| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 482,090 | G→A | 7.5% | Q92* (CAA→TAA) | PP_0396 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 482,090 | 0 | G | A | 7.5% | 217.6 / 2.7 | 75 | Q92* (CAA→TAA) | PP_0396 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/33); new base A (2/4); total (38/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.30e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGTGACGTTTGACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTGATCTGCTCGCCATGTTCCATATCCATGATGG > NC_002947/481946‑482239 | tggatatggaacatggcgagcagatcagtattcccgggcgcgacatcgacgaaccggtcttgcatcatggtcgtgggggcaaacagaccatcgtgcatcctggcaacaaagaattcactgccggtgaacacatcCCACCGCCTTGCGGcc < 1:413431‑M1/16‑1 (MQ=255) gTGACGTTTGACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCg > 1:1333484/1‑150 (MQ=255) gTGACGTTTGACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCg > 1:1333528/1‑150 (MQ=255) tGACGTTTGACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGt > 1:708555/1‑150 (MQ=255) aCGTTTGACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTgg < 2:604905/150‑1 (MQ=255) gTTTGACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGa < 2:1131770/150‑1 (MQ=255) ggaacatggcgagcagatcagtattcccgggcgcgacatcgacgaaccggtcttgcatcatggtcgtgggggcaaacagaccatcgtgcatcctggcaacaaagaattcactgccggtgaacacatcCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGAt > 2:413431‑M1/128‑150 (MQ=255) acgaGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATgtgt > 1:1423122/4‑150 (MQ=255) acgaGGTAGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATCCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTGGCCGGAATTGCCGGCCTTGACGCCACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCAGTGGGATgtgt > 2:589352/4‑150 (MQ=255) aGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGttgt < 1:760633/150‑3 (MQ=255) aGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCa > 1:969240/1‑150 (MQ=255) gTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCAcc > 1:1009647/1‑150 (MQ=255) gTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAg > 1:501533/1‑150 (MQ=255) gTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAg > 1:1376582/1‑150 (MQ=255) tAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGt < 2:510523/150‑1 (MQ=255) tAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGt < 2:1216618/150‑1 (MQ=255) ttCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTttgtt > 2:645692/1‑150 (MQ=255) ttCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTttgtt < 2:708555/150‑1 (MQ=255) ttCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTttgtt < 2:969240/150‑1 (MQ=255) ttCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTttgtt < 1:645692/150‑1 (MQ=255) gAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGCAGACGAACTTGTCCATGCCCTCGCCTGAATTGCCGGCCTTGCCGCGGCCTCCACCGCCTCCACCACCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGcc > 1:1133464/1‑150 (MQ=255) aTGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGa < 2:501533/150‑1 (MQ=255) tGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGAt < 1:695244/150‑1 (MQ=255) aaTTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGc < 2:1376582/150‑1 (MQ=255) aaTTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGc < 2:70797/150‑1 (MQ=255) ttCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGt < 2:1158047/106‑1 (MQ=255) ttCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGt > 1:1158047/1‑106 (MQ=255) ttCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCAc > 2:479832/1‑150 (MQ=255) gacgaaccggtcttgcatcatggtcgtgggggcaaacagaccatcgtgcatcctggcaacaaagaattcactgccggtgaacacatcCCACGGCCGCAAGGCGGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTc > 2:1045440‑M1/88‑131 (MQ=255) gacgaaccggtcttgcatcatggtcgtgggggcaaacagaccatcgtgcatcctggcaacaaagaattcactgccggtgaacacatcCCACGGCCGCAAGGCGGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTc < 1:1045440‑M1/44‑1 (MQ=255) gagaAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTgg < 1:97166/105‑1 (MQ=255) gagaAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGa < 2:231377/107‑1 (MQ=255) gagaAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGa > 1:231377/1‑107 (MQ=255) gagaAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCg < 2:32480/118‑1 (MQ=255) gagaAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCg > 1:32480/1‑118 (MQ=255) gagaAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCACTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTgg > 2:97166/1‑105 (MQ=255) ttcttcCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGcc > 1:880334/1‑132 (MQ=255) ttcttcCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGcc < 2:880334/132‑1 (MQ=255) atcatggtcgtgggggcaaacagaccatcgtgcatcctggcaacaaagaattcactgccggtgaacacatcCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGAt < 2:177924‑M1/23‑1 (MQ=255) atcatggtcgtgggggcaaacagaccatcgtgcatcctggcaacaaagaattcactgccggtgaacacatcCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGAt > 1:177924‑M1/72‑94 (MQ=255) tGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCAc > 1:765541/1‑150 (MQ=255) tGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCAc > 2:541293/1‑150 (MQ=255) ggAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCat < 2:1423122/150‑1 (MQ=255) aaacagaccatcgtgcatcctggcaacaaagaattcactgccggtgaacacatcCCACCGCCTTGCGGCCGTgg > 2:1173024‑M1/55‑74 (MQ=255) aaacagaccatcgtgcatcctggcaacaaagaattcactgccggtgaacacatcCCACCGCCTTGCGGCCGTgg < 1:1173024‑M1/20‑1 (MQ=255) gTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCgg > 1:1009433/1‑150 (MQ=255) tCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGt < 2:1133464/150‑1 (MQ=255) tCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGt < 1:541293/150‑1 (MQ=255) aTGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCa < 2:61703/81‑1 (MQ=255) aTGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCa > 1:61703/1‑81 (MQ=255) cccTCGCCGGAATTGCCGGCGGTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGAGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTCGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTtcgtcg > 2:133874/1‑150 (MQ=255) cTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCt > 1:1296185/1‑110 (MQ=255) cTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCt < 2:1296185/110‑1 (MQ=255) cTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGAt > 2:830253/1‑150 (MQ=255) gCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGa > 1:192921/1‑134 (MQ=255) gCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGa < 2:192921/134‑1 (MQ=255) aacaaagaattcactgccggtggacacatcCCACGGCCGCAAGGCGGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGCTGTCGCGCCCg < 1:58702‑M1/120‑1 (MQ=255) tGCCCGCCTTGCCGCGCCCGCCACCGCCTCCGCCGCCTTACGGCCGTGGGATGTGTTCCCCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTATTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCgg < 1:589352/150‑1 (MQ=255) caaagaattcactgccggtgaacacatcCCACGGCCGCAAGGCGGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCggg < 2:1049601‑M1/122‑1 (MQ=255) cGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATg < 1:1226160/92‑1 (MQ=255) cGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATg > 2:1226160/1‑92 (MQ=255) 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ttGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTg > 2:383789/1‑150 (MQ=255) tGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTGa < 1:383789/150‑1 (MQ=255) ccGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGACTACTGATc > 1:20929/1‑150 (MQ=255) cgACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTGATCTGc < 2:1333484/150‑1 (MQ=255) cgACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTGATCTGc < 2:1333528/150‑1 (MQ=255) caccgcctccaccgcctTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTGATCTGCTCGCCAt > 1:1189501/1‑150 (MQ=255) CCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTGATCTGCTCGCCATGTTCCata > 2:1316969‑M1/1‑150 (MQ=255) ttGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTGATCTGCTCGCCATGTTCCATATCCatgat > 1:776945/1‑150 (MQ=255) gCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTGATCCGCTCGCCATGTTCCATATCCATGATgg < 2:1009647/150‑1 (MQ=255) | GGTGACGTTTGACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTGATCTGCTCGCCATGTTCCATATCCATGATGG > NC_002947/481946‑482239 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |