| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 441,740 | G→T | 7.9% | L206L (CTG→CTT) | bioF → | 8‑amino‑7‑oxononanoate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 441,740 | 0 | G | T | 7.9% | 226.2 / 4.9 | 72 | L206L (CTG→CTT) | bioF | 8‑amino‑7‑oxononanoate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/32); new base T (3/3); total (37/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCCAGCCGCCTGGACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCGGCAGCGAGGCGCTGATCGAGGCGCTG > NC_002947/441591‑441887 | gCCAGCCGCCTGGACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGAT‑CGCAACCAGACCCGTCCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGGTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑Tg < 2:49260/150‑1 (MQ=255) cAGCCGCCTGGACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑Tggg < 1:707623/150‑1 (MQ=255) cAGCCGCCTGGACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑Tggg < 2:181793/150‑1 (MQ=255) aGCCGCCTGGACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTAATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGc > 2:1321476/1‑150 (MQ=255) aGCCGCCTGGACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTAATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGc > 2:1321386/1‑150 (MQ=255) gccTGGACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCAccc > 1:1004376/1‑150 (MQ=255) gccTGGACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCAcc > 2:2675/1‑149 (MQ=255) gccTGGACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCAcc < 1:2675/149‑1 (MQ=255) cTGGACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGACAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTg < 2:1132567/150‑1 (MQ=255) ggACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCGTGGCTGATGGGCGACGTCTCCCATGGCC‑TGGGCACCCTggg > 2:589624/1‑150 (MQ=255) gACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGt < 2:1320736/150‑1 (MQ=255) ggCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCCCACTggaggcaaa > 2:1223402/1‑143 (MQ=255) ggCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCAGGGTGccca < 2:997706/150‑3 (MQ=255) gCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAACGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TTGGCGTCCAGGGTGcgcag < 2:1239377/150‑5 (MQ=255) cccTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCAtcg > 2:638796/1‑150 (MQ=255) tggtggTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCAtcgtcg > 2:1259111/1‑150 (MQ=255) ggtggtGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGa < 2:1024602/150‑1 (MQ=255) gtgACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCAc > 2:657870/1‑150 (MQ=255) gACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCCTTTGGCACCCAGGGTGcccagg > 2:606762/1‑125 (MQ=255) gACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCCTTTGGCACCCAGGGTGcccagg < 1:606762/129‑5 (MQ=255) ccGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTg < 1:97914/150‑1 (MQ=255) cGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGAACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTGTgg > 1:1366294/1‑150 (MQ=255) tGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCt > 2:1114994/1‑150 (MQ=255) gCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TTGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTgg > 2:1108696/1‑150 (MQ=255) gCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGgatg > 1:206280/1‑150 (MQ=255) cATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGgatga < 1:463768/150‑1 (MQ=255) cATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGgatga > 2:419559/1‑150 (MQ=255) aTGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGgatgat < 2:1004376/150‑1 (MQ=255) aTGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGCTCGACGATGCCGCCGCCT‑TTGGCACCCTGGGTGCCAAAggcg > 2:782924/1‑112 (MQ=25) aTGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGCTCGACGATGCCGCCGCCT‑TTGGCACCCTGGGTGCCAAAggcg < 1:782924/112‑1 (MQ=25) tGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGatgatg < 1:419559/150‑1 (MQ=255) tGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGatgatg > 1:1245067/1‑150 (MQ=255) tGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAggcgg > 1:186104/1‑105 (MQ=255) tGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAggcgg < 2:186104/105‑1 (MQ=255) cTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTg > 2:536619/1‑150 (MQ=255) tGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGa < 2:1055582/150‑1 (MQ=255) gCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATc > 2:1219540/1‑150 (MQ=255) g‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCt < 1:342487/150‑1 (MQ=255) cGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTgg < 2:1245067/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCTTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTggg > 1:335682/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCCGATCAGCACgggtac < 1:589624/150‑6 (MQ=255) gcTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCaa < 1:657870/150‑1 (MQ=255) gCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCt > 1:988734/1‑150 (MQ=255) gCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGgc < 1:558546/150‑1 (MQ=255) ccGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGTAAGGCTTGCGGCACTGCGGgcgc > 2:4758/1‑150 (MQ=255) ccGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGgcgc > 1:71488/1‑150 (MQ=255) gcgGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCt > 2:613117/1‑150 (MQ=255) ggTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCttt < 2:334666/150‑1 (MQ=255) cTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCAtc > 1:751651/1‑61 (MQ=255) cTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCAtc < 2:751651/61‑1 (MQ=255) tGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGca < 1:1395120/150‑2 (MQ=255) ggCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCtt > 1:580514/1‑123 (MQ=255) ggCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCtt < 2:580514/123‑1 (MQ=255) ggCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCg > 2:823464/1‑150 (MQ=255) tGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGatgatg > 2:321704/1‑87 (MQ=255) tGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGatgatg < 1:321704/87‑1 (MQ=255) tGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCGGCa < 1:963922/150‑1 (MQ=255) tCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGgatgat > 2:1350350/1‑80 (MQ=255) tCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGgatgat < 1:1350350/80‑1 (MQ=255) tCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCGGCAGCGAgg > 2:471066/1‑150 (MQ=255) cgacgCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCTTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCGGCAGCGAGGCGCt < 2:335682/150‑1 (MQ=255) cgacgCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCGGCAGCGAGGCGCt > 2:1244577/1‑150 (MQ=255) cgCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCGGCAGCGAGGCGCTGAt < 2:573866/150‑1 (MQ=255) gCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCGGCAGCGAGGCGCTGATc < 1:1412495/150‑1 (MQ=255) cccATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCGGCAGCGAGGCGCTGATCg < 1:1321386/150‑1 (MQ=255) cccATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCAATGAAGGCCACTTTGTTCCCGGCAGCGAGGCGCTGATCg < 1:1321476/150‑1 (MQ=255) ccATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAggcggcgg < 2:642904/36‑1 (MQ=255) ccATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAggcggcgg > 1:642904/1‑36 (MQ=255) cATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCGGCAGCGAGGCGCTGATCGAg > 1:586408/1‑150 (MQ=255) aTGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCGGCAGCGAGGCGCTGATCGAgg < 1:1259111/150‑1 (MQ=255) c‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCGGCAGCGAGGCGCTGATCGAGGCGCTg > 2:385194/1‑150 (MQ=255) c‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCGGCAGCGAGGCGCTGATCGAGGCGCTg < 2:71488/150‑1 (MQ=255) c‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCGGCAGCGAGGCGCTGATCGAGGCGCTg > 2:1032887/1‑150 (MQ=255) c‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCGGCAGCGAGGCGCTGATCGAGGCGCTg > 2:1159257/1‑150 (MQ=255) atGGGCGCCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCGGCAGCGAGGCGCTGATCGAGGCGATg < 1:1274334/149‑1 (MQ=255) | GCCAGCCGCCTGGACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTG‑CCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGCCTGGCTGATGGTCGACGACGCCCATGGCC‑TGGGCACCCTGGGTGCCAAAGGCGGCGGCATCGTCGAGCACTTTGGCCTGGGCGTGGATGATGTACCCGTGCTGATCGGCACGCTGGGCAAGGCTTGCGGCACTGCGGGCGCCTTTGTTGCCGGCAGCGAGGCGCTGATCGAGGCGCTG > NC_002947/441591‑441887 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |