| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,383,558 | G→C | 6.9% | T114S (ACT→AGT) | PP_3858 ← | tail fiber protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,383,558 | 0 | G | C | 6.9% | 227.2 / 6.7 | 72 | T114S (ACT→AGT) | PP_3858 | tail fiber protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/34); new base C (2/3); total (35/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.45e-01 | |||||||||||
TTTCAGTCTCGACCTTGGTATAGGTCTCTGCTCGACTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGCCGTACCCCGCCAAAGTGGTGGCCTTGAGCGCGAAGTTGGCGACCATCTTCTGCGCCGC > NC_002947/4383409‑4383706 | tttCAGTCTCGACCTTGGTATAGGTCTCTGCTCGACTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAg > 2:521425/1‑150 (MQ=255)tttCAGTCTCGACCTTGGTATAGGTCTCTGCTCGACTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAg > 1:364135/1‑150 (MQ=255) aGTCTCGACCTTGGTATAGGTCTCTGCTCGACTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGAt < 2:612716/150‑1 (MQ=255) tctcGACCTTGGTATAGGTCTCTGCTCGACTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGc > 1:1026191/1‑150 (MQ=255) tctcGACCTTGGTATAGGTCTCTGCTCGACTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCACTGATGc < 1:1149267/150‑1 (MQ=255) ctcGACCTTGGTATAGGTCTCTGCTCGACTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGcc < 2:1026191/150‑1 (MQ=255) aCCTTGGTATAGGTCTCTGCTCGACTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTaa > 1:1006055/1‑150 (MQ=255) ccTTGGTATAGGTCTCTGCTCGACTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAac < 2:836737/150‑1 (MQ=255) ttGGTATAGGTCTCTGCTCGACTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAacca < 1:1286327/150‑1 (MQ=255) taGGTCTCTGCTCGACTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGc > 1:708219/1‑150 (MQ=255) tctGCTCGACTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAac < 1:1035047/136‑1 (MQ=255) tctGCTCGACTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAac > 2:1035047/1‑136 (MQ=255) gCTCGACTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGcc > 2:1095913/1‑150 (MQ=255) tcaaCTGTACGTCTCGCCTTTGGTGGAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTACTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCTGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCa > 2:799626/4‑150 (MQ=255) aCTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGt > 2:999779/1‑117 (MQ=255) aCTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGt < 1:999779/117‑1 (MQ=255) cTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATACCAGATGAC‑TCTCGGTGCCTGGGGTTTGGCGTTGTTCGCCTTGGTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTg < 1:318671/150‑1 (MQ=255) tGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCACTGATGcctac > 1:968666/1‑121 (MQ=255) tGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCACTGATGcctac < 2:968666/124‑4 (MQ=255) tACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAg > 2:716584/1‑112 (MQ=255) tACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAg < 1:716584/112‑1 (MQ=255) aCGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGAATCAGCCAAGCCTGAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCt > 2:1182942/1‑150 (MQ=255) cGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCtt < 1:3824/150‑1 (MQ=255) ctcGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTg > 2:845026/1‑150 (MQ=255) gCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGa > 1:81863/1‑150 (MQ=255) gCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGa < 1:1019216/150‑1 (MQ=255) tttGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGAt < 2:692133/105‑1 (MQ=255) tttGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGAt > 1:692133/1‑105 (MQ=255) ttGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGacaac > 2:993522/1‑150 (MQ=255) tgtAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCACTGATGccta > 1:179446/1‑103 (MQ=255) tgtAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCACTGATGccta < 2:179446/105‑3 (MQ=255) gtAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTa > 1:721042/1‑150 (MQ=255) gCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTcc < 2:1241649/150‑1 (MQ=255) cATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCg > 2:549755/1‑150 (MQ=255) tCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTc < 2:1420247/150‑1 (MQ=255) tCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTc > 1:1371363/1‑150 (MQ=255) aCCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTg > 2:444763/1‑150 (MQ=255) aTGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGTCGATCTTCTCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGCTTTCGGTTTTTCATTGTGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCAcc < 1:1095913/150‑1 (MQ=255) gCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCtt < 2:561013/150‑1 (MQ=255) ccATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTg < 1:1182942/150‑1 (MQ=255) aTAGCAG‑GCCAAGGTGTTGTCTTTTTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGTTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCATTTGGCCTTCTGCGACTACAGGTAGTCCGACTGCAccatagt < 2:81863/150‑6 (MQ=255) ccG‑GCCAAGTTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACCCCTGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAg < 1:549755/150‑1 (MQ=255) ccG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAg > 1:1308504/1‑150 (MQ=255) ccG‑GCCAAGGTATTGGCGTTGTTCGCCTTGCTTTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTGCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAg > 2:67167/1‑150 (MQ=255) ccAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGTGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAgg < 1:979060/122‑1 (MQ=255) ccAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGTGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAgg > 2:979060/1‑122 (MQ=255) ttGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAgg > 2:937079/1‑114 (MQ=255) ttGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAgg < 1:937079/114‑1 (MQ=255) ggCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAAt > 1:899862/1‑147 (MQ=255) ggCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAAt < 2:899862/147‑1 (MQ=255) ggCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAACCATGcc < 2:708219/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGTGCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGcc < 2:603285/150‑1 (MQ=255) gCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGt > 1:676408/1‑67 (MQ=255) gCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGt < 2:676408/67‑1 (MQ=255) gCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGCCg < 1:521425/150‑1 (MQ=255) gttgttCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGCCGTa > 2:1000410/1‑150 (MQ=255) ttGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGTGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGCCGTACCCCGCCaaa > 2:601648/1‑150 (MQ=255) ttGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGCCGTACCCCGCCaac > 2:254391/1‑149 (MQ=255) cTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGCCGTACCCCGCCAAAgtg > 1:742575/1‑150 (MQ=255) 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aTTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTa < 2:630126/101‑1 (MQ=255) aTTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTa > 1:630126/1‑101 (MQ=255) tCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGCCGTACCCCGCCAAAGTGGTGGCCTTGAGCGCGAAGTTg < 1:993522/150‑1 (MQ=255) ggTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAGGAGGTATTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGCCGTACCCCGCCAAAGTGGTGGCCTTGAGCGCGAAGTTGGc < 1:799626/150‑1 (MQ=255) tCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGCCGTACCCCGCCAAAGTGGTGGCCTTGAGCGCGAAGTTGGc > 2:1310789/1‑148 (MQ=255) tCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGCCGTACCCCGCCAAAGTGGTGGCCTTGAGCGCGAAGTTGGc < 1:1310789/148‑1 (MQ=255) tCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGCCGTACCCCGCCAAAGTGGTGGCCTTGAGCGCGAAGTTGGCGa > 2:50088/1‑150 (MQ=255) tGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGCCGTACCCCGCCAAAGTGGTGGCCTTGAGCGCGAAGTTGGCGACCa < 1:845026/150‑1 (MQ=255) tAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGCCGTACCCCGCCAAAGTGGTGGCCTTGAGCGCGAAGTTGGCGACCAtcttc > 2:1273294/1‑150 (MQ=255) aTCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGCCGTACCCCGCCAAAGTGGTGGCCTTGAGCGCGAAGTTGGCGACCATCTTCTgcgc > 1:335331/1‑150 (MQ=255) aGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGACGAACCCCGCCAAAGTGGTGGCCTTGAGCGCGAAGTTGGCGACCATCTTCTGcgccgc > 1:234719/1‑150 (MQ=255) | TTTCAGTCTCGACCTTGGTATAGGTCTCTGCTCGACTGTACGTCTCGCCTTTGGTGTAAGCATCACCGATGCCATAGCCG‑GCCAAGGTGTTGGCGTTGTTCGCCTTGCTGTTCAGCAGCGTGTTGATTTCGGTCTTGGTGTAGGCATCAGTGATGCCGTAACCACCCAGCGTGATCGCCCAGTTGGCCTTCTGCGACAACAGGTAGTCCGTCTGCACCTTGGTGTAGGCATCAAGAATGCCGTACCCCGCCAAAGTGGTGGCCTTGAGCGCGAAGTTGGCGACCATCTTCTGCGCCGC > NC_002947/4383409‑4383706 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |