| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,667,310 | A→C | 6.7% | intergenic (+37/+34) | nhaP → / ← PP_4975 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/acyl‑CoA thioesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,667,310 | 0 | A | C | 6.7% | 195.1 / 6.5 | 77 | intergenic (+37/+34) | nhaP/PP_4975 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/acyl‑CoA thioesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/40); new base C (2/3); total (34/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.32e-01 | |||||||||||
CGAGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTCGACA > NC_002947/5667162‑5667455 | cGAGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGaa > 1:1023953/1‑150 (MQ=255) gAGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAAc > 1:952187/1‑150 (MQ=255) aGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAAcc > 2:629902/1‑150 (MQ=255) ggAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAAccc > 1:451584/1‑150 (MQ=255) aaCGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCcgc < 1:736580/150‑1 (MQ=255) cGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGa > 1:855669/1‑150 (MQ=255) gggACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGaa < 2:451584/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAagag < 1:348098/150‑1 (MQ=255) tgctgctgTCGATCACCGACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCTCTTCGCGTGTTCACCCGGGAATGGGcc < 2:166872/150‑1 (MQ=255) gctgctgTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCg < 1:1250982/150‑1 (MQ=255) gTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAGCCCGCGAAGAGGCCGGCACAg > 1:840523/1‑150 (MQ=255) gTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAg < 2:393774/150‑1 (MQ=255) gTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAg < 1:1200985/150‑1 (MQ=255) gTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAg > 2:1315219/1‑150 (MQ=255) gTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAg > 2:1200985/1‑150 (MQ=255) gTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAg < 1:629902/150‑1 (MQ=255) tCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGCATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGCGTGGACCCGCGAAGAGGCCGGCACAgg > 2:108833/1‑150 (MQ=255) gATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGCGaatgg < 2:702585/137‑4 (MQ=255) gATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGCGaatgg > 1:702585/1‑134 (MQ=255) gATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCa > 2:325182/1‑150 (MQ=255) aTCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCaa > 1:340407/1‑150 (MQ=255) aCCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTTAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCa > 1:1319479/1‑150 (MQ=255) ccTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAg > 2:697476/1‑150 (MQ=255) ccTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAg < 1:1083301/150‑1 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCGGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCGGCTTTGCGGCCCATTCTCGGGTTAATCGGCTAGGTTTCCTTCATAGGCAACCAgg > 2:1007885/1‑150 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCCTTCGCGGGAGACGAAGCGAAGACGTCGGCACAGTCAACCAgg > 1:1022447/1‑150 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAgg > 2:47056/1‑150 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAgg < 2:340407/150‑1 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAgg < 2:855669/150‑1 (MQ=255) gtggtgTTGTCGCCGGCTCTGGCGCAGCGGTTGGGAATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGAGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTAtt < 1:1001480/150‑1 (MQ=38) gtgtTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGa < 1:697476/150‑1 (MQ=255) tgtCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCACGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGc < 2:952187/150‑1 (MQ=255) tcgtcgATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTTCACCCGCGaa > 2:1246483/1‑112 (MQ=255) tcgtcgATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGc > 1:1031848/1‑117 (MQ=255) tcgtcgATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGc < 2:1031848/117‑1 (MQ=255) tcgtcgATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCAATACCACGTTGAGCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCg > 2:398130/1‑150 (MQ=255) tcgtcgATTCTCGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTTCACCCGCGaa < 1:1246483/112‑1 (MQ=39) aTTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGTGAGCCGCGGTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCg < 1:1315219/150‑1 (MQ=255) tGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGaa > 1:1388236/1‑150 (MQ=255) tGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGaa < 1:341386/150‑1 (MQ=255) gTGCAGGGGTTGAGCCTGGGGCGGGGAGTGCGCAAGGTCCGCGCG‑CAACAGCTTGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATGCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGCGCTCTTCGACTGCCGAATCCGGGAGCt > 2:199835/1‑150 (MQ=255) tGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTg > 2:1283509/1‑150 (MQ=255) aGGGGTTGAGCCTTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGCGTGGATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTc < 1:398130/150‑1 (MQ=255) aGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAGCCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTc < 2:840523/150‑1 (MQ=255) aGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTc > 2:811167/1‑150 (MQ=255) aGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTc > 2:1323749/1‑150 (MQ=255) ggggTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTcc < 1:274992/150‑1 (MQ=255) ggTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGAGCACGGTCAGCACCAGAGCCTCAAG‑GCGCTGCGGCCACTTTGCGGCCCCTTCGGGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTg < 1:1027495/150‑1 (MQ=255) cATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGACGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTAc > 1:728912/1‑150 (MQ=255) gCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAgg < 2:77581/102‑1 (MQ=255) gCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAgg > 1:77581/1‑102 (MQ=255) gCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGAtc > 2:862920/1‑150 (MQ=255) gCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGAtc < 1:782585/150‑1 (MQ=255) tggtgCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACTGTTCAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGt < 1:602212/150‑1 (MQ=255) gcgcAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTTCACGTACTTGATATTGGTgagc > 2:655118/1‑150 (MQ=255) cgcAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGcc > 2:940439/1‑150 (MQ=255) aaGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTCTTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCAt > 2:902586/1‑150 (MQ=255) aaGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCAt < 1:284920/150‑1 (MQ=255) gctCAGCGCG‑GAGCCTTGAGAATGCCGCCGCCGGTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATgg < 1:1364521/148‑1 (MQ=255) cc‑cACCCTTGAGAATGCCGGCGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGCGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCgg < 1:655118/150‑1 (MQ=255) c‑cAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCa > 2:406280/1‑76 (MQ=255) c‑cAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCa < 1:406280/76‑1 (MQ=255) gaccTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCaa < 1:95632/148‑1 (MQ=255) aGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGTCaa < 2:1022447/150‑1 (MQ=255) cTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTg > 1:4843/1‑127 (MQ=255) cTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTg < 2:4843/127‑1 (MQ=255) gagaATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATc < 2:1319479/150‑1 (MQ=255) gggCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAgg < 1:902586/150‑1 (MQ=255) cGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGa < 1:1007885/150‑1 (MQ=255) gCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCa > 1:701626/1‑150 (MQ=255) cccATTGGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAAGCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCAt < 1:263752/150‑1 (MQ=255) ccATTCGCGGGCAAACCTGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTATCTTAGCATACGAGATAACCCCTTGGGTTCGGCACGTACTGTATCCCGGTCCACCCATGGGCTGCCGGCTATCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATc < 1:325182/150‑1 (MQ=255) cATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCt > 2:1067385/1‑150 (MQ=255) cgcgGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTc < 1:862920/150‑1 (MQ=255) cgcgGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTc < 1:47056/150‑1 (MQ=255) cgGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTCGa < 1:940439/150‑1 (MQ=255) ggTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTCGACa < 2:1388236/150‑1 (MQ=255) ggTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTCGACa < 1:1283509/150‑1 (MQ=255) | CGAGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCC‑CAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTCGACA > NC_002947/5667162‑5667455 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |