Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,668,461 | G→A | 5.5% | G96D (GGC→GAC) | nuoM → | NADH‑quinone oxidoreductase subunit M |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,668,461 | 0 | G | A | 5.5% | 212.5 / 2.1 | 72 | G96D (GGC→GAC) | nuoM | NADH‑quinone oxidoreductase subunit M |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/30); new base A (2/2); total (40/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.49e-01 |
TGGGGTACCGGCGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGACCTGTTCCTGTTCTTCTTCTTCTGGGA > NC_002947/4668313‑4668608 | tggGGTACCGGCGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCCGc < 2:379808/150‑1 (MQ=255) gTACCGGCGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGc > 1:554187/1‑150 (MQ=255) cGGCGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCTAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCgg > 2:1310987/1‑150 (MQ=255) ggCGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGgt < 2:462462/150‑1 (MQ=255) gACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGtgtg > 2:353203/1‑150 (MQ=255) gACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGtgtg < 2:255315/150‑1 (MQ=255) tACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCAGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTg > 2:1304071/1‑150 (MQ=255) tCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCTAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACtgtg < 1:1310987/150‑1 (MQ=255) tCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACtgtg > 2:1276703/1‑150 (MQ=255) tCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACtgtg > 1:870631/1‑150 (MQ=255) ccGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGgtgt < 2:1351707/133‑1 (MQ=255) ccGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGgtgt > 1:1351707/1‑133 (MQ=255) cGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTc < 1:326342/150‑1 (MQ=255) cccGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTg > 2:607089/1‑150 (MQ=255) ccGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCCGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTgg > 2:243430/1‑150 (MQ=255) cGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGa > 1:237514/1‑150 (MQ=255) ccGAACCGGCCTGGGCTGTTGAAGACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCATCTCCAGCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAgaga < 1:799104/150‑1 (MQ=255) cGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATGCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGAt > 1:1358418/1‑150 (MQ=255) aaCCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATcc < 2:239243/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAg < 1:773051/150‑1 (MQ=255) tGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCAc > 1:729391/1‑150 (MQ=255) ctctCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCCGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCCCCGGCCTGCTAGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCg < 1:243430/150‑1 (MQ=255) tcGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGct < 2:870631/150‑1 (MQ=255) aaTACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCAGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGct‑tct < 1:1304071/150‑1 (MQ=255) tACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCt‑tcttc > 1:294379/1‑150 (MQ=255) tACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCt‑tcttc > 2:1065410/1‑150 (MQ=255) aCAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTcc < 2:294379/150‑1 (MQ=255) aaaGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCAc > 1:533342/1‑150 (MQ=255) gATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGAt > 2:889787/1‑150 (MQ=255) tCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGAtgc > 1:950444/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGACCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAgaga < 2:867908/111‑1 (MQ=255) tCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGACCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAgaga > 1:867908/1‑111 (MQ=255) gCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTgtgt > 2:50561/1‑94 (MQ=255) gCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTgtgt < 1:50561/94‑1 (MQ=255) gTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATcc > 2:1405970/1‑150 (MQ=255) gTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGCTCTGTCGGTACTGTGTTCCTAGAAAAAGATCAAGCTCAACGTCTGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATcc > 1:94985/1‑150 (MQ=255) gCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTAGGTGTGGTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTcggcg > 2:547377/1‑150 (MQ=255) tCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGgcggcg > 1:414928/1‑150 (MQ=255) gCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTgg < 2:664360/150‑1 (MQ=255) cATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGt > 2:2830/1‑150 (MQ=255) cACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGGTGCTGATGATCCTGCTCACTGGCCTGTTCGGTGTGCTGTAGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGTTCCAGCGCCACGTCGCCT‑TCTTCCACCTCAACATGATGTGGGTCCTCGGGGCCGTGGTCGgt > 2:153822/1‑150 (MQ=255) cACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGgt < 2:414928/150‑1 (MQ=255) cACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGgt < 2:729391/150‑1 (MQ=255) cccTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGt > 1:984923/2‑145 (MQ=255) aCCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTAGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGt < 2:984923/145‑1 (MQ=255) aCCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACAGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGgtg > 2:1033932/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGgtgt > 2:1177539/1‑150 (MQ=255) ggCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑GCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGtt < 2:554187/150‑1 (MQ=255) ccTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCt > 1:143430/1‑150 (MQ=255) ccTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCt > 1:1325624/1‑150 (MQ=255) ccTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGATGTCGATACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCt > 2:126473/1‑150 (MQ=255) cTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTg < 2:1358418/150‑1 (MQ=255) ggCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTc < 2:1302664/87‑1 (MQ=255) ggCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTc > 1:1302664/1‑87 (MQ=255) ccTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCa > 2:437491/1‑81 (MQ=255) ccTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCa < 1:437491/81‑1 (MQ=255) ccTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGa > 2:1250565/1‑150 (MQ=255) cTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGAc < 1:1250565/150‑1 (MQ=255) tCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGAcctg > 2:72375/1‑150 (MQ=255) ctgctgAGGATCCTGCTCACCGACCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGAcctgttc > 1:836990/1‑150 (MQ=255) gatCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGACCTGTTCCTGttctt < 1:72375/150‑1 (MQ=255) atCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGACCTGTTCCTGttcttc < 2:237514/150‑1 (MQ=255) tgctactcGGTCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGCGATATCAAACCGCCT‑GGTTGTGGTTTGCCTCACCCTGATTCGAATCCTCGGCGGCGTGGTTGGTGTGTGTTTTGCCCTTGACCTGTTCCTGttcttcttct < 1:1033932/143‑1 (MQ=255) tGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCGCTGGACCTGTTCATGttcttcttct > 1:297100/1‑150 (MQ=255) cACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGCGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGACCTGTTCCTGATATTCTCctgctg < 2:1348430/150‑1 (MQ=255) aCCGACCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGACCTGTTCCTGTTCTTCTTCTTCTgg < 2:836990/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGACCTGTTCCTGTTCTTCTTCTTCTggg < 1:607089/150‑1 (MQ=255) cGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCgg < 2:1124007/105‑1 (MQ=255) cGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCgg > 1:1124007/1‑105 (MQ=255) cGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGACCTGTTCCTGTtcttcttcttct > 2:71241/1‑146 (MQ=255) cGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGACCTGTTCCTGTtcttcttcttct < 1:71241/146‑1 (MQ=255) cGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGAGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATCTGGACCCTCGTCGGCGGGGTCCGGGTGTTCGTGGCCGCGGGCTTGTTCCCGTTCCTCTTCTTCTgggt > 2:1403385/1‑149 (MQ=255) | TGGGGTACCGGCGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCT‑TCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGACCTGTTCCTGTTCTTCTTCTTCTGGGA > NC_002947/4668313‑4668608 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |