| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,931,240 | A→G | 10.5% | S59P (TCC→CCC) | cheY ← | two‑component system response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,931,240 | 0 | A | G | 10.5% | 162.7 / 7.6 | 65 | S59P (TCC→CCC) | cheY | two‑component system response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/29); new base G (4/3); total (33/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.82e-01 | |||||||||||
AACGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCATCGTCGAA > NC_002947/4931098‑4931388 | aaCGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGccc < 1:1405899/150‑1 (MQ=255)aaCGACTTGACCACATAACCATTCACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGccc < 1:541353/150‑1 (MQ=255) cTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCAt > 2:1022666/1‑150 (MQ=255) acaTAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGAACTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAg > 1:1153172/1‑150 (MQ=255) aTAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTc < 2:1187367/150‑1 (MQ=255) tAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCg < 1:342540/150‑1 (MQ=255) aaCCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCgg < 1:264387/150‑1 (MQ=255) cATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCa > 1:507829/1‑150 (MQ=255) gCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGaa < 2:416818/150‑1 (MQ=255) cagacTGTGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGGCATGTCCGGCAt < 1:572345/123‑1 (MQ=255) cAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGt > 1:539963/1‑150 (MQ=255) cAGACTGTGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGGCATGTCCGGCAt > 2:572345/1‑127 (MQ=255) cAGACTGTGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGGCATGTCCGGCAt < 1:572114/127‑1 (MQ=255) cAGACTGTGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGGCATGTCCGGCAt > 2:572114/1‑127 (MQ=255) aGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTc > 2:736990/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGt > 1:961221/1‑150 (MQ=255) tGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAg < 2:795104/150‑1 (MQ=255) aaTGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTc < 2:1154866/150‑1 (MQ=255) aaTGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACATAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTc > 1:1095453/1‑150 (MQ=255) gTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGCCATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCgg > 2:588544/1‑150 (MQ=255) gTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCgg > 1:828576/1‑150 (MQ=255) tCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGAATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGc > 1:86225/1‑150 (MQ=255) cgcTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAAc > 2:366517/1‑150 (MQ=255) ttGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGt > 1:194697/1‑107 (MQ=255) ttGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGt < 2:194697/107‑1 (MQ=255) ggCTTCAGCGGTCACCATCCAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCgt < 2:34515/150‑1 (MQ=255) cTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGGCATGTCCGGCAtcgac > 1:1252175/1‑91 (MQ=255) cTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGGCATGTCCGGCAtcgac < 2:1252175/95‑5 (MQ=255) cTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCgtgg > 1:265259/1‑150 (MQ=255) ttCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCgtggt > 2:497916/1‑150 (MQ=255) tCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTTAGCTTGTGGCTGAGACGCACTTTACGCAGCATGTCGATGCCGGACTTACCCGGCCTGTTCCAGTCGGTCAGCAGGAATTCGTAGTGACCGTGGTCCAGCATACCCAACCCCgtggtg > 2:537571/1‑150 (MQ=255) gTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCa > 2:355480/1‑150 (MQ=255) cATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGc > 1:833636/1‑127 (MQ=255) cATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGc < 2:833636/127‑1 (MQ=255) tCAAGATCGGCATGCTTTTCAGCTTGTTGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCCGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCTGTAAGTTGTATTGACCGTTTTCCAGCATCTGCAAATCCGTAGTTCCGTCATCgtttt < 2:479097/150‑5 (MQ=255) aaGACCGGCATGCTTTTCAGCTTTGCGCTTGCGCGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCGCTTCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTtcg < 1:1022666/150‑1 (MQ=255) aGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTtcgt > 2:510536/1‑150 (MQ=255) cccGGCACGCTTTTCAGCGTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTtcgtcg < 1:1035453/149‑1 (MQ=255) aCCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTtcgtcg < 1:497916/150‑1 (MQ=255) cATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGtt < 2:1153172/150‑1 (MQ=255) aTGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTg < 1:355480/150‑1 (MQ=255) aTGCTTTTCAGCTTGTCGCTGCAAAGTAGTTTTCGCAGCAGTTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTg < 1:91/150‑1 (MQ=255) tGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTtcgtcg > 1:1130842/1‑143 (MQ=255) tGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTtcgtcg < 2:1130842/143‑1 (MQ=255) gCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGt < 1:755066/150‑1 (MQ=255) ttttCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAg > 2:988971/1‑89 (MQ=255) ttttCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAg < 1:988971/89‑1 (MQ=255) aGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGACGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCTGCTTCTTCGTTGTTTGGGAAAccc < 2:797356/150‑1 (MQ=255) ttGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTGCCAGTCGGTCACCAGGAAGACGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAgg > 2:1142485/1‑150 (MQ=255) cGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCAc < 2:1017598/150‑1 (MQ=255) tGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCa > 2:616248/1‑150 (MQ=255) tGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCa > 2:182275/1‑150 (MQ=255) acgcacTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAg > 2:211652/1‑70 (MQ=255) acgcacTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAg < 1:211652/70‑1 (MQ=255) acTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAAc < 2:658711/144‑1 (MQ=255) acTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAAc > 1:658711/1‑144 (MQ=255) tttACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCtt < 2:539963/150‑1 (MQ=255) tACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTtga < 2:828576/150‑1 (MQ=255) agcagGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATc > 1:1287271/1‑150 (MQ=255) agcagGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAAGCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATc > 1:36784/1‑150 (MQ=255) ggTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATccgcc < 2:507829/150‑1 (MQ=255) gATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCAt > 1:1137600/1‑150 (MQ=255) caTGCCGGGCATGTCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCAACGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGAGTTTGATGATCCGCCGCAt > 1:1141676/2‑150 (MQ=255) aTGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGGAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCAtc > 1:1084937/1‑150 (MQ=255) ccGGACCTGCCCGCCATCCGCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCAtcgtc < 2:36784/150‑1 (MQ=255) gaaCATGCCGGGCATG‑TCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCATCGTCGaa > 2:938593/3‑150 (MQ=255) | AACGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCATCGTCGAA > NC_002947/4931098‑4931388 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |