| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4340085 = | 35 (0.670) | 11 (0.290) | 10/178 | NT | 43.8% | intergenic (+26/‑305) | ribAB‑II/PP_3814 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase/polyamine ABC transportersubstrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 4340169 = | 3 (0.080) | intergenic (+110/‑221) | ribAB‑II/PP_3814 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase/polyamine ABC transportersubstrate‑binding protein | |||||
CTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGCCACCAGAACACTTTGTTTTAG > NC_002947/4340090‑4340316 | CTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg > 2:961975‑M1/1‑140 (MQ=255)CTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg < 1:961975‑M1/140‑1 (MQ=255)CTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCata < 1:774321‑M1/150‑1 (MQ=255)CTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAAt < 2:303255‑M1/136‑1 (MQ=255)CTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAAt > 1:303255‑M1/1‑136 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGt > 2:902085‑M2/62‑85 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGt < 1:902085‑M2/24‑1 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATgg < 1:1399145‑M2/29‑1 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATgg > 2:1399145‑M2/62‑90 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt > 2:815201‑M2/62‑121 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt < 1:815201‑M2/60‑1 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATcccgtcggc > 2:1200353‑M2/62‑146 (MQ=255) CCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCg > 2:383126‑M1/1‑93 (MQ=255) CCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCg < 1:383126‑M1/93‑1 (MQ=255) CCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACct < 2:55201‑M1/107‑1 (MQ=255) CCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACct > 1:55201‑M1/1‑107 (MQ=255) CGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt > 1:551549‑M1/1‑120 (MQ=255) CGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt < 2:551549‑M1/120‑1 (MQ=255) gaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTg < 2:490429‑M2/6‑1 (MQ=255) gaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTg > 1:490429‑M2/58‑63 (MQ=255) atgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGa > 2:1221335‑M2/56‑77 (MQ=255) atgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGa < 1:1221335‑M2/22‑1 (MQ=255) TGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGa < 1:442327‑M1/76‑1 (MQ=255) TGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGa > 2:442327‑M1/1‑76 (MQ=255) acacCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGccc > 2:265643/1‑83 (MQ=255) acacCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTGTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGccc < 1:265643/83‑1 (MQ=255) caccGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCAc > 1:243273/1‑150 (MQ=255) gcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAAt < 2:243273‑M2/117‑1 (MQ=255) ttcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTaa > 1:890702‑M2/31‑150 (MQ=255) ggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATCAAAAACgg > 2:1402560‑M2/25‑150 (MQ=255) tacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCataa > 2:358050‑M2/11‑82 (MQ=255) tacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCataa < 1:358050‑M2/72‑1 (MQ=255) cagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGCCACCAGAACACTTTg > 1:507235‑M2/9‑150 (MQ=255) ggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATAcc > 2:302110‑M2/6‑73 (MQ=255) ggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATAcc < 1:302110‑M2/68‑1 (MQ=255) cccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGCCACCAGAACACTTTGTTTTa < 2:774321‑M2/147‑1 (MQ=255) ccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGCAGCGATGCCCGGAGCCACCGTCCAAAGGCCCGGAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGCCACCAGAACACTTTGTTTTAg > 1:536031/1‑150 (MQ=255) cattGATGCTTTTAACAGGGCGGAGTGATGTCCGGGCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTCCACCCCGCCACCTACAATTAAAAACCGCCACCAGAACACTTTGTTTTAg > 2:448486/3‑150 (MQ=255) | CTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGCCACCAGAACACTTTGTTTTAG > NC_002947/4340090‑4340316 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |