150‑1 (MQ=255) gCATCTCGCCAATCACCCGGCGCATCACCTCGATCGGGCAGGTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTgg > 1:567679/1‑150 (MQ=255) aTCTCGCCAATCACCCGGCGCATCACCTCGATCGGGCAGGTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCt > 1:835248/1‑150 (MQ=255) gagcacgatcggctggtggtgccggtgccgctgtaccactgcttcggcatggtcatggccaaccttggctgcatgacacacggcagcgcactgatttaccccagcgatgccttcgacccgctGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCttttt < 1:901718‑M1/28‑1 (MQ=255) cGCCAATCACCCGGCGCATCACCTCGATCGGGCAGGTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCttttt < 2:205291/150‑1 (MQ=255) aTCACCCGGCGCATCACCTCGATCGGGCAGGTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACCACTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTgc < 2:408930/150‑1 (MQ=255) tCACCCGGCGCATCACCTCGATCGGGCAGGTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTgcg > 2:587784/1‑150 (MQ=255) aCCCGGCGCATCACCTCGATCGGGCAGGTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGcc > 2:424288/1‑150 (MQ=255) ccTCGATCGGGCAGGTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCg > 1:493943/1‑150 (MQ=255) tCGATCGGGCAGGTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTg > 2:1072491/1‑150 (MQ=255) ccgctgtaccactgcttcggcatggtcatggccaaccttggctgcatgacacacggcagcgcactgatttaccccagcgatgccttcgacccgctGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCa > 2:901718‑M1/96‑150 (MQ=255) ggCAGGTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGc > 2:170343/1‑99 (MQ=255) ggCAGGTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGc < 1:170343/99‑1 (MQ=255) gCAGGTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGCCACGTCGCCTTCCACACGCTGTGGATGGTCCATTTCTGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCgg < 2:518510/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCggg < 2:493943/150‑1 (MQ=255) ggTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGtg > 2:1391721/1‑149 (MQ=255) gTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTgc < 2:1346754/128‑1 (MQ=255) gTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTgc > 1:1346754/1‑128 (MQ=255) cGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGaa < 2:567679/150‑1 (MQ=255) cGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGaa < 1:1072491/150‑1 (MQ=255) gCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCCGAGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTCTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAg < 1:1360102/150‑1 (MQ=255) ccGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGTTCGAAGGCa < 2:1186036/150‑1 (MQ=255) gCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTg < 1:509717/99‑1 (MQ=255) gCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTg > 2:509717/1‑99 (MQ=255) gATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTggg < 1:424288/150‑1 (MQ=255) tcatggccaaccttggctgcatgacacacggcagcgcactgatttaccccagcgatgccttcgacccgctGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGt > 1:235996‑M1/71‑131 (MQ=255) tcatggccaaccttggctgcatgacacacggcagcgcactgatttaccccagcgatgccttcgacccgctGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGt < 2:235996‑M1/61‑1 (MQ=255) ggTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCTTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAAt < 1:1044776/150‑1 (MQ=255) aGGTCGAATTCATGGTCCGGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGCGACCATCGTCACTGACTTCCCGCGTGCCTGCGCCACTTCGCGCAGCGTGACCAGCGGGTCGACGTCATCGCTTGGGTAAATCAGTGCGCTGCCgtgt < 1:1391721/150‑1 (MQ=255) aGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCgtgt < 1:587784/150‑1 (MQ=255) gTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAg < 1:769711/115‑1 (MQ=255) gTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAg > 2:769711/1‑115 (MQ=255) gAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCAt < 2:465653/150‑1 (MQ=255) gAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCAt > 1:1191154/1‑150 (MQ=255) ttCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGaa < 1:1365188/108‑1 (MQ=255) ttCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGaa > 2:1365188/1‑108 (MQ=255) tCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAg < 2:148066/150‑1 (MQ=255) accacGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCAt < 2:230413/144‑1 (MQ=255) accacGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCAt > 1:230413/1‑144 (MQ=255) accacGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGcc > 1:488217/1‑150 (MQ=255) tcGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCGGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCAGGCAGCCAAg > 2:453858/2‑150 (MQ=255) tgtgGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTgg > 1:1419926/1‑109 (MQ=255) tgtgGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTgg < 2:1419926/109‑1 (MQ=255) gtgGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTgg > 1:357675/1‑150 (MQ=255) gTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGAc > 1:496672/1‑150 (MQ=255) gTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGAc < 2:488217/150‑1 (MQ=255) aaTGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCa > 1:1369924/1‑150 (MQ=255) tGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTggg > 2:355346/1‑88 (MQ=255) tGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTggg < 1:355346/88‑1 (MQ=255) tGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGt < 2:1191154/150‑1 (MQ=255) aaCATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCGTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTgg > 2:379121/1‑150 (MQ=255) gTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGc < 2:496672/150‑1 (MQ=255) gTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGc < 2:999961/150‑1 (MQ=255) GGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGc < 1:1132220‑M1/150‑1 (MQ=255) | ATCTGCACTTCGGCCATGTGCATCTCGCCAATCACCCGGCGCATCACCTCGATCGGGCAGGTCGCACCGGCCATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGC > NC_002947/3920767‑3921063 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |