Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,916,544 | C→G | 5.9% | A94A (GCC→GCG) | mexB → | multidrug resistance protein MexB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,916,544 | 0 | C | G | 5.9% | 217.4 / 4.5 | 68 | A94A (GCC→GCG) | mexB | multidrug resistance protein MexB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/32); new base G (2/2); total (34/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.32e-01 |
TACGCCGTGTACCCGGGTGCCTCGGCGGCGACCATGGACGAAAGCGTGGTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGAAAGTGTCCACCGGCTTCCTGCTGTTGGCGACCCTCACCTCC > NC_002947/3916398‑3916691 | tACGCCGTGTACCCGGGTGCCTCGGCGGCGACCATGGACGAAAGCGTGGTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCg > 1:159426/1‑150 (MQ=255) aCGCCGTGTACCCGGGTGCCTCGGCGGCGACCATGGACGAAAGCGTGGTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCgg < 1:1269764/150‑1 (MQ=255) tgtACCCGGGTGCCTCGGCGGCGACCATGGACGAAAGCGTGGTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTaccc < 1:1032218/150‑1 (MQ=255) tACCCGGGTGCCTCGGCGGCGACCATGGACGAAAGCGTGGTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTacccac < 2:693791/150‑1 (MQ=255) ccGGGTGCCTCGGCGGCGACCATGGACGAAAGCGTGGTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCg > 1:111003/1‑150 (MQ=255) gggTGCCTCGGCGGCGACCATGGACGAAAGCGTGGTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCATGGGCAGCGCCACCATCACCGACAACTTCGCCCCGGTTACACACCCggc > 2:620054/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCGGCGACCATGGACGAAAGCGTGGTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTgg < 2:969250/150‑1 (MQ=255) ccTCGGCGGCGACCATGGACGAAAGCGTGGTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTgg < 2:1185741/150‑1 (MQ=255) cTCGGCGGCGACCATGGACGAAAGCGTGGTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGc > 2:859933/1‑150 (MQ=255) gcggcgACCATGGACGAAAGCGTGGTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAg < 1:414157/150‑1 (MQ=255) gcgACCATGGACGAAAGCGTGGTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTc > 1:1357602/1‑150 (MQ=255) gACCATGGACGAAAGCGTGGTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGa > 1:971816/1‑150 (MQ=255) tGGACGAAAGCGTGGTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGc > 1:357692/1‑150 (MQ=255) gAAAGCGTGGTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAAc > 2:136966/1‑150 (MQ=255) gTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGaaa > 2:474019/1‑150 (MQ=255) gTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGaaa < 1:529379/150‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGaaa < 2:1239277/150‑1 (MQ=255) aGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTg > 2:776812/1‑150 (MQ=255) ccTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGt < 2:1357602/150‑1 (MQ=255) aGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGaa < 1:8182/124‑1 (MQ=255) aGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGaa > 2:8182/1‑124 (MQ=255) aggtCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGc < 2:1109536/147‑1 (MQ=255) cGGCGCCGACAACCTTCTGCACTTCCAGTCGCACATCAGCCTGGCCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGTGACCCACCCGGACCGGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGccc < 1:620054/150‑1 (MQ=255) ccGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCa < 1:474019/150‑1 (MQ=255) gACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCgg > 1:1111709/1‑70 (MQ=255) gACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCgg < 2:1111709/70‑1 (MQ=255) gACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTAGCGCCTGCCGCGCCCGGTCAcc > 1:636911/1‑150 (MQ=255) tgctgTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAgg < 2:357692/150‑1 (MQ=255) tgctgTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAgg > 1:1160734/1‑150 (MQ=255) ctgTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGc > 2:852862/1‑150 (MQ=255) cTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGt < 2:1387943/87‑1 (MQ=255) cTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGt > 1:1387943/1‑87 (MQ=255) ttCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCTCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAg < 2:952688/150‑1 (MQ=255) ttCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGcccc < 2:175227/53‑1 (MQ=255) ttCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGcccc > 1:175227/1‑53 (MQ=255) ttCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTg > 2:335015/1‑105 (MQ=255) ttCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTg < 1:335015/105‑1 (MQ=255) ttCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAgg > 1:722899/1‑142 (MQ=255) ttCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAgg < 2:722899/142‑1 (MQ=255) ttCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCGGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAg > 1:810723/1‑150 (MQ=255) cGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGt > 1:911545/1‑150 (MQ=255) cGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGt < 2:1160734/150‑1 (MQ=255) gAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTg < 1:776812/150‑1 (MQ=255) gAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTg < 1:852862/150‑1 (MQ=255) cAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGaaa < 1:136966/150‑1 (MQ=255) agagCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGAAAg > 1:283927/1‑150 (MQ=255) gagCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCGCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGc < 2:346796/137‑1 (MQ=255) gagCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCGCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGc > 1:346787/1‑137 (MQ=255) gagCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCGCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGc > 1:346796/1‑137 (MQ=255) gagCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCGCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGc < 2:346787/137‑1 (MQ=255) gcCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGc > 1:963622/1‑128 (MQ=255) gcCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGc < 2:963622/128‑1 (MQ=255) gcCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCAACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGGGGAGAAAGTGTCCa > 2:636228/1‑150 (MQ=255) tGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGAAAGTGTCCACCg > 1:1142364/1‑150 (MQ=255) gcCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCcagc < 1:670553/112‑1 (MQ=255) gcCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCcagc > 2:670553/1‑112 (MQ=255) ccaccaTAACCGCCACCTTCGACCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGAAAGTGTCCACCGGCTTCctgc < 1:506252/150‑1 (MQ=255) ccaTCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCGGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGCTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGAAAGTGTCCACCGGCTTCCTGCTGt > 1:87298/1‑150 (MQ=255) caTCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGa > 1:85863/1‑78 (MQ=255) caTCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGa < 2:85863/78‑1 (MQ=255) caTCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACGCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGAAAGTGTCCACCGGCTTCCTGCTGtt > 1:1224615/1‑150 (MQ=255) aCCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGAAAGTGTCCACCGGCTTCCTGCTGTTGGCg > 1:109198/1‑150 (MQ=255) ccGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGAAAGTGTCCACCGGCtt > 2:618519/1‑136 (MQ=255) ccGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGAAAGTGTCCACCGGCtt < 1:618519/136‑1 (MQ=255) gCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGAAAGTGTCCACCGGCTTCCTGCTGTTGGCGAcc > 2:1007735/1‑150 (MQ=255) ccACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGAAAGTGTCCACCGGCTTCCTGCTGTTGGCGAccc < 2:1120768/150‑1 (MQ=255) cTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCGGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGAAAGTGTCCACCGGCTTCCTGCTGTTGGCGACCCTCAc < 2:87298/150‑1 (MQ=255) cTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGAAAGTGTCCACCGGCTTCCTGCTGTTGGCGACCCTCAc > 1:1332663/1‑150 (MQ=255) cTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGAAAGTGTCCACCGGCTTCCTGCTGTTGGCGACCCTCAc < 2:1142364/150‑1 (MQ=255) gCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGAAAGTGTCCACCGGCTTCCTGCTGTTGGCGACCCTCACCTcc < 1:859933/150‑1 (MQ=255) | TACGCCGTGTACCCGGGTGCCTCGGCGGCGACCATGGACGAAAGCGTGGTCAGCCTGATCGAACAGGAGCTCAACGGCGCCGACAACCTGCTGTACTTCGAGTCGCAGAGCAGCCTGGGCAGCGCCACCATCACCGCCACCTTCGCCCCGGGTACCCACCCGGACCTGGCCCAGGTCGACGTGCAGAACCGCCTGAAAGTGGTCGAGTCGCGCCTGCCGCGCCCGGTCACCCAGCAGGGCCTGCAGGTGGAGAAAGTGTCCACCGGCTTCCTGCTGTTGGCGACCCTCACCTCC > NC_002947/3916398‑3916691 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |