Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,220,867 | G→A | 5.6% | Q463Q (CAG→CAA) | PP_3699 → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,220,867 | 0 | G | A | 5.6% | 213.1 / 2.6 | 71 | Q463Q (CAG→CAA) | PP_3699 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/34); new base A (2/2); total (35/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.53e-01 |
GAGGTGGTCAGCCTCACCAAGATGACGTCGTTAAACACGGCCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTACGCTATCGACCACGTCACAATTGTAGACATCCCCGCACCTGGGC > NC_002947/4220719‑4221015 | gAGGTGGTCAGCCTCACCAAGATGACGTCGTTAAACACGGCCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTTGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGt < 2:413183/150‑1 (MQ=255) tCACCAAGATGACGTCGTTAAACACGGCCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGAt > 2:152852/1‑150 (MQ=255) tCACCAAGATGACGTCGTTAAACACGGCCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAATACCCTGGGAAGAt > 1:127352/1‑150 (MQ=255) gaCCAAGATGACGTCGTGAAACACGGCCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATg < 2:512481/149‑1 (MQ=255) aCCAAGATGACGTCGTTAAACACGGTCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATgg < 2:1241883/150‑1 (MQ=255) aCCAAGATGACGTCGTTAAACACGGCCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATgg > 1:86978/1‑150 (MQ=255) cAAGATGACGTCGTTAAACACGGCCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCa < 2:1283109/150‑1 (MQ=255) cAAGATGACGTCGTTAAACACGGCCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAATACCCTGGGAAGATGGCa < 2:127352/150‑1 (MQ=255) tGACGTCGTTAAACACGGCCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGGGAAGACGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATgat > 1:1157383/1‑150 (MQ=255) cgtcgtTAAACACGGCCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATgatcga < 2:918278/150‑1 (MQ=255) gtcgtAAAACACGACCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTATGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACTGTAGTCAATCTACTTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCCATgatcgat > 2:636915/1‑150 (MQ=255) tcgtTAAACACGGCCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATTGCAATgatcgatc < 1:874004/150‑1 (MQ=255) cgtTAAACACGGCCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGatcgatcg < 1:152852/150‑1 (MQ=255) gtTAAACACGGCCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGc > 1:255146/1‑150 (MQ=255) ttAAACACGGCCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCa > 2:912788/1‑150 (MQ=255) cAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCCGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAActggggctgg > 1:307572/1‑150 (MQ=255) aaGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAActggggctggg > 1:1402094/1‑150 (MQ=255) cgcATTTATGAGCGCAATAGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCTTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCACAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCTCAACTGGGGCTGGGGAAGc < 2:560250/150‑1 (MQ=255) cATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGccc < 1:1049035/150‑1 (MQ=255) tttATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCgg > 1:735821/1‑150 (MQ=255) ttATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGt < 1:912788/150‑1 (MQ=255) tGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACCGGGGCTGGGGAAGCCCGGTtga < 2:1157383/150‑1 (MQ=255) gACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTtgat < 1:1037517/150‑1 (MQ=255) gACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTtgat < 1:837095/150‑1 (MQ=255) ccGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTtgatga > 1:1023388/1‑150 (MQ=255) gCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATgaga < 2:1402094/150‑1 (MQ=255) gCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATgaga < 1:423466/150‑1 (MQ=255) aaTGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGAtt > 1:638989/1‑150 (MQ=255) cTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGa < 1:294486/91‑1 (MQ=255) cTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGa > 2:294486/1‑91 (MQ=255) cTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGaa < 2:939444/117‑1 (MQ=255) cTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGaa > 1:939444/1‑117 (MQ=255) ttGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATgg > 1:1139734/1‑82 (MQ=255) ttGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATgg < 2:1139734/82‑1 (MQ=255) tgGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTcc < 2:735821/150‑1 (MQ=255) tgGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAATACCCTGGGAAGATGGCAATgatc < 1:615275/84‑1 (MQ=255) tgGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAATACCCTGGGAAGATGGCAATgatc > 2:615275/1‑84 (MQ=255) tgGAATGCAAGAGTGGTTGTTGGCATGGTAGGCATTGTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGTAGAGCCTAGCCGCTcc < 2:307572/150‑1 (MQ=255) aTGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCcggcg > 2:1413309/1‑150 (MQ=255) tGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCcggcgg > 1:863592/1‑150 (MQ=255) gCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGa < 2:638989/150‑1 (MQ=255) tGGTAGTTACCACGGTCATCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGtt > 2:205856/1‑150 (MQ=255) ggTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTa < 2:255146/150‑1 (MQ=255) gTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTAc > 1:917368/1‑150 (MQ=255) gTCGTTAGCACGGTAGGCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTAc > 2:950122/1‑150 (MQ=255) tCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAAt < 2:830135/64‑1 (MQ=255) tCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAAt > 1:830135/1‑64 (MQ=255) tCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTcc > 1:1419815/1‑109 (MQ=255) tCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTcc < 2:1419815/109‑1 (MQ=255) tCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTACg > 2:384655/1‑150 (MQ=255) ttAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTtgat > 1:1136831/1‑98 (MQ=255) ttAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTtgat < 2:1136831/98‑1 (MQ=255) ttAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTACGCTa > 2:933341/1‑150 (MQ=255) aCGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGagag > 2:339253/1‑114 (MQ=255) aCGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGagag < 1:339253/114‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATTGATCGCAACGGGGGCTGGGGACGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTACGCTATCGAcc < 2:86978/150‑1 (MQ=255) tCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTACGc < 2:418896/132‑1 (MQ=255) tCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTACGc > 1:418896/1‑132 (MQ=255) ccTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCg < 1:547123/94‑1 (MQ=255) ccTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCg > 2:547123/1‑94 (MQ=255) ccTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTACGCTATCGACCACGTCACAAtt > 1:491720/1‑147 (MQ=255) ccTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTACGCTATCGACCACGTCACAAtt < 2:491720/147‑1 (MQ=255) ccTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTACGCTATCGACCACGTCACAATTGTa < 2:917368/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTACAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTACGCTATCGACCACGTCACAATTGTa < 2:1023388/150‑1 (MQ=255) ctgctgATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTACGCTATCGACCACGTCACAATTGTAg > 2:1113249/1‑150 (MQ=255) aTCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTACGCTATCGACCACGTCACAATTGTa > 1:1166103/1‑143 (MQ=255) aTCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTACGCTATCGACCACGTCACAATTGTa < 2:1166103/143‑1 (MQ=255) cAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTACGCTATCGACCACGTCACAATTGTAGACATCCCCGCAcc > 2:100679/1‑150 (MQ=255) aGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAggtg > 1:361623/1‑102 (MQ=255) aGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAggtg < 2:361623/102‑1 (MQ=255) aGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTACGCTATCGACCACGTCACAATTGTAGACATCCCCGCACCTGGGc > 1:1165069/1‑150 (MQ=255) | GAGGTGGTCAGCCTCACCAAGATGACGTCGTTAAACACGGCCAAGAGCGCATTTATGACCGCAATGGTGAGCTTGAAGCTGTGTTGATGTGGAATGCTGGAGTGGTCGTTAGCACGGTAGTCAATCTACCTGCTGATCGCCGCAGCCAGTACCCTGGGAAGATGGCAATGATCGATCGCAACTGGGGCTGGGGAAGCCCGGTTGATGAGATTCCAGATTTCGGAGAGCCTAGCCGCTCCGGCGGAGGTGGTTACGCTATCGACCACGTCACAATTGTAGACATCCCCGCACCTGGGC > NC_002947/4220719‑4221015 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |