| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,974,082 | T→A | 8.2% | K523* (AAG→TAG) ‡ | flgK ← | flagellar hook‑associated protein FlgK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,974,082 | 0 | T | A | 8.2% | 226.3 / 7.9 | 73 | K523* (AAG→TAG) ‡ | flgK | flagellar hook‑associated protein FlgK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/35); new base A (3/3); total (35/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 | |||||||||||
GTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATCGAATCGCGAATCGACTGCTGGATCAGTGCG > NC_002947/4973936‑4974227 | gTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACttgtt > 2:894802/1‑150 (MQ=255) ggCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTc < 2:1408596/150‑1 (MQ=255) ggCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTc < 1:644559/150‑1 (MQ=255) ggCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTc < 1:1321611/150‑1 (MQ=255) ggCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACAAGTTGTc < 2:1030632/150‑1 (MQ=255) cATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACAAGTTGTcca < 1:1353901/150‑2 (MQ=255) aCGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAg < 1:911777/150‑1 (MQ=255) aCAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCt > 2:271162/1‑141 (MQ=255) aCAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCt < 1:271162/141‑1 (MQ=255) tAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACttgtt < 1:1032254/130‑1 (MQ=255) tAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACttgtt > 2:1032254/1‑130 (MQ=255) tAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGc > 2:640397/1‑150 (MQ=255) tAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGc < 1:455540/150‑1 (MQ=255) tCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTa > 1:203983/1‑150 (MQ=255) tCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTa < 1:640397/150‑1 (MQ=255) cATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTAc < 1:554737/150‑1 (MQ=255) cATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTAc < 2:1127753/150‑1 (MQ=255) aTTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCCCCACCCTGCCGGTAcc > 2:483938/1‑150 (MQ=255) aTTGGCCGCAGGGATGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTAcc > 2:1059442/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTgg < 1:894802/150‑1 (MQ=255) gggCTGCCACCGATTCTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGCTTCCTTGTATTATCCAGTATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGCACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTa < 2:37302/150‑1 (MQ=255) gCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCtt < 2:203983/150‑1 (MQ=255) ccACCGATTGTGGTCTCGGCGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTg > 1:321118/1‑150 (MQ=255) ccACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTg < 2:1104610/150‑1 (MQ=255) gtgGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAAc < 1:778122/150‑1 (MQ=255) tctcGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCt < 2:1412235/126‑1 (MQ=255) tctcGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCt > 1:1412235/1‑126 (MQ=255) ctcGACGGAAAAGGTTGGTGTTTTTCCTCTACCATCCAGAAGCGGGTCGCCGTCCGCATCTAGCATCGGCACTTCGATGGACAACTTGCTTTCCTTCTCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCtt < 2:275961/150‑1 (MQ=255) tcGACGTCAAAGGGACGCGGGTTACGGCTTGCATCCAGAGTCGGGTCTCCGGCCGCCTCCAGGACCGGCACGACTCTGGACAACTAGTTGTCCTGCCCAGGGACAACGCTGACGGTACCAACCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCttt > 2:239994/1‑149 (MQ=255) tcGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTg > 2:985372/1‑150 (MQ=255) gACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTa > 1:1008149/1‑150 (MQ=255) aCGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAg < 2:1202639/150‑1 (MQ=255) gCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCCACCAGCATGGGCACGGCCATGGGCAACATGTTGTCCTGCCAAGGGACCGCGCTGCCAGGACCAATCTGTGTCCCCTTGACGTCGATCAGCTTGTAGccc > 2:499618/1‑150 (MQ=255) aaaGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTg > 1:948519/1‑150 (MQ=255) ggTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGa > 2:1360130/1‑150 (MQ=255) gTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTa > 2:1321902/1‑140 (MQ=255) gTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTa < 1:1321902/140‑1 (MQ=255) gggTTACCGCTACCATCCAGAATCTGGTCGCCGGCAGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGGCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGGGCCACCg > 1:472869/1‑150 (MQ=255) ttACCGCTACCATCCAGCATCGGGCCGCCGGCAGCAACCCGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTg < 2:1008149/150‑1 (MQ=255) tACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGt > 2:1360335/1‑150 (MQ=255) aTCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTa > 1:578877/1‑85 (MQ=255) aTCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTa < 2:578877/85‑1 (MQ=255) tCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGaa < 2:408197/110‑1 (MQ=255) tCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGaa > 1:408197/1‑110 (MQ=255) tCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTCTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAac < 1:1360130/150‑1 (MQ=255) aGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATATGGGTCCCCGTGTCGTGGAACAGCTTGTAGCTCTGGGAGCCACCGCTGGCCGCGTCGAAcacc > 2:336992/1‑150 (MQ=255) aaTCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAAcaccac < 1:1059442/150‑1 (MQ=255) tccatcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgaTGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGATCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCAcgcg > 2:254664‑M2/36‑150 (MQ=255) ccatcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgaTGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTg < 1:1081614‑M2/95‑1 (MQ=255) ccatcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgaTGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTg > 2:1081614‑M2/35‑129 (MQ=255) atcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgaTGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTg > 2:1291429‑M2/33‑127 (MQ=255) atcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgaTGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTg < 1:1291429‑M2/95‑1 (MQ=255) CGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCg > 2:948519‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGACACCTCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGGCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCAt > 1:1155382‑M1/1‑150 (MQ=255) gccgCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATc > 1:517912/1‑150 (MQ=255) gccgCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTAGAACACCACGCGTACCGGCATc > 2:617654/1‑150 (MQ=255) cgCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTgg < 1:796256/73‑1 (MQ=255) cgCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTgg > 2:796256/1‑73 (MQ=255) gCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATcgaa < 2:321118/150‑1 (MQ=255) cATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGaa > 1:516377/1‑88 (MQ=255) cATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGaa < 2:516377/88‑1 (MQ=255) cAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATcgaatcgcg < 1:1103369/150‑1 (MQ=255) aGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATcgaatcgcga > 1:1167469/1‑150 (MQ=255) gCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATcgaatcgcgaa > 1:1109276/1‑150 (MQ=255) cATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATcgaatcgcgaat < 1:617654/150‑1 (MQ=255) aTCGGAACGGAGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGATGCCGGTAGCAATCTGGGTCCCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATcgaatcgcgaatc < 2:293188/150‑1 (MQ=255) gCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGa < 2:717481/94‑1 (MQ=255) gCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGa > 1:717481/1‑94 (MQ=255) aggACAACAAGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCa > 1:25/2‑98 (MQ=255) aggACAACAAGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCa < 2:25/97‑1 (MQ=255) aggACAACAAGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATCGAATCGCGAATCGACTGCTGGATCa > 2:832261/2‑150 (MQ=255) ggACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATCGAATCGCGAATCGActgctg < 2:531680/144‑1 (MQ=255) ggACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATCGAATCGCGAATCGActgctg > 1:531680/1‑144 (MQ=255) aCAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAAcaccac < 2:411071/109‑1 (MQ=255) aCAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAAcaccac > 1:411071/1‑109 (MQ=255) aaCTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATCGAATCGCGAATCGACTGCTGGATCAGTGCg < 2:1109276/150‑1 (MQ=255) | GTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATCGAATCGCGAATCGACTGCTGGATCAGTGCG > NC_002947/4973936‑4974227 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |