New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2255163 | 55 (1.050) | 6 (0.120) | 6/238 | NT | 10.2% | coding (293/1113 nt) | asd | aspartate‑semialdehyde dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 2255188 | 52 (1.020) | coding (318/1113 nt) | asd | aspartate‑semialdehyde dehydrogenase |
GCTTATTCGATTGAAGAACTCAAGACCCTCGACGTGATCCTGACCTGCCAGGGTGGCGACTACACCAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTCTGATGCTGATGGGCCTGGGTGGCCTGTTCGAGGCCGGTCTGGTCGAGTGGA > NC_002947/2255039‑2255336 | gCTTATTCGATTGAAGAACTCAAGACCCTCGACGTGATCCTGACCTGCCAGGGTGGCGACTACACCAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGAc < 2:644608/150‑1 (MQ=255) ttATTCGATTGAAGAACTCAAGACCCTCGACGTGATCCTGACCTGCCAGGGTGGCGACTACACCAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACgc < 1:1241377‑M2/150‑3 (MQ=255) gaagaaCTCAAGACCCTCGACGTGATCCTGACCTGCCAGGGTGGCGACTACACCAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCCGTGatcatc < 2:990709/150‑1 (MQ=255) aGACCCGCGACGTGATCCTGACCTGCCGGGGTGGCGACTACACCAACGAGGTGTCCCCCAAGCTGCGGGAAGCCGTCTGGCAGGCTTGCTGGATCCACGCCCCCTCGGCCCTGCGCGTGCAGGAGGACGCGGTGATCATCCTCGACCCgg < 2:381049/150‑1 (MQ=255) gTGATCCTGACCTGCCAGGGTGGCGACTACACCAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAg < 1:714221/150‑1 (MQ=255) cTGACCTGCCAGGGTGGCGACTACACCAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATc < 2:1241377/150‑1 (MQ=255) cTGACCTGCCAGGGTGGCGACTACACCAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATc < 2:1092245/150‑1 (MQ=255) ccTGCCAGGGTGGCGACTACACCAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGAcc < 1:1042257/150‑1 (MQ=255) cTGCCAGGGTGGCGACTACACCAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACca > 1:630152/1‑150 (MQ=255) gCCAGGGTGGCGACTACACCAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGAc > 2:239532/1‑146 (MQ=255) gCCAGGGTGGCGACTACACCAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGAc < 1:239532/146‑1 (MQ=255) gTGGCGACTACACCAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTgg > 2:324744/1‑150 (MQ=255) ggCGACTACACCAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGAc > 2:468909/1‑114 (MQ=255) ggCGACTACACCAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGAc < 1:468909/114‑1 (MQ=255) tACACCAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGCACCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATTGACCAGCAGCTGGATGCCGGt < 1:963635/150‑1 (MQ=255) cAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCaa > 2:1409160/1‑150 (MQ=255) cGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGaa < 1:843445/150‑1 (MQ=255) gcacccAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCt > 2:1365014/4‑125 (MQ=255) gcacccAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCt < 1:1365014/122‑1 (MQ=255) ctaaaccTGCCTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGt < 2:1370657/144‑1 (MQ=255) cccAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGt < 2:630152/150‑1 (MQ=255) cccAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGt > 1:80721/1‑150 (MQ=255) ccAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGa < 1:7326/78‑1 (MQ=255) ccAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGa > 2:7326/1‑78 (MQ=255) ccAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTg > 1:1410549/1‑150 (MQ=255) cTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAAc < 1:1183269/150‑1 (MQ=255) gTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCa > 2:950330/1‑150 (MQ=255) tGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAAc > 2:322278/1‑145 (MQ=255) tGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAAc < 1:322278/145‑1 (MQ=255) gCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACgcggtgatcatccagtaaccctgccagccggcttcacgcagcttgggtaagacctcgttggtgtagtcgccaccctggcaggtcaggatcacg < 1:866724‑M2/150‑94 (MQ=255) gCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCg > 1:126757/1‑115 (MQ=255) gCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCg < 2:126757/115‑1 (MQ=255) gCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATc < 1:684694/88‑1 (MQ=255) gCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATc > 2:684694/1‑88 (MQ=255) cAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTctgatg < 2:1410549/150‑1 (MQ=255) cAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTctgatg < 1:1309926/150‑1 (MQ=255) cAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGAGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCaa < 1:200151/113‑1 (MQ=255) cAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGAGCATGCAGGATGACGCGGGGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCaa > 2:200151/1‑113 (MQ=255) ggTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTctgatgctg > 2:547704/1‑150 (MQ=255) cTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACcagcag < 1:1175862/88‑1 (MQ=255) cTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACcagcag > 2:1175862/1‑88 (MQ=255) tGGACCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACgtggtgtcgatccagtagccctgccagccggcttcacgcagcttggggaagacctcgttggtgtagtcgccaccctggcaggtcaggatcacgtcgagggtcttgagttct > 1:614592‑M2/1‑39 (MQ=255) ggATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACgcggcgtcgatccagtaaccctgccagccggcttcacgcagcttggggaagacctcgttggtgtagtcgccaccctggcaggtcaggatcacgtcgagggtcttgatttctt < 1:133302‑M2/150‑113 (MQ=255) aTCGACGCAGCCTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCG‑‑GAGTGCAGACGTGTGCTCTTATGGTCAAGAAGCTGTATGCCGGTACCATGCTCTACATTTGTGGCAACTGCACCGTCAGTCTGATGCTGATGGGCCTg < 1:324744/150‑1 (MQ=255) tCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTCTGATGCTGATGGGCCTgg < 2:1173160/150‑1 (MQ=255) gACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGt < 2:1203508/125‑1 (MQ=255) gACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGt > 1:1203508/1‑125 (MQ=255) gACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTCTGATGCTGATGGGCCTGGGt < 1:950330/150‑1 (MQ=255) aCNCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGNTGACGCGGTGATNATCCTCNANCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTCTGATGCTGATGAGCCTGGGTg > 1:771337/1‑150 (MQ=255) aCGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACgcggcgtcgatccagtaaccctgccagccggcttcacgcagcttggggaagacctcgttggt > 2:1312406‑M2/1‑32 (MQ=255) aCGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACgcggcgtcgatccagtaaccctgccagccggcttcacgcagcttggggaagacctcgttggt < 1:1312406‑M2/94‑63 (MQ=255) aCGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCg < 2:267244/108‑1 (MQ=255) aCGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCg > 1:267244/1‑108 (MQ=255) gccgcTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTCTGATGCTGATGGGCCTGGGTGGc > 1:1244920/1‑150 (MQ=255) ccgcTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACgcggcgtcgatccagtaaccctgccagccggcttcacgcagcttggggaagacctcgttggtgtagtcgccaccctggcaggtcaggatcacgtcgagggtctttagctcttcaatcgcat < 1:599777‑M2/150‑122 (MQ=255) ttCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTCTGATGCTGATGGGCCTGGGTGGCCTGtt > 2:287574/1‑150 (MQ=255) gTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTCTGATGCTGATGGGCCTGGGTGGCCTGTTCGa < 1:929526/150‑1 (MQ=255) cTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTCTGATGCTGATGGGCCTGGGTGGCCTGTTCGAGGcc > 2:335618/1‑150 (MQ=255) cTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTCTGATGCTGATGGGCCTGGGTGGCCTGTTCGAGGcc > 2:1071150/1‑150 (MQ=255) gcATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTCTGATGCTGATGGGCCTGGGTGGCCTGTTCGAGGCCGGTc < 2:1244920/150‑1 (MQ=255) aTGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTCTGATGCTGATGGGCCTGGGTGGCCTGTTCGAGGCCGGTCTg > 1:898130/1‑150 (MQ=255) gCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTCTGATGCTGATGGGCCTGGGTGGCCTGTTCGAGGCCGGTCTGGt < 1:626834/150‑1 (MQ=255) aCGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTCTGATGCTGATGGGCCTGGGTGGCCTGTTCGAGGCCGGTCTGGTCGAGTGGa < 1:1409160/150‑1 (MQ=255) | GCTTATTCGATTGAAGAACTCAAGACCCTCGACGTGATCCTGACCTGCCAGGGTGGCGACTACACCAACGAGGTCTTCCCCAAGCTGCGTGAAGCCGGCTGGCAGGGTTACTGGATCGACGCCGCTTCGTCCCTGCGCATGCAGGATGACGCGGTGATCATCCTCGACCCGGTCAACCGCAAGGTC‑‑ATCGACCAGCAGCTGGATGCCGGTACCAAGAACTACATCGGTGGCAACTGCACCGTCAGTCTGATGCTGATGGGCCTGGGTGGCCTGTTCGAGGCCGGTCTGGTCGAGTGGA > NC_002947/2255039‑2255336 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |