| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5201663 | 13 (0.250) | 13 (0.350) | 8/172 | NT | 60.4% | intergenic (‑101/‑79) | PP_4582/PP_4583 | membrane protein/putative Peptidase |
| ? | NC_002947 | = 5201684 | 8 (0.220) | intergenic (‑122/‑58) | PP_4582/PP_4583 | membrane protein/putative Peptidase | |||||
CTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCAACA > NC_002947/5201520‑5201812 | cTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTc > 1:1399328/1‑150 (MQ=255) gggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCTGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGt < 1:1223505‑M1/46‑1 (MQ=255) cGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGt < 2:364548/150‑1 (MQ=255) cAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGa < 1:156975/150‑1 (MQ=255) aaGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcac > 2:1294734‑M1/1‑136 (MQ=255) cccAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCt > 1:1017794/1‑150 (MQ=255) cccAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCt > 1:551546/1‑150 (MQ=255) aGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGtt < 2:1399328/150‑1 (MQ=255) aGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGtt < 1:249636/150‑1 (MQ=255) ggCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtag < 1:1294734‑M1/150‑23 (MQ=255) ggCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTg > 2:1017794‑M2/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGtt > 2:597323/1‑146 (MQ=255) gAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGtt < 1:597323/146‑1 (MQ=255) aatttgtagtcGTTCTTTGTCATGGTGTTCGTGATAGCCAGGCAAAGAGGTGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagc < 2:589643‑M1/146‑27 (MQ=255) agccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCTGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCgg > 2:1223505‑M1/86‑150 (MQ=255) agccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCgg > 1:86890‑M1/86‑150 (MQ=255) gtgtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCTTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcggg > 1:1297685‑M2/1‑142 (MQ=255) gtgtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcggg < 2:358003‑M1/150‑30 (MQ=255) gtgtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcggg < 2:335065‑M1/150‑30 (MQ=255) gtgtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcggg > 2:551546‑M2/1‑142 (MQ=255) gTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcggg < 1:823420‑M1/142‑30 (MQ=255) gTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcggg > 2:823420‑M1/1‑113 (MQ=255) gTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCGCTGTTggagcgggtttacccg < 1:282000‑M2/150‑17 (MQ=255) gTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccg < 2:176002‑M2/150‑17 (MQ=255) aTGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggcc > 1:1152932‑M2/1‑124 (MQ=255) aTGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggcc > 1:176002‑M2/1‑124 (MQ=255) tcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCgg > 2:1339192‑M1/59‑123 (MQ=255) tcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCgg < 1:1339192‑M1/65‑1 (MQ=255) cAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggt > 2:53593‑M2/1‑107 (MQ=255) cAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggt < 1:53593‑M2/116‑10 (MQ=255) aaaGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggcc < 2:1266648‑M2/128‑27 (MQ=255) aaaGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggcc > 1:1266648‑M2/1‑102 (MQ=255) gttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGtt < 2:1286912‑M1/68‑1 (MQ=255) gttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGtt > 1:1286912‑M1/29‑96 (MQ=255) acacTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgg < 1:323425‑M1/90‑29 (MQ=255) acacTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgg < 2:1424082‑M1/90‑29 (MQ=255) acacTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgg > 2:323425‑M1/1‑62 (MQ=255) acacTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgg > 1:1424082‑M1/1‑62 (MQ=255) ttttCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgg > 1:551693‑M1/1‑58 (MQ=255) ttttCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgg < 2:551693‑M1/86‑29 (MQ=255) cGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGtt > 2:240171/1‑74 (MQ=255) cGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGtt < 1:240171/74‑1 (MQ=255) cAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGa < 2:1087587/150‑1 (MQ=255) attggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCggg < 2:280271‑M1/66‑1 (MQ=255) attggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCggg > 1:280271‑M1/8‑73 (MQ=255) tttGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtt < 2:692795‑M1/69‑32 (MQ=255) tttGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtt > 1:692795‑M1/1‑38 (MQ=255) ttGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgg < 2:97258‑M2/65‑8 (MQ=255) ttGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgg > 1:97258‑M2/1‑58 (MQ=255) tgtgCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttaccc < 2:616337‑M1/68‑37 (MQ=255) tgtgCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttaccc > 1:616337‑M1/1‑32 (MQ=255) gtgCCGGCCTGTTCGCGGGTACGGCCGTGGGTTCCGTGGTGGCAACCCAGATGGAGCGCTTTTACCCGCAAAGATCCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCa < 2:282000/150‑1 (MQ=255) CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTc < 2:390997‑M1/88‑1 (MQ=255) CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTc > 1:390997‑M1/1‑88 (MQ=255) CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCACCCCCCGCTTGCCCAAGCCGCCCAGGcc < 2:668839‑M1/150‑1 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacatgcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctctttgcctggcttgcacgaacaccat > 1:176002‑M1/1‑26 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctctttgcctggcttgcacgaacaccat > 1:1152932‑M1/1‑26 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctcttt < 2:1266648‑M1/128‑103 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctcttt > 1:1266648‑M1/1‑26 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAaga < 1:1353531‑M1/95‑1 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAaga > 2:1353531‑M1/1‑95 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGccaaccaa > 2:1037488‑M1/1‑114 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGccaaccaa < 1:1037488‑M1/114‑1 (MQ=255) CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCATGCAAATGATGAGACCTGCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCAcc < 1:1032805‑M1/150‑1 (MQ=255) TTCGCGGGTAAACGCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGCTTACCCGCGAAGAGGCCTGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGCCCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCaccgccc < 2:1049472‑M1/150‑4 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacatgcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctctttgcctggcttgcacgaacaccatgaccgagaac < 2:176002‑M1/150‑135 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCaacagcgatcgcaccgaggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctctttgcctggcttgcacgaacaccatgaccgagaac < 1:282000‑M1/150‑135 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcaca < 2:616337‑M2/68‑33 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcaca > 1:616337‑M2/1‑36 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaa > 1:692795‑M2/1‑31 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaa < 2:692795‑M2/69‑39 (MQ=255) AACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTg < 1:1219923‑M1/150‑1 (MQ=255) AACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTg < 1:1147761‑M1/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctctttgcctg < 1:53593‑M1/116‑108 (MQ=255) aCCCGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctctttgcctg > 2:53593‑M1/1‑9 (MQ=255) cccGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctctttgcctggcttgcacgaacaccatgaccgagaacgactacac > 2:551546‑M1/1‑8 (MQ=255) cccGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaagagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctctttgcctggcttgcacgaacaccatgaccgagaacgactacac > 1:1297685‑M1/1‑8 (MQ=255) cccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctctttgcctggcttgcacgaacaccatgaccgagaacgactacac < 2:335065‑M2/150‑122 (MQ=255) cccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctctttgcctggcttgcacgaacaccatgaccgagaacgactacac < 2:358003‑M2/150‑122 (MQ=255) cccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctctttgcctggcttgcacgaacaccatgaccgagaac > 2:823420‑M2/1‑29 (MQ=255) cccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctctttgcctggcttgcacgaacaccatgaccgagaac < 1:823420‑M2/142‑114 (MQ=255) CCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGc < 2:274746‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGc < 1:752733‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGc < 2:541361‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaa > 1:97258‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGCTCCaacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaa < 2:97258‑M1/65‑59 (MQ=255) ccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgt < 2:1424082‑M2/90‑63 (MQ=255) ccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgt > 1:1424082‑M2/1‑28 (MQ=255) ccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgt > 2:323425‑M2/1‑28 (MQ=255) ccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgt < 1:323425‑M2/90‑63 (MQ=255) ccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaa < 2:551693‑M2/86‑59 (MQ=255) ccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaa > 1:551693‑M2/1‑28 (MQ=255) CCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCACGAGCCCTGCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCt < 2:474939‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAg < 2:1245733‑M1/97‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAg > 1:1245733‑M1/1‑97 (MQ=255) CCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCt < 2:799963‑M1/150‑1 (MQ=255) gCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcacctctttgcctggctatcacgaacaccatgacaaagaacgactacaaatt < 2:589643‑M2/150‑125 (MQ=255) caacagggatcgcaccgaggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctctttgcctggcttgcacgaacaccatgaccgagaacgactacaccttcgcc > 2:1017794‑M1/1‑1 (MQ=255) cTACCTCGGTGCGATCCCTGTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctctttgcctggcttgcacgaacaccatgaccgagaacgactacaccttcgcc < 1:1294734‑M2/150‑129 (MQ=255) | CTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCAACA > NC_002947/5201520‑5201812 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |