| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,710,769 | G→A | 8.0% | V273V (GTC→GTT) | gpsA ← | glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,710,769 | 0 | G | A | 8.0% | 264.6 / 8.8 | 96 | V273V (GTC→GTT) | gpsA | glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (44/44); new base A (6/2); total (50/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 | |||||||||||
CTCGATCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTGGCTGAC > NC_002947/4710625‑4710909 | cTCGATCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGc > 2:670910/1‑150 (MQ=255)cTCGATCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGc < 2:488502/150‑1 (MQ=255)cTCGATCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGc > 2:117979/1‑150 (MQ=255) tCGATCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTCAACCGcc > 1:897170/1‑150 (MQ=255) ataaTCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGcc > 1:761001/4‑150 (MQ=255) gATCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTCAACCGCctg > 2:96851/1‑149 (MQ=255) aTCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTCAACCGCctgg < 2:897170/150‑3 (MQ=255) tCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCTGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTCAACCGCctggg < 1:96851/150‑4 (MQ=255) cTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTTCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAg > 1:100091/1‑150 (MQ=255) cTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGAcc < 2:936825/139‑1 (MQ=255) cTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGAcc > 1:936825/1‑139 (MQ=255) cTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAg > 2:1471/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCt > 2:675492/1‑150 (MQ=255) tCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCttt < 2:965698/150‑1 (MQ=255) aGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTgg > 2:1288907/1‑150 (MQ=255) cgcCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGc < 1:1471/150‑1 (MQ=255) gcCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTgg < 2:1293048/143‑1 (MQ=255) gcCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTgg > 1:1293048/1‑143 (MQ=255) gcCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGcc > 1:438335/1‑150 (MQ=255) gcCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGcc > 1:817828/1‑150 (MQ=255) cTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCa > 2:896961/1‑150 (MQ=255) ttCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTc < 1:300223/129‑1 (MQ=255) ttCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTc > 2:300223/1‑129 (MQ=255) tCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGt < 1:675492/150‑1 (MQ=255) aaCAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCg > 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agccaCCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGGGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGATTGGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCg > 2:1046423/1‑150 (MQ=255) accaGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAAcc > 2:475877/1‑135 (MQ=255) accaGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAAcc < 1:475877/135‑1 (MQ=255) accaGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGctc > 1:730519/1‑150 (MQ=255) aGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTgg > 1:71371/1‑108 (MQ=255) aGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTgg < 2:71371/108‑1 (MQ=255) aGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTg < 1:641842/150‑1 (MQ=255) aGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTg < 2:438335/150‑1 (MQ=255) cGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTggg > 1:1373318/1‑150 (MQ=255) cATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCga > 2:1350624/1‑150 (MQ=255) cATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCga < 1:670910/150‑1 (MQ=255) cATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCga < 2:680570/150‑1 (MQ=255) acCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGc > 2:1277927/1‑102 (MQ=255) acCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGc < 1:1277927/102‑1 (MQ=255) acCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAg < 1:1350624/150‑1 (MQ=255) acCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAg > 1:998581/1‑150 (MQ=255) ccTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAgg < 1:829898/150‑1 (MQ=255) ccTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAgg > 1:588511/1‑150 (MQ=255) cTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGcc > 1:8154/1‑101 (MQ=255) cTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGcc < 2:8154/101‑1 (MQ=255) cTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAg < 1:670786/148‑1 (MQ=255) cTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAg > 2:670786/1‑148 (MQ=255) cTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGt > 1:571867/1‑150 (MQ=255) tGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGc < 1:762871/107‑1 (MQ=255) tGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGc > 2:762871/1‑107 (MQ=255) tGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTg > 2:1163527/1‑150 (MQ=255) gCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCATCTATAGAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGa < 1:1046423/150‑1 (MQ=255) ttGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGAt > 2:545663/1‑150 (MQ=255) gCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGCCCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCa < 1:838803/150‑1 (MQ=255) 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cTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGAt > 1:210580/1‑126 (MQ=255) cTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGAt < 2:210580/126‑1 (MQ=255) cTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGATGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGcc > 1:1356517/1‑150 (MQ=255) tGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACGGACACCGGCCAGGCCGa < 2:730519/150‑1 (MQ=255) gCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCAcc < 2:482717/130‑1 (MQ=255) gCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCAcc > 1:482717/1‑130 (MQ=255) tgtTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACg > 1:989236/1‑150 (MQ=255) gtTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTAACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGTGCGAGGAGCAGGTGACGCTCAGGTTACCTACACCGGCCAGGCCGAGCAACgc > 2:242685/1‑149 (MQ=255) ttGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTc > 1:680745/1‑150 (MQ=255) aCCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTTTTCCAGGCTTTGACCCTGCCCCAATGCGTCGCCAACCTGATAGTTGCGTCTCTTTTGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATg > 1:194139/1‑150 (MQ=255) aCCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAg < 1:177723/140‑1 (MQ=255) aCCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAg > 2:177723/1‑140 (MQ=255) aCCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATg < 2:680745/150‑1 (MQ=255) cccccTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCgag > 2:1390908/1‑98 (MQ=255) cccccTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATgg < 1:1288907/150‑1 (MQ=255) cccccTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCCTCCAGGCTTTGGCACTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCgag < 1:1390908/98‑1 (MQ=255) ccccTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCgg > 2:331305/1‑85 (MQ=255) ccccTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCgg < 1:331305/85‑1 (MQ=255) tCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTg < 1:816138/150‑1 (MQ=255) ggCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGgc < 2:998581/150‑1 (MQ=255) cACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCgag > 2:1313837/1‑88 (MQ=255) cACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCgag < 1:1313837/88‑1 (MQ=255) ttCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTg < 2:571867/150‑1 (MQ=255) cGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTGGc < 2:817828/150‑1 (MQ=255) agaGGCGGTCAACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGGGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTGGCTGa > 1:578356/3‑150 (MQ=255) agaGGCGGTCAACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTGGCTGa > 1:1111530/3‑150 (MQ=255) gaGGCGGTCAACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTGGCTGAc > 2:476653/2‑150 (MQ=255) cAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTGGCTGAc > 1:643132/1‑150 (MQ=255) cAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTGGCTGAc < 2:1233121/150‑1 (MQ=255) ggCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGc > 2:759156/1‑114 (MQ=255) ggCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGc < 1:759156/114‑1 (MQ=255) | CTCGATCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTGGCTGAC > NC_002947/4710625‑4710909 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |