| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,980,198 | T→A | 6.6% | Q159H (CAA→CAT) | cobN ← | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,980,198 | 0 | T | A | 6.6% | 242.8 / 6.7 | 77 | Q159H (CAA→CAT) | cobN | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/37); new base A (2/3); total (37/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.42e-01 | |||||||||||
CGGTAGAACAGCAGCGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAG > NC_002947/3980052‑3980347 | cGGTAGAACAGCAGCGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATtgg < 1:686729/150‑1 (MQ=255) aaCAGCAGCGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGcc > 1:1424937/1‑150 (MQ=255) aaCAGCAGCGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCAAtggct‑gggc < 1:1257028/150‑3 (MQ=255) aaCAGCAGCGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCATTGGCGGAGTGATAGACCGCCTGGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCAAtggct‑gggc < 1:884225/150‑3 (MQ=255) agcagcGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAgg > 2:440061/1‑150 (MQ=255) cagcGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCa < 2:927929/150‑1 (MQ=255) gTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGa > 2:827072/1‑150 (MQ=255) ccACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACa > 2:635562/1‑150 (MQ=255) tGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAg > 2:855752/1‑147 (MQ=255) tGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAg < 1:855752/147‑1 (MQ=255) tgctCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATg > 1:1294234/1‑150 (MQ=255) ggggTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGtt < 1:1025585/150‑1 (MQ=255) gTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCCGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGc > 1:778083/1‑150 (MQ=255) gTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGc > 2:64509/1‑150 (MQ=255) gTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGc < 1:827072/150‑1 (MQ=255) cattgtgGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGTCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTg < 1:1427577/147‑1 (MQ=255) aGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTgc < 1:1318002/150‑1 (MQ=255) aGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCACGCCTCAGGGT‑GAGCGGTTGCGTTAGCAGGTTGATGGCGTTGGCCTTgc > 1:1384672/1‑150 (MQ=255) gTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTg > 1:1067823/1‑150 (MQ=255) aCCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGgc > 2:274220/1‑150 (MQ=255) aGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCa > 2:453702/1‑150 (MQ=255) aGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCa > 1:667692/1‑150 (MQ=255) gTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAg < 2:778083/150‑1 (MQ=255) tCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAgg < 1:321628/150‑1 (MQ=255) cTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGTCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTa < 1:860940/150‑1 (MQ=255) cTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCGGGTa > 1:769071/1‑150 (MQ=255) tCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGaa > 2:297858/1‑110 (MQ=255) tCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGaa < 1:297858/110‑1 (MQ=255) tCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTgg < 2:920714/127‑1 (MQ=255) tCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTgg > 1:920714/1‑127 (MQ=255) cGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAAt < 1:858267/150‑1 (MQ=255) cGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAAt < 2:1067823/150‑1 (MQ=255) cGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCCCAGGTAAt < 1:904957/150‑1 (MQ=255) gAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATg < 2:591317/150‑1 (MQ=255) aGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGc < 1:453702/150‑1 (MQ=255) gtCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCaa > 1:46862/1‑150 (MQ=255) tCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGc < 1:310983/96‑1 (MQ=255) tCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGc > 2:310983/1‑96 (MQ=255) tCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCaaa < 2:622195/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCGGGTAATGCCAAAGc < 2:769071/150‑1 (MQ=255) gCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTc < 1:82106/150‑1 (MQ=255) cccTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGaa > 1:633192/1‑95 (MQ=255) cccTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGaa < 2:633192/95‑1 (MQ=255) ccTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAgg > 1:1197764/1‑131 (MQ=255) ccTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAgg < 2:1197764/131‑1 (MQ=255) gCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCa < 1:1282636/124‑1 (MQ=255) gCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCa > 2:1282636/1‑124 (MQ=255) gggTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCa > 1:619285/1‑150 (MQ=255) gTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGTCTGCGGCTCGTCCTAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGTCCTGCTCAcc < 2:1361631/150‑1 (MQ=255) gTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCAcc > 2:1045530/1‑150 (MQ=255) gTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGACATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCAcc > 2:1411832/1‑150 (MQ=255) gATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCCCcgc > 1:240087/1‑150 (MQ=255) aTAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAgg < 1:327390/85‑1 (MQ=255) aTAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAgg > 2:327390/1‑85 (MQ=255) gccgTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTg < 1:274220/150‑1 (MQ=255) tGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCa < 2:46862/150‑1 (MQ=255) gcgGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGc < 1:64509/150‑1 (MQ=255) tCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCaaa > 2:876065/1‑97 (MQ=255) tCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCaaa < 1:876065/97‑1 (MQ=255) gTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCtccgggtccgg < 1:1045530/150‑1 (MQ=255) aTAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAg > 2:850278/1‑120 (MQ=255) aTAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAg < 1:850278/120‑1 (MQ=255) tCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCtccgg < 1:568040/131‑1 (MQ=255) tCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCtccgg > 2:568040/1‑131 (MQ=255) tCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGccc < 1:1422859/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGccc < 1:635562/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGccc < 1:832545/150‑1 (MQ=255) gcgGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCACCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCgg > 2:1009387/1‑150 (MQ=255) tggccAGCCAATGGCTGGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGtt > 1:1426603/4‑107 (MQ=255) tggccAGCCAATGGCTGGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGtt < 2:1426603/104‑1 (MQ=255) tggccAGCCAATGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCa > 1:1333549/4‑150 (MQ=255) gCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTCCCCAGGCt > 2:579797/1‑114 (MQ=255) gCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTCCCCAGGCt < 1:579797/114‑1 (MQ=255) cATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATc > 2:1154216/1‑150 (MQ=255) aTTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCa > 2:1147191/1‑150 (MQ=255) aTTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCa > 1:549138/1‑150 (MQ=255) aTTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCa > 2:1361232/1‑150 (MQ=255) ttGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAg < 2:1424937/150‑1 (MQ=255) | CGGTAGAACAGCAGCGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGGTGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCT‑GGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAG > NC_002947/3980052‑3980347 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |