Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,958,228 | A→T | 9.1% | L734H (CTT→CAT) ‡ | mnxG ← | manganese‑oxidizing multicopper oxidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,958,228 | 0 | A | T | 9.1% | 232.1 / 12.3 | 77 | L734H (CTT→CAT) ‡ | mnxG | manganese‑oxidizing multicopper oxidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/33); new base T (3/4); total (40/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.05e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.71e-01 |
TGCATGGCTGCCTGCTCGACATCGGTGCCCTCTTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAGGGGCGGGGTTGGCGGGCGGTTGCCCACGCTGCTTTCCATGCCACC > NC_002947/3958084‑3958376 | tGCATGGCTGCCTGCTCGACATCGGTGCCCTCTTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGgccg < 2:963307/150‑1 (MQ=255) cATGGCTGCCTGCTCGACATCGGTGCCCTCTTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGgccgcc > 1:1257652/1‑150 (MQ=255) aTGGCTGCCTGCTCGACATCGGTGCCCTCTTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGccgccg < 2:441613/150‑1 (MQ=255) aTGGCTGCCTGCTCGACATCGGTGCCCTCTTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCACGGCGGCCTTGgccgcca < 2:292507/150‑2 (MQ=255) tGGCTGCCTGCTCGACATCGGTGCCCTCTTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGt > 1:998369/1‑150 (MQ=255) gCTGCCTGCTCGACATCGGTGCCCTCTTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTcc < 1:917727/150‑1 (MQ=255) gCTGCCTGCTCGACATCGGTGCCCTCTTCCGGCAGGTAGATCGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTcc < 2:975561/150‑1 (MQ=255) cTCGACATCGGTGCCCTCTTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATc < 1:723346/150‑1 (MQ=255) tCGACATCGGTGCCCTCTTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCg > 1:152078/1‑150 (MQ=255) aCATCGGTGCCCTCTTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGAcc > 1:1252788/1‑150 (MQ=255) gTGCCCTCTTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTc > 2:264918/1‑150 (MQ=255) gTGCCCTCTTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTc < 2:253689/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGTCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCTGTTTGGTGGTGGTGTTAGCCGCTACGCGACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCAt > 1:677750/1‑150 (MQ=255) ctctTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCTTGgccgccat > 2:685729/1‑123 (MQ=255) ctctTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCTTGgccgccat < 1:685729/125‑3 (MQ=255) ctctTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATc > 2:822018/1‑150 (MQ=255) tctTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCTTGgccgccat > 2:1376177/1‑122 (MQ=255) tctTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCTTGgccgccat < 1:1376177/124‑3 (MQ=255) ctTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCa < 2:1257652/150‑1 (MQ=255) ttCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAg < 2:674556/114‑1 (MQ=255) ttCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGACGTCCAGTGCATGGCGGCCAAg > 1:674556/1‑114 (MQ=255) tCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAgg < 1:1081100/150‑1 (MQ=255) ccGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGt < 2:788411/150‑1 (MQ=255) gCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTgg > 1:1162466/1‑150 (MQ=255) aGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCcaca < 2:1252788/150‑1 (MQ=255) gATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAg > 1:333178/1‑150 (MQ=255) gATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAg > 2:324358/1‑150 (MQ=255) tGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAggg > 1:527978/1‑150 (MQ=255) ttaaccctgtgCAAGAGCTTGGTGGAGTCGAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCGGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCAGAGGGCTTTa > 2:448861/8‑150 (MQ=255) tGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTAc < 2:1162466/150‑1 (MQ=255) cTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAggg > 1:592969/1‑140 (MQ=255) cTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAggg < 2:592969/140‑1 (MQ=255) cTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACt < 2:998369/150‑1 (MQ=255) tgtgCACGACCTTGGTGAAGGCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGt < 2:152078/150‑1 (MQ=255) cACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCcaca < 2:633970/131‑1 (MQ=255) cACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCcaca > 1:633970/1‑131 (MQ=255) cACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAggg > 1:1135135/1‑134 (MQ=255) cACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAggg < 2:1135135/134‑1 (MQ=255) gACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAg > 1:1300168/1‑150 (MQ=255) cTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATTGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTAc > 2:888135/1‑134 (MQ=255) cTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATTGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTAc < 1:888135/134‑1 (MQ=255) tGAAGTCCCGATTGGAGCTGGTGGTATCCGCTACGCCACGGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCggg > 2:703388/1‑150 (MQ=255) tGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCggg > 1:1343535/1‑150 (MQ=255) gAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGc > 2:889843/1‑150 (MQ=255) tgctgTTTGGTGGTGGTGTTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAgg > 2:733220/5‑150 (MQ=255) cAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCTTGgccgcca > 1:851990/1‑72 (MQ=255) cAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCTTGgccgcca < 2:851990/73‑2 (MQ=255) cAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGc > 2:890738/1‑150 (MQ=255) aGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCa > 2:1109339/1‑100 (MQ=255) aGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCa < 1:1109339/100‑1 (MQ=255) gTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCg > 1:294957/1‑150 (MQ=255) tttGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGccag < 1:837550/150‑3 (MQ=255) tggtggtggtATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGa < 1:1049124/150‑1 (MQ=255) tggtggtggtATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGa < 1:890738/150‑1 (MQ=255) tggtATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGt > 1:59568/1‑150 (MQ=255) gtATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTcc > 1:1115928/1‑150 (MQ=255) tCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACGGTCGTTCAGTTGTCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAgg > 2:1328287/1‑150 (MQ=255) ccGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAggt < 1:889843/150‑2 (MQ=255) aCGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAGGGGCggg < 2:294957/150‑1 (MQ=255) aCGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCAATCGACTTGCTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAGGGGCggg < 1:324358/150‑1 (MQ=255) gCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAGGGGCGGGGt > 2:761124/1‑150 (MQ=255) cACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGc > 1:832298/1‑131 (MQ=255) cACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGc < 2:832298/131‑1 (MQ=255) cACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCATGGGCGGGGTTg > 2:961937/1‑150 (MQ=255) ggcggAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAGGTGCGGGGTTggcgg < 2:677750/150‑1 (MQ=255) ggAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAGGGGCGGGGTTggcggcag < 1:761124/150‑4 (MQ=255) gaCGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAGGGGCGGGGTTGGCGGGCGGtt < 1:733220/150‑1 (MQ=255) gaCGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAGGGGCGGGGTTGGCGGGCGGtt < 2:59568/150‑1 (MQ=255) gCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGt > 1:1419124/1‑122 (MQ=255) gCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGt < 2:1419124/122‑1 (MQ=255) gCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAGGGGCGGGGTTGGCGGGCGGTTGcc > 2:997063/1‑150 (MQ=255) gTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCTGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAGGGGCGGGGTTGGCGGGCGGTTGCCCAc > 2:331280/1‑150 (MQ=255) aGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTGGACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAGGGGCGGGGTTGGCGGGCGGTTGCCCACgctg > 1:460899/1‑150 (MQ=255) cATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAGGGGCGGGGTTGGCGGGCGGTTGCCCACGCTGCttt > 1:1179286/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAGGGGCGGGGTTGGCGGGCGGTTGCCCACGCTGCTTTcc < 2:1115928/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAGGGGCGGGGTTGGCGGGCGGTTGCCCACGCTGCTTTcc > 1:997040/1‑150 (MQ=255) ggcCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCTGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAGGGGCGGGGTTGGCGGGCGGTTGCCCACGCTGCTTTCCATGc < 1:331280/150‑1 (MQ=255) aaGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCATGGGCGGGGTTGGCGGGCGGTTGCCCACGCTGCTTTCCATGCCAcc < 1:961937/150‑1 (MQ=255) | TGCATGGCTGCCTGCTCGACATCGGTGCCCTCTTCCGGCAGGTAGATGGGCTTGGCCTTGTGCACGACCTTGGTGAAGTCCAGTTTGGTGGTGGTGGTATCCGCTACGCCACCGGCGGAGACGCCGTCCAGTGCATGGCGGCCAAGGCCGCCGTCCCAGCCATCGACCTGGTTCGCATCCAGGTTGGCCCACAGGGCTTTACCACTGTCTTTCAGTTGCCGGGCCAGGGCCGGGTCGAGCATGTCCAGGGGCGGGGTTGGCGGGCGGTTGCCCACGCTGCTTTCCATGCCACC > NC_002947/3958084‑3958376 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |