New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 304450 | 52 (0.990) | 4 (0.080) | 4/236 | NT | 7.6% | coding (321/621 nt) | PP_0249 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 304473 | 47 (0.930) | coding (298/621 nt) | PP_0249 | hypothetical protein |
CCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGCGACCCACTCGCGCAGGCCGATCACAGTCAAATGGTCAA > NC_002947/304329‑304622 | ccAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAgggct < 2:705278‑M2/150‑6 (MQ=255) gTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCCGGTTCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTcgc > 1:8276/1‑150 (MQ=255) gTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGACGTcgc > 1:118705/1‑150 (MQ=255) ggATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAgg > 1:1042898/1‑150 (MQ=255) aTGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGt > 2:814289/1‑150 (MQ=255) tGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGtt < 2:903013/150‑1 (MQ=255) gACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTc < 1:705278/150‑1 (MQ=255) gTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCAc < 2:275053/150‑1 (MQ=255) gTCTGGGCGTAGACGTTAGAGGTCTTGCTGGCTTTCAACGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGGGCCGTAACTCCACCACCCCGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGCCGCGCTCGGAGGGTTCCACTTCGGTg < 2:118705/150‑1 (MQ=255) gCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGc > 2:922811/1‑146 (MQ=255) gCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGc < 1:922811/146‑1 (MQ=255) cGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCg > 1:909673/1‑150 (MQ=255) gTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGc < 2:32733/142‑1 (MQ=255) gTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGc > 1:32733/1‑142 (MQ=255) gTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGa > 1:1304679/1‑150 (MQ=255) gAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGc > 2:1068000/1‑138 (MQ=255) gAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGc < 1:1068000/138‑1 (MQ=255) aGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCg < 2:60112/113‑1 (MQ=255) aGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCg > 1:60112/1‑113 (MQ=255) gATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGc < 2:442759/143‑1 (MQ=255) gATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGc > 1:442759/1‑143 (MQ=255) aTGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCg > 2:401772/1‑150 (MQ=255) gTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGgtg > 2:1102684/1‑150 (MQ=255) cGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCtt > 1:1344897/1‑150 (MQ=255) gTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTg < 1:638476/150‑1 (MQ=255) gTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTg > 2:1005088/1‑150 (MQ=255) cACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGgc < 1:401772/150‑1 (MQ=255) aCCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGgcg > 1:399378/1‑150 (MQ=255) aCGGTGTCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCa < 2:1169587/150‑1 (MQ=255) aCGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCa > 1:282354/1‑150 (MQ=255) cTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGc > 2:1076395/1‑150 (MQ=255) tCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCa > 2:498882/1‑88 (MQ=255) tCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCa < 1:498882/88‑1 (MQ=255) tCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGcc < 2:909673/150‑1 (MQ=255) gcggTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAg < 1:1076395/150‑1 (MQ=255) cAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGACCGTGGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTcaggcag > 2:469837/1‑150 (MQ=255) aaCTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTcaggcagg < 1:635964/150‑1 (MQ=255) aCTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAgggctcggtggtgcagttgcgccaccgccgctgcgaggcaccgttggtgacgatgaaaaccatcaagagctccaacggccacgcccagacccgctacgtcatccgcacgt < 2:842521‑M2/150‑111 (MQ=255) accaccGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGAt > 2:1052690/1‑107 (MQ=255) accaccGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGAt < 1:1052690/107‑1 (MQ=255) accaccGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGCGAcc > 1:290889/1‑150 (MQ=255) caccGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAgggctcggtggtgcagttgcgccaccgccgctgcgaggcaccgttggtgacgatgaaaaccatcaagagctccaacggccacgcccagacccgctac > 2:1195644‑M2/1‑33 (MQ=255) caccGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAgggctcggtggtgcagttgcgccaccgccgctgcgaggcaccgttggtgacgatgaaaaccatcaagagctccaacggccacgcccagacccgctac < 1:1195644‑M2/130‑98 (MQ=255) caccGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGa > 2:653129/1‑84 (MQ=255) caccGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGa < 1:653129/84‑1 (MQ=255) caccGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGCGACCCa > 2:459353/1‑150 (MQ=255) cGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGCGACCCACTc < 1:1005088/150‑1 (MQ=255) ccAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGCGACCCACTCGCGCa > 2:768687/1‑150 (MQ=255) ccAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGCGACCCACTCGCGCa > 1:233693/1‑150 (MQ=255) aGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGCGACCCACTCGCGCAgg > 1:1115304/1‑150 (MQ=255) gcgcAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGCGACCCACTCGCGCAGGCCGa < 2:1232226/150‑1 (MQ=255) tGAAGCGAACCCAgggctcggtggtgcagttgcgccaccgccgctgcgaggcaccgttggtgacgatgaaaaccatcaagagctccaacggccacgcccagacccgctacgtcatccgcacgtcactggcgctgggtgatggtgtgtggg > 1:842521‑M2/1‑13 (MQ=255) aGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGCGACCCACTCGCGCAGGCCGATCACAgtcaaatggtcaa > 1:874749/1‑150 (MQ=255) | CCAGCGCCAGTGACGTGCGGATGACGTAGCGGGTCTGGGCGTGGCCGTTGGAGCTCTTGATGGTTTTCATCGTCACCAACGGTGCCTCGCAGCGGCGGTGGCGCAACTGCACCACCGAGCCCAGGTGCGCAGTGAAGCGAACCCAGGGCTGGCCGTCGCGCTCGAAGGGTTCCACTTCGGTGGCATGCAGGCTCGACGTGCTGGCACCGGTGTCGATCTTGGCGCGCAGCCCGGCCACGCCGAGGTCAGGCAGGGCGACCCACTCGCGCAGGCCGATCACAGTCAAATGGTCAA > NC_002947/304329‑304622 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |