Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,430,392 | G→C | 6.2% | S189S (TCG→TCC) | PP_3045 → | ATP‑dependent protease ClpP |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,430,392 | 0 | G | C | 6.2% | 258.1 / 7.1 | 81 | S189S (TCG→TCC) | PP_3045 | ATP‑dependent protease ClpP |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/42); new base C (3/2); total (37/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.56e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.94e-01 |
GGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATCAGCTCAAGGCCAGTAGGGATGGGGTGACC > NC_002947/3430246‑3430539 | ggTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAg < 2:966735/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGt < 2:1195964/150‑1 (MQ=255) ccGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTgg < 2:1061861/150‑1 (MQ=255) aCCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTgg < 1:446431/150‑1 (MQ=255) aCCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTgg < 1:677716/150‑1 (MQ=255) ccTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTGGATCAGGCATTCGAGGCAATGATCGCAGCCCATAAGGCCACGGCTCCGAACAGCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAAGGCCGAAAGTTGGCTCACGGACTCGGAGGCCGTGGCACTggg > 1:144338/1‑150 (MQ=255) tcgGGTGTCGGCCGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCCCGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGc > 2:134094/1‑150 (MQ=255) gACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGa > 2:236426/1‑119 (MQ=255) gACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGa < 1:236426/119‑1 (MQ=255) aCGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCg < 2:880648/150‑1 (MQ=255) gTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGt < 1:458838/150‑1 (MQ=255) gCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCCGAGGCCGt > 1:1103532/1‑120 (MQ=255) gCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCCGAGGCCGt < 2:1103532/120‑1 (MQ=255) ttGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATg < 2:144338/150‑1 (MQ=255) gATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGgt < 2:1129255/150‑1 (MQ=255) gATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGgt < 1:1072284/150‑1 (MQ=255) gATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGgt > 1:912015/1‑150 (MQ=255) aGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATg < 1:1339046/144‑1 (MQ=255) aGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATg > 2:1339046/1‑144 (MQ=255) cTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGt < 2:548249/150‑1 (MQ=255) ttCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTTGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGtt > 1:83840/1‑150 (MQ=255) ttCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGtt > 1:997509/1‑150 (MQ=255) ttCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGtt > 1:933033/1‑150 (MQ=255) tCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGt > 2:1206625/1‑106 (MQ=255) tCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGt < 1:1206625/106‑1 (MQ=255) aGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAgg > 1:572589/1‑150 (MQ=255) aTGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGc > 2:336775/1‑150 (MQ=255) aTGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACAGCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCGCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGc > 1:1182689/1‑150 (MQ=255) tGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGcc < 1:336775/150‑1 (MQ=255) tCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTg > 2:1253636/1‑95 (MQ=255) tCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTg < 1:1253636/95‑1 (MQ=255) tCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTg > 2:1325478/1‑150 (MQ=255) gCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCaa < 2:758776/150‑1 (MQ=255) ccTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAg < 2:572589/150‑1 (MQ=255) tataAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATg < 2:670688/118‑1 (MQ=255) tataAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATg > 1:670688/1‑118 (MQ=255) tataAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGgc > 2:772486/1‑150 (MQ=255) aGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCgcgg < 2:997509/150‑1 (MQ=255) gCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCgcggcg > 2:1402737/1‑150 (MQ=255) cAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGAt < 2:1099702/150‑1 (MQ=255) aaGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGgc < 2:1408691/80‑1 (MQ=255) aaGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGgc > 1:1408691/1‑80 (MQ=255) aaGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATg > 1:396346/1‑150 (MQ=255) ggCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGgc < 2:1137389/150‑1 (MQ=255) cTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGgcgc < 2:912015/150‑1 (MQ=255) tCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGAt > 2:66584/1‑144 (MQ=255) tCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGAt < 1:66584/144‑1 (MQ=255) ccGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGt < 1:569394/150‑1 (MQ=255) gAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAg < 1:441134/109‑1 (MQ=255) gAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAg > 2:441134/1‑109 (MQ=255) gcgGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGgcgc > 1:89447/1‑133 (MQ=255) gcgGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGgcgc < 2:89447/133‑1 (MQ=255) gAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCaa < 1:134094/150‑1 (MQ=255) gagaCGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCt > 2:260999/1‑150 (MQ=255) ttCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGAAAATATGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTgg < 1:865658/149‑1 (MQ=255) gTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGCCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTgg > 1:373719/1‑150 (MQ=255) tCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCACGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCCCAATTCCCCGCAAGTCCTATTGGa < 2:414761/150‑1 (MQ=255) tCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTAtt < 1:383807/147‑1 (MQ=255) tCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTAtt > 2:383807/1‑147 (MQ=255) cTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGATGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCTTTGCGAGAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGAt < 1:1106299/150‑1 (MQ=255) tGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTGAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATc > 1:1157043/1‑150 (MQ=255) tGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATc > 2:323088/1‑150 (MQ=255) tGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCACGGAGCCCGTGGCTCGGGGAGTGGCCTGGGAGGTCGGGTTTGGTCTCAAGAAACCGCGCCGCTGTTGTTTAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACGCCGCAAGGCCTGTTTGATc > 1:678645/1‑150 (MQ=255) gTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATCAg > 2:1176490/1‑150 (MQ=255) gTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGACGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATCAg > 1:481566/1‑150 (MQ=255) tCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATCAGc < 1:203726/150‑1 (MQ=255) tCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATCAGc < 1:772486/150‑1 (MQ=255) ggCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGCCAGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCTTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATCAGCTCAAGGCCAGTAggg > 1:603510/1‑150 (MQ=255) cTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATCAGCTCAAGGCCAGTAGGGAt > 2:573037/1‑150 (MQ=255) tCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATCAGCTCAAGGCCAGTAGGGATg < 2:550735/150‑1 (MQ=255) tCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATCAGCTCAAGGCCAGTAGGGATg > 1:550735/1‑150 (MQ=255) ccACGGCCTCCGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTAcc < 2:81648/101‑1 (MQ=255) ccACGGCCTCCGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTAcc > 1:81648/2‑102 (MQ=255) cACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATCAGCTCAAGGCCAGTAGGGATgg < 1:323088/150‑1 (MQ=255) cACGGCCTCCGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATCAGCTCAAGGCCAGTAGGGATgg > 1:1404700/1‑150 (MQ=255) aCGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATCAGCTCAAGGCCAGTAGGGATggg < 1:1402737/150‑1 (MQ=255) ggCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGt > 2:1302844/1‑65 (MQ=255) ggCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGt < 1:1302844/65‑1 (MQ=255) gCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATCAGCTCAAGGCCAGTAGGGATGGGGTg < 1:1176490/150‑1 (MQ=255) cTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGCTGCCGTGCTCAAGGTTTTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATCAGCTCAAGGCCAGTAGGGATGGGGTGAc < 2:1182689/150‑1 (MQ=255) tCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATCAGCTCAAGGCCAGTAGGGATGGGGTGAcc < 2:396346/150‑1 (MQ=255) | GGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGAGCTGAGACGTCTGGTCAATGCCGAAAGTTGGCTCACGGCCTCGGAGGCCGTGGCGCTGGGGCTGGCCGATGAGGTCGGTAATGGTGTCAAGGTTCAGGCGTGCCTTGGGCAAGGCGCGGCGATGGCGCGTTACCGCAATACCCCGCAAGCCCTATTGGATCAGCTCAAGGCCAGTAGGGATGGGGTGACC > NC_002947/3430246‑3430539 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |