Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 429,115 | C→G | 6.9% | G137A (GGC→GCC) | PP_0352 ← | ECF family RNA polymerase sigma‑70 factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 429,115 | 0 | C | G | 6.9% | 225.7 / 7.4 | 73 | G137A (GGC→GCC) | PP_0352 | ECF family RNA polymerase sigma‑70 factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/35); new base G (3/2); total (36/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.13e-01 |
ATCGCGGCTTCCAGGACCCGGGACGAAACCGGGAGGTTGCTCACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTCGGCTTCAGGGATCAGTGCCA > NC_002947/428966‑429259 | aTCGCGGCTTCAAGGACCCGGGACGGAACCGGGAGGTTGCTCACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCAGATCTGACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGc < 1:1380729/150‑1 (MQ=255) gCTTCCAGGACCCGGGACGAAACCGGGAGGCTGCTCACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGc < 1:1005656/150‑1 (MQ=255) aGGACCCGGGACGAAACCGGGAGGTTGCTCACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCa > 1:1369676/1‑150 (MQ=255) aCCCGGGACGAAACCGGGAGGTTGCTCACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGAc < 2:898439/150‑1 (MQ=255) aCCCGGGACGAAACCGGGAGGTTGCTCACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGAc < 1:846612/150‑1 (MQ=255) aCGAAACCGGGAGGTTGCTCACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCtgtg > 2:144429/1‑150 (MQ=255) gAACCCGGGAGGGTGCGCACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCa > 2:379741/1‑150 (MQ=255) aaaCCGGGAGGTTGCTCACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAg > 2:545508/1‑150 (MQ=255) aaCCGGGAGGTTGCTCACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACCGCTGTGCAGa > 2:243376/1‑150 (MQ=255) aCCGGGAGGTTGCTCACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCAt < 2:1314371/127‑1 (MQ=255) aCCGGGAGGTTGCTCACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCAt > 1:1314371/1‑127 (MQ=255) aCCGGGAGGTTGCTCACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGaa > 1:703105/1‑150 (MQ=255) cGGGAGGTTGCTCACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAAc < 1:144429/150‑1 (MQ=255) ggAGGTTGCTCACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAAcgc > 1:509886/1‑150 (MQ=255) cACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATACCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGcc > 2:447995/1‑150 (MQ=255) aCGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGACCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCt > 1:307071/1‑150 (MQ=255) tCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGAc > 2:868181/1‑150 (MQ=255) tCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCACGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGAc < 2:703105/150‑1 (MQ=255) ccGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGc > 1:184305/1‑150 (MQ=255) tACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTg > 2:50855/1‑150 (MQ=255) aCAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCa < 1:1332878/105‑1 (MQ=255) aCAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCa > 2:1332878/1‑105 (MQ=255) aCAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCt > 2:1086669/1‑139 (MQ=255) aCAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCt < 1:1086669/139‑1 (MQ=255) aCAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGa < 1:1259524/142‑1 (MQ=255) aCAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGa > 2:1259524/1‑142 (MQ=255) aaGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑Cg > 1:265911/1‑150 (MQ=255) cgcATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGCGCAGGCGGTCGATGGCt < 2:950467/150‑1 (MQ=255) aTGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTg > 1:699725/1‑150 (MQ=255) tGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGa < 2:265911/150‑1 (MQ=255) gCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAg < 2:853786/150‑1 (MQ=255) gCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGCCCAGACGGCTGTCCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCGCGACCGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAg < 1:174932/150‑1 (MQ=255) cTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATgg < 2:1287998/141‑1 (MQ=255) cTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATgg > 1:1287998/1‑141 (MQ=255) tGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGTGATTTCGGCATGGCCCATACCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCt < 1:447995/150‑1 (MQ=255) cGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCaa < 2:606856/150‑1 (MQ=255) tGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGa < 2:1369676/150‑1 (MQ=255) tACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATc < 1:868181/150‑1 (MQ=255) tACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATc > 2:854080/1‑150 (MQ=255) gcgcACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGtg < 2:184305/150‑1 (MQ=255) cgcACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCCAGGATCAGGtgc > 2:521704/1‑150 (MQ=255) gcACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGtgct < 1:50855/150‑1 (MQ=255) gcACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGtgct > 2:1401141/1‑150 (MQ=255) cccGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCa > 2:125830/1‑150 (MQ=255) ccGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCAt < 2:149083/150‑1 (MQ=255) gATACCGAAACGCCAAGGCGCTTGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGATCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGTGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTcc < 2:2772/150‑2 (MQ=255) aCCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCAAGCCGGCCAGACGGCTGTGACAAAACGCCGCGCGAGACTT‑C‑CGGTGCCTTGCAGCTAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCCAGGGCTGGAGTTCTGGc > 1:324574/1‑150 (MQ=255) gAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAg < 2:96303/150‑1 (MQ=255) gAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAg < 1:125830/150‑1 (MQ=255) gCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGGCGTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTg > 1:75842/1‑150 (MQ=255) aaGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTc > 2:1176434/1‑150 (MQ=255) gcTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTTGCGAGGGCTGTTCGGCtt > 1:433494/1‑150 (MQ=255) tCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGc > 1:685755/1‑81 (MQ=255) tCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGc < 2:685755/81‑1 (MQ=255) tCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTCGGCTTCa < 1:243376/150‑1 (MQ=255) cGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTCGGCTTCAg < 2:730642/150‑1 (MQ=255) cGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTCGGCTTCAg > 1:341740/1‑150 (MQ=255) ggCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCCGACGTCAGTCCATAAACCCCTCTCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAATGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTCGGCTTCAgg < 2:866582/150‑1 (MQ=255) ggCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAATGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTCGGCTTCAgg > 1:866582/1‑150 (MQ=255) ggCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTCGGCTTCAgg < 2:1256767/150‑1 (MQ=255) ggCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTCGGCTTCAgg < 1:1176434/150‑1 (MQ=255) ggCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTCGGCTTCAgg < 2:509886/150‑1 (MQ=255) gCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTCGGATTCAggg > 2:219300/1‑150 (MQ=255) ggacGGCATGGGCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTCGGCTTCAGGGATCa > 2:1406702/4‑150 (MQ=255) gacGGCATGGGCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCt > 1:371309/3‑121 (MQ=255) gacGGCATGGGCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCt < 2:371309/119‑1 (MQ=255) gacGGCATGGGCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAg > 1:28648/3‑127 (MQ=255) gacGGCATGGGCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAg < 2:28648/125‑1 (MQ=255) tCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTCGGCTTCAGGGATCAGt < 1:545508/150‑1 (MQ=255) gCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGc > 1:481152/1‑64 (MQ=255) gCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGc < 2:481152/64‑1 (MQ=255) cATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTCGGCTTCAGGGATCAGTGCCa < 2:701052/150‑1 (MQ=255) aTGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTCGGCTTCAg > 1:1109149/1‑137 (MQ=255) aTGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTCGGCTTCAg < 2:1109149/137‑1 (MQ=255) cccATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTg < 1:1289507/112‑1 (MQ=255) cccATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTg > 2:1289507/1‑112 (MQ=255) | ATCGCGGCTTCCAGGACCCGGGACGAAACCGGGAGGTTGCTCACGTCGGCTCCCCGTACAAGGCCACGTAGCACTGGCGCATGCCTTGGGCGATGTACTGGCGCACCCGCGATACCGAAACGCCAAGGCGCTCGGCAATTTCGGCATGGCCCATGCCGTCCAGACGGCTGTGCAGAAACGCCGCGCGAGCCTTGCTCGACAGCTTGC‑‑CGAGCAGGCGGTCGATGGCTTTGAGGTCTTCAAGGATCAGGTGCTGCATTTCTGGCGAGGGCTGTTCGGCTTCAGGGATCAGTGCCA > NC_002947/428966‑429259 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |