| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,027,194 | T→A | 11.2% | D427V (GAC→GTC) | PP_3552 ← | two‑component system sensor histidine kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,027,194 | 0 | T | A | 11.2% | 198.9 / 14.1 | 72 | D427V (GAC→GTC) | PP_3552 | two‑component system sensor histidine kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/30); new base A (4/4); total (38/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.74e-01 | |||||||||||
CTTGCAACACTGCCTCCCCTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCAGAGCAGGATACGTGACGGCCGCTCCCCCTGCTGCTC > NC_002947/4027048‑4027342 | cttgcAACACTGCCTCCCCTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCgg < 1:29418/150‑1 (MQ=255) ttgcAACACTGCCTCCCCTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGc > 1:509193/1‑150 (MQ=255) ttgcAACACTGCCTCCCCTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCGCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGc > 2:784558/1‑150 (MQ=255) cgatcTGCCTCCCCTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCATTCTGTCAGGCTTCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGACGGCCtgg < 1:36749/146‑3 (MQ=255) acacTGCCTCCCCTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGc < 2:135826/150‑1 (MQ=255) acacTGCCTCCCCTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGc > 1:1305318/1‑150 (MQ=255) cTGCCTCCCCTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCtgg < 2:913702/150‑1 (MQ=255) tGCCTCCCCTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGACGGCCtgggct > 1:186634/1‑143 (MQ=255) tGCCTCCCCTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGACGGCCtgggct < 2:186634/148‑6 (MQ=255) gCCTCCCCTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCtggtg < 1:1133631/150‑1 (MQ=255) gCCTCCCCTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCtggtg < 1:1373285/150‑1 (MQ=255) gCCTCCCCTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCtggtg < 1:182455/150‑1 (MQ=255) ccTCCCCTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTTCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCACGCCGGCCGCCGTggagttcg > 2:36749/1‑143 (MQ=255) ccccTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCAGCCGCCCGGAGCCGGAGCTACTTTGTCGCCCGCCCGCGCCCACAGCATGCCCGCCCCTGCTTTGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTAGCTGGTGGTaa > 1:324664/1‑150 (MQ=255) cccTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGcc < 2:208127/136‑1 (MQ=255) cccTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGcc > 1:208127/1‑136 (MQ=255) tGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATc > 1:430724/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATc > 1:1017192/1‑150 (MQ=255) 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acaGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTg > 2:182795/1‑150 (MQ=255) caGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGc < 2:430724/150‑1 (MQ=255) aGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGcc < 1:620694/150‑1 (MQ=255) aGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGcc < 1:1205122/150‑1 (MQ=255) tACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCAc < 2:1017192/150‑1 (MQ=255) cAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGACGGCCtgggc < 1:170167/102‑5 (MQ=255) cAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGACGGCCtgggc > 2:170167/1‑98 (MQ=255) aCCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCgg < 1:182795/150‑1 (MQ=255) cgccgTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGc > 1:908278/1‑150 (MQ=255) cgTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCt > 1:343442/1‑150 (MQ=255) ttGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAAAAGAGGTCGTCGGCCTTCGGGGTTTTTAACGGCGGGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTgg < 1:531906/150‑1 (MQ=255) gTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTTTTGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTc < 2:399636/150‑1 (MQ=255) tCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCa < 2:1251276/150‑1 (MQ=255) ccgcccgcGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTa > 1:1147582/1‑150 (MQ=255) ccgcccgcGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGGGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTa > 1:489622/1‑150 (MQ=255) cgcccgcGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTAc > 1:1132917/1‑150 (MQ=255) ccgcGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTc > 1:1277530/1‑150 (MQ=255) cgcCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGAc < 2:1305318/150‑1 (MQ=255) cacaGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAgg < 1:1252545/150‑1 (MQ=255) acaGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCTGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGa > 2:923657/1‑150 (MQ=255) acaGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCtg > 2:456679/1‑74 (MQ=255) acaGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCtg < 1:456679/74‑1 (MQ=255) caGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGAc < 2:324664/150‑1 (MQ=255) gCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGAcccc > 1:1076988/1‑150 (MQ=255) gAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCtggtgg > 1:117414/1‑65 (MQ=255) gAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCtggtgg < 2:117414/65‑1 (MQ=255) ttCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCgcgcgc > 2:800826/1‑150 (MQ=255) ggCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCaga > 2:171436/1‑150 (MQ=255) tGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCAGAGCa < 2:1122358/150‑1 (MQ=255) gCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCAGAGCAg < 2:564029/150‑1 (MQ=255) cTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCAGAGCAGGATa < 2:1132917/150‑1 (MQ=255) tCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGa > 1:922080/1‑57 (MQ=255) tCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGa < 2:922080/57‑1 (MQ=255) tCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGAt < 1:810003/58‑1 (MQ=255) tCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGAt > 2:810003/1‑58 (MQ=255) gCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCAGAGCAGGATACGTGa < 2:1147582/150‑1 (MQ=255) tCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGa > 2:430111/1‑108 (MQ=255) tCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGa < 1:430111/108‑1 (MQ=255) tCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCAGAGCAGGATACGTGACg > 1:781024/1‑150 (MQ=255) tCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACATCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCAGAGCAGGATACGTGACg > 1:983068/1‑150 (MQ=255) caagcccaGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCAGAGCAGGATACGTGACGGCCGCTc > 2:1153977/1‑150 (MQ=255) cagcaaGGCCGACGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCAGAGCAGGATACGTGACGGCCGCTccc > 2:1019759/6‑150 (MQ=255) gcaaGGCCGACGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCagag < 2:832784/122‑1 (MQ=255) gcaaGGCCGACGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCagag > 1:832784/4‑125 (MQ=255) ccaGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCAGAGCAGGATACGTGACGGCCGCTCCCCct > 2:225931/1‑150 (MQ=255) aGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCAGAGCAGGATACGTGACGGCCGCTCCCCctgc < 1:955846/150‑1 (MQ=255) ggCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCAGAGCAGGATACGTGACGGCCGCTCCCCctgct > 2:1163330/1‑150 (MQ=255) ccGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCAGAGCAGGATACGTGACGGCCGCTCCCCCtgctgc < 2:441092/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCAGAGCAGGATACGTGACGGCCGCTCCCCCTGCTGCTc > 1:1233371/1‑150 (MQ=255) | CTTGCAACACTGCCTCCCCTTATTCCCTGCTGACTGCCAGCCGGCAGCACAGTACCAGACCGCCGTTGTCACCCGCCCGCGCCCACAGGCTGCCACCGAAGCCTTCGATCAGGCTGCGGCTCATGCTCAAGCCCAAGCCCAGGCCGTCGGCCTTGCTGGTGGTAAACGGCGTGAAGATTTCATCCAGCCGCTCGGGTGCCACGCCCGGGCCCTGGTCAGCTACCTCGACCAGGACCCCATCGCCATCGCGCGCCGCGCAGAGCAGGATACGTGACGGCCGCTCCCCCTGCTGCTC > NC_002947/4027048‑4027342 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |