| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,417,434 | C→G | 7.7% | A100P (GCG→CCG) | gudD ← | bifunctional D‑glucarate dehydratase/L‑idarate epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,417,434 | 0 | C | G | 7.7% | 201.6 / 7.3 | 65 | A100P (GCG→CCG) | gudD | bifunctional D‑glucarate dehydratase/L‑idarate epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/31); new base G (2/3); total (31/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.82e-01 | |||||||||||
CATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGCCGGTATTGCCGG > NC_002947/5417293‑5417583 | cATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTcgc < 2:352410/150‑1 (MQ=255) aTCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTcgcg < 2:221756/150‑1 (MQ=255) gcgTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACTCGGCGGGTCGCggcc < 2:323543/150‑3 (MQ=255) gcgTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGACCGCGACTCGGCGGGTCGCggcc < 2:1197703/150‑3 (MQ=255) tGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAg < 2:1261006/150‑1 (MQ=255) gCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGa < 1:926498/132‑1 (MQ=255) gCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGa > 2:926498/1‑132 (MQ=255) cTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACTCGGCGGGTCGCggcct > 1:840855/1‑136 (MQ=255) cTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACTCGGCGGGTCGCggcct < 2:840855/139‑4 (MQ=255) cTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAg > 2:256816/1‑145 (MQ=255) cTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAg < 1:256816/145‑1 (MQ=255) tCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTgg > 1:1399727/1‑150 (MQ=255) ccAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCa > 2:823973/1‑150 (MQ=255) aGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATg < 1:841565/150‑1 (MQ=255) aGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATg > 1:976144/1‑150 (MQ=255) aGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATg < 1:452432/150‑1 (MQ=255) aGCAACGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGGCGCGATACTCGAAGGTCTGGCGCATg > 1:73471/1‑150 (MQ=255) gCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATgg < 2:599714/150‑1 (MQ=255) ctgcCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGTGCATGGCATTGa < 2:1063865/150‑1 (MQ=255) tgcCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAg > 2:499236/1‑150 (MQ=255) tgcCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAg > 2:958270/1‑150 (MQ=255) tgcCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAg < 1:1030900/150‑1 (MQ=255) cATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCAc < 1:823973/150‑1 (MQ=255) aTCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCAcg > 1:285090/1‑150 (MQ=255) aTCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGAATGTACGGTAATGAGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGATGTGGCTCATGGCATTGAGCAcg > 2:682808/1‑150 (MQ=255) ggCACATTCAGGTGTTGGCCGAGCAGGTGGAGCAACGCTGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGCGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACgcgc < 2:598948/150‑1 (MQ=255) aTTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTa > 1:404279/1‑150 (MQ=255) cAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCCCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATg < 1:858256/150‑1 (MQ=255) gCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGc < 2:580504/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGac > 2:1002261/1‑150 (MQ=255) gTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGac > 2:868817/1‑150 (MQ=255) gTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGac > 1:906743/1‑150 (MQ=255) aGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGacatgg < 2:54937/150‑5 (MQ=255) gCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGAccacca < 2:906743/150‑1 (MQ=255) gACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCgg > 1:542281/1‑150 (MQ=255) gATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTg < 1:254880/84‑1 (MQ=255) gATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTg > 2:254880/1‑84 (MQ=255) gATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGac > 1:908016/1‑132 (MQ=255) gATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGac < 2:908016/132‑1 (MQ=255) gATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGACGACCACCAGGCTGCGGGCGtc > 1:178371/1‑150 (MQ=255) gATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTCGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGACCGACAACAAGGCTGCGGGCGtc > 2:304433/1‑150 (MQ=255) gTTACCGAATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGAGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAgg < 1:1032248/150‑1 (MQ=255) aCCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAg < 2:1319951/146‑1 (MQ=255) aCCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAg > 1:1319951/1‑146 (MQ=255) aCCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTc < 2:976144/150‑1 (MQ=255) gCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGTATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTgg > 2:652187/1‑150 (MQ=255) tGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTcgc < 2:542281/150‑1 (MQ=255) cgcAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGACCAACAACGACTCTGCGTGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTcgccg < 1:958270/150‑1 (MQ=255) gcAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTcgccgc > 1:1048119/1‑150 (MQ=255) gcAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTcgccgc > 2:1088184/1‑150 (MQ=255) gcAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTcgccgc > 1:417835/1‑150 (MQ=255) aGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGccgccg > 2:3044/1‑150 (MQ=255) ggTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTc < 1:1159842/150‑1 (MQ=255) gTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAg > 2:445352/1‑59 (MQ=255) gTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAg < 1:445352/59‑1 (MQ=255) tCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCTCCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAgg > 2:1291727/1‑116 (MQ=255) tCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCTCCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAgg < 1:1291727/116‑1 (MQ=255) cAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAgg < 2:235946/112‑1 (MQ=255) cAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAgg > 1:235946/1‑112 (MQ=255) aGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAgg < 2:1399727/150‑1 (MQ=255) gCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCAGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCACAGGcc > 2:629172/1‑150 (MQ=255) ccGCGACGCGGCGGGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGCCg > 2:951488/1‑150 (MQ=255) ccGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGCCg < 1:499236/150‑1 (MQ=255) ccGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGCCg < 1:1262298/150‑1 (MQ=255) aCCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGCCGGTAtt < 1:868817/150‑1 (MQ=255) ccgccgAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGc > 1:461933/1‑108 (MQ=255) ccgccgAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGc < 2:461933/108‑1 (MQ=255) gccgAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTcgccgctgc > 1:452735/1‑121 (MQ=255) gccgAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTcgccgctgc < 2:452735/124‑4 (MQ=255) ccgAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGCCGGTATTGCCgg < 1:791635/150‑1 (MQ=255) | CATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAATGCGCAGGTCGAAGGTCTGCAGGCCGCGACCCGCCGAGTCGCGGTTGGCGAAGGTCTGGCGCATGGCATTGAGCACGCGCTGGTAATGGCCGATCGGCTGGCCGACCACCAGGCTGCGGGCGTCCTCCAGGGTCTGGCGAATCTTCTCGCCGCCGGGCACTTCGCCCAGGCCGGTATTGCCGG > NC_002947/5417293‑5417583 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |