New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4349807 = | 49 (0.930) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 5.8% | coding (186/840 nt) | galU | UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
? | NC_002947 | 4349830 = | 48 (0.920) | coding (163/840 nt) | galU | UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
GTCTGGCGCGTGTACGAGAACGAGCACTCGTTGAGCAGACGACGAATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGCTTTGGTAGCAGGCAAGAAGCGCGTGCCGTAGCCGGCTGCCGGGAACAA > NC_002947/4349685‑4349977 | gTCTGGCGCGTGTACGAGAACGAGCACTCGTTGAGCAGACGACGAATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACg > 2:1061110/1‑150 (MQ=255) tCTGGCGCGTGTACGAGAACGAGCACTCGTTGAGCAGACGACGAATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGa < 1:1061110/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCGTGTACGAGAACGAGCACTCGTTGAGCAGACGACGAATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGAt < 2:610483/150‑1 (MQ=255) gtACGAGAACGAGCACTCGTTGAGCAGACGACGAATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGAtctc > 2:1152484/1‑150 (MQ=255) cGAGAACGAGCACTCGTTGAGCAGACGACGAATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGtt < 1:1062572/150‑1 (MQ=255) cGAGAACGAGCACTCGTTGAGCAGACGACGAATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGtt < 2:1257547/150‑1 (MQ=255) cGAGAACGAGCACTCGTTGAGCAGACGACGAATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGtt < 1:380200/150‑1 (MQ=255) gagaACGAGCACTCGTTGAGCAGACGACGAATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTc > 1:871121/1‑150 (MQ=255) ctaccaaagccatgcccaaggaaatgctgccggtggtcaacaagccactgatccagtatggcgttgaagaagcattggatgcgggtctgaacgagatctccatcgttacagggcgcgcttgccgcgcccggTAACGATGGAGATCTCGtt < 1:980639‑M2/19‑1 (MQ=255) gaACGAGCACTCGTGGAGCAGACCACGAATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAg < 2:788292/150‑1 (MQ=255) aaCGAGCACTCGTTGAGCAGACGACGAATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGa < 1:390797/150‑1 (MQ=255) aaCGAGCACTCGTTGAGCAGACGACGAATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGa < 1:776182/150‑1 (MQ=255) ttGAGCAGACGACGAATACCTACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCGTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAAt < 2:821667/150‑1 (MQ=255) aGACGACGAATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTTATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGcttct < 1:453979/150‑1 (MQ=255) gacgacGAATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGCAGGCGCGCTCCA‑ATGATTTTGGCATTGCGTAGCTGATGACGAGGTTGTCTTCCAGGTCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGcttctt < 1:319413/150‑1 (MQ=255) gaATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAAt > 1:983019/1‑137 (MQ=255) gaATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAAt < 2:983019/137‑1 (MQ=255) gaATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAAc > 1:235889/1‑148 (MQ=255) gaATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAAc < 2:235889/148‑1 (MQ=255) ccAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGa < 2:949470/150‑1 (MQ=255) tATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGt > 2:1168510/1‑150 (MQ=255) cTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCttgtt > 2:65221/1‑150 (MQ=255) cTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTACAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCttgtt > 1:254374/1‑150 (MQ=255) gtatggcgttgaagaagcattggatgcgggtctgaacgagatctccatcgttaCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGAt < 2:521879‑M1/30‑1 (MQ=255) gtatggcgttgaagaagcattggatgcgggtctgaacgagatctccatcgttaCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGAt > 1:521879‑M1/54‑83 (MQ=255) ccTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGGTTAGGTCGAAGTGGTCCTACAGGGCGCTATTGCCGCGCCCAGTAACGATGGAGCTCTCGTTCAGACCCATAGCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGCTCAGTGGCTTGTTGACCACCCgca < 2:656517/150‑1 (MQ=255) cTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGgcag > 2:1387983/1‑150 (MQ=255) cTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGgcag > 1:292201/1‑150 (MQ=255) aTCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCAtt > 2:273020/1‑150 (MQ=255) ggttt‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGATATCTCGTTCAGACCCGCATCCAAGGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACAACCGGCAGCATTTCCtg < 2:652441/148‑2 (MQ=255) gTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCtt < 2:1159994/150‑1 (MQ=255) tttt‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGt < 1:1310464/120‑1 (MQ=255) tttt‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGt > 2:1310464/1‑120 (MQ=255) cAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCAt > 2:1339134/1‑150 (MQ=255) gTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGAttt > 1:1308183/1‑150 (MQ=255) aGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGCTTTgg < 1:273020/150‑1 (MQ=255) aGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGACTTgg < 2:1308183/150‑1 (MQ=255) aacgagatctccatcgttaCCGGGCGCGGCAAGCGCGCCCTGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGCTTTGGTAg < 1:980639‑M1/131‑1 (MQ=255) tGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGCTTTGGTAGCAg < 2:871121/150‑1 (MQ=255) gTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCtt < 1:507657/129‑1 (MQ=255) gTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCtt > 2:507657/1‑129 (MQ=255) tCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGATAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGCTTTGGTAGCAGGc > 2:723651/1‑150 (MQ=255) atcgttaccgggcgcggcaagcgcgccctgTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATAc > 1:521879‑M2/31‑83 (MQ=255) atcgttaccgggcgcggcaagcgcgccctgTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATAc < 2:521879‑M2/53‑1 (MQ=255) gTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGtt < 2:951677/48‑1 (MQ=255) gTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGtt > 1:951677/1‑48 (MQ=255) tCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGATAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGCTTTGGTAGCAGGCAAGAAgcgc < 1:723651/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACACGCATCCAATGCTCCTTCAACGCCATACTAGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCACTTCTTTGGGCATGGCTTTGGTAGCAGGCACGGAGcgcg > 2:965154/1‑150 (MQ=255) ttCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTgg > 1:1214504/1‑119 (MQ=255) ttCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTgg < 2:1214504/119‑1 (MQ=255) tCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCtt < 1:956227/116‑1 (MQ=255) tCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCtt > 2:956227/1‑116 (MQ=255) aGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGCTTTGGTAGCAGGCaa < 2:632968/137‑1 (MQ=255) aGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGCTTTGGTAGCAGGCaa > 1:632968/1‑137 (MQ=255) cgcTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCACACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCACGGCTTTGGTAGCAGGCAAGAAGCGCGTGCCGTAGCCg < 1:1152484/150‑1 (MQ=255) gcCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGCGGTGGTAGCAGGCAAGAAGCGCGTGCCGTAGCCGGCTGCCGGGa > 1:661098/1‑150 (MQ=255) ccGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTg > 2:1400250/1‑96 (MQ=255) ccGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTg < 1:1400250/96‑1 (MQ=255) ccGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGCTTTGGTAGCAGGCAAGAAGCGCGTGCCGTAGCCGGCTGCCGGGAAc < 1:1387983/150‑1 (MQ=255) ccGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGCTTTGGTAGCAGGCAAGAAGCGCGTGCCGTAGCCGGCTGCCGGGAAc > 2:888795/1‑150 (MQ=255) ggTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGCTTTGGTAGCAGGCAAGAAGCGCGTGCCGTAg < 1:1165743/133‑1 (MQ=255) ggTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGCTTTGGTAGCAGGCAAGAAGCGCGTGCCGTAg > 2:1165743/1‑133 (MQ=255) ggTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGCTTTGGTAGCAGGCAAGAAGCGCGTGCCGTAGCCGGCTGCCGGGAACaa < 1:888795/150‑1 (MQ=255) ggTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCCGCAGCATTTCCTTGGGCATGGCTTTGGTAGCAGGCAAGAAGCGCGTGCCGTAGCCGGCTGCCGGGAACaa < 1:1168510/150‑1 (MQ=255) | GTCTGGCGCGTGTACGAGAACGAGCACTCGTTGAGCAGACGACGAATACCGACCAGGTATTTTTCCTTGTCGGTGCCCTTGATCTGGTTTT‑CCAGCTCGTAGCTGATGTCGAAGTGGTCTTCCAGGGCGCGCTTGCCGCGCCCGGTAACGATGGAGATCTCGTTCAGACCCGCATCCAATGCTTCTTCAACGCCATACTGGATCAGTGGCTTGTTGACCACCGGCAGCATTTCCTTGGGCATGGCTTTGGTAGCAGGCAAGAAGCGCGTGCCGTAGCCGGCTGCCGGGAACAA > NC_002947/4349685‑4349977 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |