| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,132,635 | C→T | 5.4% | L190L (CTG→CTA) | PP_3636 ← | sulfonate ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,132,635 | 0 | C | T | 5.4% | 217.3 / 2.4 | 74 | L190L (CTG→CTA) | PP_3636 | sulfonate ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/42); new base T (2/2); total (30/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.66e-01 | |||||||||||
ACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTACCACATTGTGGATCGAGTACCAGAACGGAATGGCCACTGTCTT > NC_002947/4132486‑4132772 | acGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGgc > 2:651574/1‑150 (MQ=255) gcagcaCGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGgcag < 1:613836/150‑1 (MQ=255) agcaCGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGgcagca < 2:980888/150‑1 (MQ=255) gcaCGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAACGCGCTACACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCAc < 2:263736/150‑1 (MQ=255) gcaCGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCAc > 1:997875/1‑150 (MQ=255) aCGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACca < 1:651574/150‑1 (MQ=255) aTGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACcagcag > 2:733745/1‑150 (MQ=255) tGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAgg < 2:997875/150‑1 (MQ=255) tcggcaaaCATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGAc > 2:925301/8‑150 (MQ=255) cATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGACTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCg > 1:846237/1‑150 (MQ=255) aTACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTGAAACAAGGC‑CGG‑‑GCGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGt < 1:957759/150‑1 (MQ=255) aTACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGt < 1:733745/150‑1 (MQ=255) tACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTTGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGtt < 1:598995/150‑1 (MQ=255) tACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGtt < 1:120727/150‑1 (MQ=255) aTCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGt < 1:335114/146‑1 (MQ=255) aTCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGt > 2:335114/1‑146 (MQ=255) aTCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTggc > 1:1042407/1‑150 (MQ=255) tCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGGGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTggcg < 1:1270652/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTggcg > 2:296219/1‑150 (MQ=255) ccGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGcc > 1:43427/1‑150 (MQ=255) cGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCa < 1:931992/150‑1 (MQ=255) tAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGtt < 2:139580/150‑1 (MQ=255) gcTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCAt > 1:234039/1‑150 (MQ=255) tGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGAc > 1:684149/1‑125 (MQ=255) tGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGAc < 2:684149/125‑1 (MQ=255) aCGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGcc < 2:778905/150‑1 (MQ=255) tACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGa < 2:432726/150‑1 (MQ=255) tcGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCg > 2:153145/1‑105 (MQ=255) tcGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCg < 1:153145/105‑1 (MQ=255) cactGCATTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGACGGCAATGTGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGtt < 2:234039/147‑1 (MQ=255) cAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGtt < 2:104376/150‑1 (MQ=255) cAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGtt < 1:296219/150‑1 (MQ=255) aGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGTAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTg > 2:178942/1‑150 (MQ=255) aGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGTAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTg > 2:178947/1‑150 (MQ=255) gTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTTGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGtt < 1:971242/150‑1 (MQ=255) ttG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGTAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTg < 1:178947/150‑1 (MQ=255) ttG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGTAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTg < 1:178942/150‑1 (MQ=255) g‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAg > 2:1385518/1‑150 (MQ=255) c‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCaa < 2:43427/150‑1 (MQ=255) cTCGGCAACGATGTAACCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTg > 2:358130/1‑150 (MQ=255) tCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGt > 2:624203/1‑150 (MQ=255) aaCGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGAATTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAg > 2:691771/1‑150 (MQ=255) aaCGAAGTAGCTGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAg > 2:415472/1‑150 (MQ=255) cGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTa < 2:1324003/150‑1 (MQ=255) gATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTAc < 2:1042407/150‑1 (MQ=255) tGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTACca > 1:100227/1‑150 (MQ=255) tGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTACca < 2:846237/150‑1 (MQ=255) aGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGtt < 2:537081/121‑1 (MQ=255) aGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGtt > 1:537081/1‑121 (MQ=255) cGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTACTACATtgt < 1:691771/150‑1 (MQ=255) cGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTACCACATtgt < 1:624203/150‑1 (MQ=255) ggCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGCCACCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTACCACATtgtg < 1:737730/150‑1 (MQ=255) gCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTACCACATTGTgg < 2:340242/150‑1 (MQ=255) ttGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTACCACATTGTGGATCGAGTAc < 1:1038168/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTACCACATTGTGGACCGAGTAcc < 1:886888/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACgg > 1:366519/1‑90 (MQ=255) tGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACgg < 2:366519/90‑1 (MQ=255) tGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTACcaca > 2:1384398/1‑131 (MQ=255) tGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTACcaca < 1:1384398/131‑1 (MQ=255) tGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGAAGCACCAGCAGGTGGACTTCGTTGGAGAAACGTTGCGCGTTGGAGGTACGTCTA‑ACCTTGGTATATCCGACCTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTACAACATTGTGGACCGAGTACCAGa > 1:324681/1‑150 (MQ=255) gCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGTGCGTCAGACCGTTGTCGTTGAGGAACGGTTGCAGTACCACATTGTGGATCGAGTACCAGAAc > 1:435556/1‑150 (MQ=255) 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tGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTACCACATTGTGGATCGAGTACCAGAACGGAATGGCCAc < 1:183048/150‑1 (MQ=255) gCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACt > 1:1396866/1‑102 (MQ=255) gCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACt < 2:1396866/102‑1 (MQ=255) ttccgACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTACCACATTGTGGATCGAGTACCAGAACGGAATGGCCACTGTCtt < 2:324681/146‑1 (MQ=255) | ACGCAGCACGCATGGTTGCGCCATACATCGCCGGTAAAGCGCTGCACGCGGCCTACCTTGAGGTTCTCGGCCAGTGCGTTG‑AAC‑‑GGCTCGGCAACGATGTAGCCGGCAATGCGCTTGCTGGCCAGAGCGGGTGGCATGTCGGACGGTGGCAGCACCAGCAGGTTGACTTCGTTGGCGGCCAGTTGCGCATTGGCCG‑GCTTCGACACGGGCGTCAGGCCGTTGTCGTTGAGCAACTGTTGCAGTACCACATTGTGGATCGAGTACCAGAACGGAATGGCCACTGTCTT > NC_002947/4132486‑4132772 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |