| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,703,552 | A→T | 5.4% | L553H (CTT→CAT) | kdpA ← | potassium‑transporting ATPase subunit A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,703,552 | 0 | A | T | 5.4% | 227.7 / 3.5 | 74 | L553H (CTT→CAT) | kdpA | potassium‑transporting ATPase subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/33); new base T (2/2); total (38/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.79e-01 | |||||||||||
GACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCTTTTTTTCGCCGCCAGGCTGCCGGCCAACGCCAGTATC > NC_002947/4703407‑4703701 | gACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGc > 2:588583/1‑150 (MQ=255) cGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGCT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCa < 1:252466/150‑1 (MQ=255) gAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAg < 1:991113/150‑1 (MQ=255) aCGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCTTGGGCCaatc < 2:28451/150‑4 (MQ=255) aCGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCTTGGGCCaat > 2:1330457/1‑147 (MQ=255) aCGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCTTGGGCCaat < 1:1330457/149‑3 (MQ=255) cACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAg < 2:493703/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAg < 1:854728/138‑1 (MQ=255) cAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAg > 2:854728/1‑138 (MQ=255) cAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGaa < 2:1095692/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGGCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCTTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGaa < 1:1384487/150‑1 (MQ=255) aGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAg > 2:230241/1‑150 (MQ=255) cgcCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGt > 2:815763/1‑150 (MQ=255) cGGGGGCCACCGCGCGGCGCAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAg < 2:307829/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAg < 2:639019/150‑1 (MQ=255) gcCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCgg > 2:383298/1‑133 (MQ=255) gcCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCgg < 1:383298/133‑1 (MQ=255) gcCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCAc < 1:815763/150‑1 (MQ=255) cacaGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCg > 2:1285829/1‑150 (MQ=255) caGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTTACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCCCAATCTTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGAc < 1:1170431/150‑1 (MQ=255) cgcgGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACcag > 2:1146945/1‑150 (MQ=255) cggcgAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCAACGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACcagca > 1:616464/1‑150 (MQ=255) ggcgAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACcagcag < 2:1424227/150‑1 (MQ=255) gcgAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCAAAGACcaggcgg > 2:865238/1‑146 (MQ=255) gTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCAcc > 2:466194/1‑150 (MQ=255) tCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACca > 1:1258149/1‑150 (MQ=255) tCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGt < 1:960850/140‑1 (MQ=255) tCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGt > 2:960850/1‑140 (MQ=255) ttGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAg > 1:416306/1‑150 (MQ=255) ttGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAg > 2:607619/1‑150 (MQ=255) cACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACca > 1:583805/1‑138 (MQ=255) cACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACca < 2:583805/138‑1 (MQ=255) aCTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCCCGTACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGt < 1:275203/150‑1 (MQ=255) ccGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCg < 1:892000/142‑1 (MQ=255) ccGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCg > 2:892000/1‑142 (MQ=255) ggCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCg < 2:1258149/150‑1 (MQ=255) ggCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCg < 1:466194/150‑1 (MQ=255) gCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCgg < 1:607619/150‑1 (MQ=255) gCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTCCATGAT‑GGTTCATCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGCTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGCCACCAGCAGCAAGGCGGTGAACAGCgg > 2:100810/1‑150 (MQ=255) aTTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGcc > 1:1158875/1‑150 (MQ=255) aTTAACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCATGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGcc < 1:76900/150‑1 (MQ=255) tCACTTCAGGAATGCGCATGTT‑ACCATCCGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGt < 1:714200/150‑1 (MQ=255) aCTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGAGGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGa > 1:373394/1‑150 (MQ=255) tCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTc < 1:1404717/150‑1 (MQ=255) gaagtggCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGa > 2:356376/6‑150 (MQ=255) tGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGc < 1:1209952/150‑1 (MQ=255) gCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACcag > 2:1138918/1‑94 (MQ=255) gCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACcag < 1:1138918/94‑1 (MQ=255) cATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGtt < 2:1283881/150‑1 (MQ=255) aTGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTc > 1:70222/1‑150 (MQ=255) ttCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATg < 2:972250/96‑1 (MQ=255) ttCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATg > 1:972250/1‑96 (MQ=255) aTGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGTGTCGGCAGGAAg < 2:845328/69‑1 (MQ=255) aTGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGTGTCGGCAGGAAg > 1:845328/1‑69 (MQ=255) cGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGAGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAgcgg > 1:629296/1‑150 (MQ=255) tCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGGAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGgcgc > 1:1184678/1‑150 (MQ=255) tCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGgcgc > 1:903082/1‑150 (MQ=255) tCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGgcgc > 2:1237314/1‑150 (MQ=255) cTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGgcgcgc > 1:934977/1‑150 (MQ=255) tCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGCCACATGGGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCt > 1:1384270/1‑150 (MQ=255) acaCCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGACGGCCAGGCCTACCTTCATCAGTAACGTTACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCttttt < 1:100810/148‑1 (MQ=255) aaCCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCtttttt > 1:1412998/1‑150 (MQ=255) aaGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCTTTTTTTcgcc < 1:1146945/150‑1 (MQ=255) cTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCg > 2:330234/1‑87 (MQ=255) cTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCg < 1:330234/87‑1 (MQ=255) tAAGGTGTTCGGCGCTTGCCCACCCGGCCAGGCGCGGTAGGGATGTTATGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCTTTTTTTCGCCGCCa < 2:373394/150‑1 (MQ=255) tAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCTTTTTTTc < 1:1413294/143‑1 (MQ=255) tAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCTTTTTTTc > 2:1413294/1‑143 (MQ=255) gtTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCTTTTTTTCGCCGCCAGGCttc < 2:1417888/150‑3 (MQ=255) cctGGCCCGTGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCTGTTTTTCGCCGCCAGGCTGCCGGCCAAc > 1:889531/3‑150 (MQ=255) gCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCCACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCTTTTTTTCGCCGCCAGGCTGCCGGCCAACGCCa < 1:802536/150‑1 (MQ=255) ccAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCTTTTTTTCGCCGCCAGGCTGCCGGCCAACGCCAGt > 1:306535/1‑150 (MQ=255) ccAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCTTTTTTTCGCCGCCAGGCTGCCGGCCAACGCCAGt > 1:879838/1‑150 (MQ=255) ccAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGCTCTGCCCCAGCGGCGCGCTTTTTTTCGCCGCCAGGCTGCCGGCCAACGCCAGt > 1:1291171/1‑150 (MQ=255) aaGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCTTTTTTTCGCCGCCAGGCTGCCGGCCAACGCCAGTAt > 1:960937/1‑150 (MQ=255) aaGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCTTTTTTTCGCCGCCAGGCTGCCGGCCAACGCCAGTAt < 2:903082/150‑1 (MQ=255) aGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCTTTTTTTCGCCGCCAGGCTGCCGGCCAACGCCAGTATc < 1:356376/150‑1 (MQ=255) aGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCTTTTTTTCGCCGCCAGGCTGCCGGCCAACGCCAGTATc < 1:1285829/150‑1 (MQ=255) | GACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAT‑CGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGGCCAGGGTCGGCAGGAAGGTCAGGCCACCGACCAGCAGGATGGTCACCAGCAGCAAGCCGGTGAACAGCGGGCCGTGAGTCGGGAAGCTGTTCTGCCCCAGCGGCGCGCTTTTTTTCGCCGCCAGGCTGCCGGCCAACGCCAGTATC > NC_002947/4703407‑4703701 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |