New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6055208 | 38 (0.720) | 5 (0.100) | 5/230 | NT | 11.8% | coding (105/732 nt) | tonB | TonB energy transducing system subunit TonB |
? | NC_002947 | = 6055248 | 39 (0.790) | coding (145/732 nt) | tonB | TonB energy transducing system subunit TonB |
AAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCCCAAGATCGCCATCCCCAAGCCGCCCAAGCCGA > NC_002947/6055099‑6055389 | aaGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCCAAGGCGAGCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAAc > 2:691017/1‑150 (MQ=255) gcgcTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCATCACGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGa > 1:630305/1‑150 (MQ=255) tctAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCAACGTTGCCGGAGCCt > 1:999694/1‑150 (MQ=255) aaCATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGAAGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTgcg > 1:1265079/1‑150 (MQ=255) tGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGccac < 2:222803/150‑1 (MQ=255) gTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGATATGTACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCaa < 1:279/150‑1 (MQ=255) tGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTc > 2:1424763/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCa > 2:974204/1‑150 (MQ=255) cTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCg > 1:566897/1‑150 (MQ=255) tGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCgg < 2:630305/150‑1 (MQ=255) gtgtGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGccc < 2:1035329/150‑1 (MQ=255) gtgtGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGccc < 1:974204/150‑1 (MQ=255) cGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGa < 1:691017/150‑1 (MQ=255) tCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGAAGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAac < 2:1265079/150‑1 (MQ=255) tgctgcTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGt > 2:483521/1‑150 (MQ=255) ctgctgACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgacaacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgcca < 2:905843‑M2/150‑84 (MQ=255) tgACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGa > 1:199963/1‑150 (MQ=255) tgACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCAACACACCCAAAGACCGCCGCGCAGCCACCGACCCCTTGCGAGTAACCACCGTTGCCgc > 2:727076/1‑149 (MQ=255) aCGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAg > 1:63544/1‑150 (MQ=255) cTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGa < 2:808713/131‑1 (MQ=255) cTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGa > 1:808713/1‑131 (MQ=255) cTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTg < 1:1006843/150‑1 (MQ=255) aaCTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCaaa > 2:1293808/1‑95 (MQ=255) aaCTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCaaa < 1:1293808/95‑1 (MQ=255) aaCTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCa < 1:925335/150‑1 (MQ=255) tGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGaa > 2:882867/1‑150 (MQ=255) ggTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgt > 2:1340436‑M2/1‑47 (MQ=255) ggTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgt < 1:1340436‑M2/88‑42 (MQ=255) ggTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcc < 1:726027/150‑1 (MQ=255) cacaGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaagc > 2:758688/1‑150 (MQ=255) ccATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCCCAAGa < 2:199963/150‑1 (MQ=255) aTCGAGCTGCCCCCGGCAGCTATGATAGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGTTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCCCAAGATc < 2:293649/150‑1 (MQ=255) aTCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcatcatttcttggctgc < 2:881645‑M2/150‑117 (MQ=255) tCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCCCAAGATCg > 2:980184/1‑150 (MQ=255) cGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCCCAAGATCGc < 1:882867/150‑1 (MQ=255) gCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCCCAAGATCGCCAt > 1:1388346/1‑150 (MQ=255) tGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCCCAAGATCGCCATcc > 1:66052/1‑150 (MQ=255) ccgggggCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCCCAAGATCGCCATcccc < 1:467976/145‑1 (MQ=255) ccGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCCCCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCCAGCCCAAGATCGCCCTCcccaac > 2:143740/1‑149 (MQ=255) cGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCCCAAGATCGCCATCcccaagc < 1:727076/150‑1 (MQ=255) gCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCCCAAGATCGCCATCcccaagccg > 2:1351170/1‑150 (MQ=255) tgatgGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCCCAAGATCGCCATCcccaagccgcccaagc > 1:902946/1‑150 (MQ=255) tgGTCGAACtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcatcatttcttggctgccgtctcgagacctaccagaccgact > 1:881645‑M2/1‑9 (MQ=255) tCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGa < 2:1361932/76‑1 (MQ=255) tCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGa > 1:1361932/1‑76 (MQ=255) gAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCa < 2:550450/56‑1 (MQ=255) gAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCa > 1:550450/1‑56 (MQ=255) | AAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCCCAAGATCGCCATCCCCAAGCCGCCCAAGCCGA > NC_002947/6055099‑6055389 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |