| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4577861 = | 80 (1.520) | 11 (0.220) | 6/236 | NT | 13.4% | intergenic (+26/+83) | PP_4057/glgB | membrane protein/1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
| ? | NC_002947 | 4577913 = | 65 (1.290) | intergenic (+78/+31) | PP_4057/glgB | membrane protein/1,4‑alpha‑glucan branching enzyme | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GGCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCG > NC_002947/4577714‑4578010 | tcgaatgtcggcaatctcggggcggtggccagtgacgaagtggccagccacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgaagttgctggtgttcatcatgtagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagAc < 1:168325‑M1/2‑1 (MQ=255) gaatgtcggcaatctcggggcggtggccagtgacgaagtggccagccacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagAccc > 2:803520‑M1/147‑150 (MQ=255) tggtggCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:847118/150‑1 (MQ=255) gtggCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 1:806987/1‑150 (MQ=255) tggCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGcgaa < 1:895409/150‑4 (MQ=255) gtcggcaatctcggggcggtggccagtgacgaagtggccagccacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagACCCGCTc < 2:242405‑M1/8‑1 (MQ=255) cgGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacac < 2:806987/150‑1 (MQ=255) ggTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGAGCCGATTCACACCA‑TGATATGCATGAGAAGGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGACGGCTTCTTAGCGGATAAACCCGCTCCTACACgg < 2:312457/150‑1 (MQ=255) gACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTc > 2:641501/1‑150 (MQ=255) gCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCAcc > 2:724511/1‑150 (MQ=255) cTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCAccgc > 1:334506/1‑150 (MQ=255) ttCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCAccgcc > 1:774666/1‑150 (MQ=255) cGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTTCGGATGCGTTGGTAGGCAGGTCCGGCCCCTTCGCGGGTCCACCCACTTCTACACGGGTCACCGCCgg < 2:128979/150‑1 (MQ=255) gCGTTGTTCGTCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACgg > 1:1114609/1‑134 (MQ=255) gCGTTGTTCGTCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACgg < 2:1114609/134‑1 (MQ=255) gttgttCGTCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggtgcggt > 1:402471/1‑150 (MQ=255) gttCGTCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggggcggtggc > 1:230158/1‑148 (MQ=255) tCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa < 2:293428/119‑1 (MQ=255) tCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 1:293428/1‑119 (MQ=255) tCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGt > 2:417316/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCAGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGt > 2:1420308/1‑150 (MQ=255) aGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAg < 2:191978/150‑1 (MQ=255) gccagccacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAg < 1:895939‑M1/44‑1 (MQ=255) gccagccacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAg > 2:895939‑M1/107‑150 (MQ=255) cgcCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGa > 1:818639/1‑150 (MQ=255) gcCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGaa > 2:231196/1‑150 (MQ=255) gcCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGaa > 1:428125/1‑150 (MQ=255) gATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGTGGTGCCTGCGTAGGAACgg < 2:774666/150‑1 (MQ=255) gATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACgg < 2:1412654/150‑1 (MQ=255) 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cagTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGAGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCcg > 1:1318768/1‑150 (MQ=255) aTGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTACACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGaaa < 1:417760/150‑1 (MQ=255) tgtgGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAg < 2:402471/150‑1 (MQ=255) gATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGaaa < 1:979668/145‑1 (MQ=255) gATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAgg < 1:126846/147‑1 (MQ=255) 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> 1:795400/1‑150 (MQ=255) aGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCAt < 1:1258239/150‑1 (MQ=255) ggggTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCaa < 1:605996/150‑1 (MQ=255) tgaagcccgcctgatcggttggctgtactggcccttcgcgggtaaACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTccc > 1:202864‑M1/46‑102 (MQ=255) tgaagcccgcctgatcggttggctgtactggcccttcgcgggtaaACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTccc < 2:202864‑M1/57‑1 (MQ=255) gggTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAac < 2:416970/150‑1 (MQ=255) ggTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAaca > 1:289513/1‑150 (MQ=255) 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ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAgg < 1:1403287/140‑1 (MQ=255) cgcgGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGAAGTGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAAt > 1:1404104/1‑150 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATg > 2:1055326/1‑150 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATg > 2:808991/1‑150 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTGCTACACGGGTCACCGCCGGGTGAGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATTAACAGCCCCAACCGCGGCAGGGGTAGCGCCAGCTATAATgg < 2:1086332/150‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTg > 1:40205/1‑150 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTg > 2:395617/1‑150 (MQ=255) ACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCg < 1:1240982‑M1/150‑1 (MQ=255) | GGCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATT‑ACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCG > NC_002947/4577714‑4578010 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |