| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1456932 | 87 (1.660) | 6 (0.120) | 6/240 | NT | 6.9% | coding (58/813 nt) | PP_1274 | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | = 1456953 | 77 (1.500) | coding (37/813 nt) | PP_1274 | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase | |||||
GGCCAGCGCCTCGCCATCGTTTACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATGGAGGAAACACATCAATTGGCAAACGTACCTTGCAGGTGCTCGGCTCGGAATTCCAGGGTCTGCGGCCGATAGCCGGAACGCAGCGGCGGCA > NC_002947/1456810‑1457100 | ggCCAGCGCTCCGCAATCATCGATATCCACCTTCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACACCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCt < 1:313842/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCTCGCCATCGTTTACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTg < 1:519908/150‑1 (MQ=255) ccTCGCCATCGTTTACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGaacaac < 2:359160/150‑1 (MQ=255) cTCGCCATCGTTTACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAAcc > 1:587236/1‑150 (MQ=255) cGCCATCGTTTACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCATCGGCCGCGCCCTGGCCGACgccttccgcgatgcggg > 1:1413090‑M2/1‑133 (MQ=255) gCCATCGTTTACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGTGCGCGGCCGTTGCCGCTGGAACAACCGGt < 2:1086211/150‑1 (MQ=255) gCCAACGTTTACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTGGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGt < 1:181157/150‑1 (MQ=255) ccATCGTTTACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCg < 1:800343/135‑1 (MQ=255) ccATCGTTTACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCg > 2:800343/1‑135 (MQ=255) cATCGTTTACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGa > 1:519717/1‑150 (MQ=255) aTCGTTTACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCAATCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGAt > 1:1357282/1‑150 (MQ=255) cGTTTACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCa < 2:949/150‑1 (MQ=255) gTTTACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAg > 2:1150497/1‑150 (MQ=255) tttACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTTGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAgg > 2:1376527/1‑150 (MQ=255) tttACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAgg > 2:395576/1‑150 (MQ=255) ttACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGa < 1:1150497/150‑1 (MQ=255) aTCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTg > 1:545956/1‑127 (MQ=255) aTCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTg < 2:545956/127‑1 (MQ=255) aTCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGt < 2:865048/150‑1 (MQ=255) tCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTg < 1:395576/150‑1 (MQ=255) cTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCAt < 2:929131/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATg > 2:1059803/1‑150 (MQ=255) tGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATg < 2:519717/150‑1 (MQ=255) gAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAg < 1:600565/150‑1 (MQ=255) aGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATgggtca < 2:245329/150‑5 (MQ=255) gCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCGCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAggg < 1:71887/150‑1 (MQ=255) ccGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAgggg > 2:632675/1‑150 (MQ=255) tgtAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCt < 2:655465/150‑1 (MQ=255) aGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCtgtt < 2:446850/150‑1 (MQ=255) cggcggCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATg > 1:1001802/1‑134 (MQ=255) cggcggCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATg < 2:1001802/134‑1 (MQ=255) gcggcACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCAt < 2:889251/150‑1 (MQ=255) cggcACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATg < 2:1166095/150‑1 (MQ=255) cggcACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATg < 1:666143/150‑1 (MQ=255) ggcACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATgg < 2:587236/150‑1 (MQ=255) gcACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCACGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATgga < 2:697773/150‑1 (MQ=255) cACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATggag > 2:99814/1‑150 (MQ=255) aCTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAACGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACCAACGGCGATCAGGCCGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATggcgg > 2:86720/1‑150 (MQ=255) tCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATGGAGGaa > 1:17109/1‑150 (MQ=255) cAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATgga > 2:1187333/1‑145 (MQ=255) cAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATgga < 1:1187333/145‑1 (MQ=255) cAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATGGAGGaaa < 1:1062544/150‑1 (MQ=255) cAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATGGAGGaaa < 1:407826/150‑1 (MQ=255) cAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATAGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTCATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATGGAGGaaa < 2:433932/150‑1 (MQ=255) 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cTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATGGAGGaaa < 1:575925/135‑1 (MQ=255) cTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATGGAGGaaa > 2:575925/1‑135 (MQ=255) cTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATGGAGGAAACACATCAATTGGCaa > 2:1136333/1‑150 (MQ=255) tCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATGGAGGAAACACATCAATTGGCaaa > 2:720697/1‑150 (MQ=255) gggcggTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATGGAGGAAACACATCAATTGGCAAACGTACCTTGc > 1:212650/1‑150 (MQ=255) 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GGCCAGCGCCTCGCCATCGTTTACATCCAGCTGCCGAGCCGTGTAGCCGGCGGCACTCAGTTTCTCGACATCCTCAGGCTTGCGGGCGGTGGCCCAGACATGGTGGCCCGCATCGCGGAAGGCGTCGGCCAGGGCGCGGCCGATGCCGCTGGAACAACCGGTGATCAGGACGGTGGGCATGGTAGGGGCCTGTTGTCATGGAGGAAACACATCAATTGGCAAACGTACCTTGCAGGTGCTCGGCTCGGAATTCCAGGGTCTGCGGCCGATAGCCGGAACGCAGCGGCGGCA > NC_002947/1456810‑1457100 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |