| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,718,230 | T→G | 6.1% | V291V (GTT→GTG) | PP_5020 → | methyl‑accepting chemotaxis protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,718,230 | 0 | T | G | 6.1% | 188.4 / 4.2 | 66 | V291V (GTT→GTG) | PP_5020 | methyl‑accepting chemotaxis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/34); new base G (2/2); total (30/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.22e-01 | |||||||||||
CGGCAATGCCCAGCTCGCCAGCGAGCAAGCG‑CTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAACGCCGCGAC > NC_002947/5718083‑5718377 | cGGCAATGCCCAGCTCGCCAGCGAGCAAGAGACAGC‑ACCCATGGTTGAACAAAGCATGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGc < 2:690786/150‑1 (MQ=255) aaTGCCCAGCTCGCCAGCGAGCAAGCG‑CTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCAcc > 1:91131/1‑150 (MQ=255) aaTGCCCAGCTCGCCAGCGAGCAAGCG‑CTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCAcc > 2:517246/1‑150 (MQ=255) aTGCCCAGCTCGCCAGCGAGCAAGCG‑CTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGACAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCg > 2:808228/1‑150 (MQ=255) cccAGCTCGCCAGCGAGCAAGCG‑CTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTGGCAACCGTga < 1:153781/150‑2 (MQ=255) cAGCGCGCCAGCGAGCAAGCG‑CTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTg < 2:301832/150‑1 (MQ=255) aGCTCGCCAGCGAGCAAGCG‑CTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTgg > 1:332511/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGAGCAAGCG‑CTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTg < 1:888535/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGAGCAAGCG‑CTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTg < 2:1406387/150‑1 (MQ=255) cAGCGAGCAAGCG‑CTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCACCAAGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGc < 1:100734/150‑1 (MQ=255) cAGCGAGCAAGCG‑CTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGc > 2:1081410/1‑150 (MQ=255) cAGCGAGCAAGCG‑CTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGc > 2:1181642/1‑150 (MQ=255) aGCAAGCG‑CTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTg < 1:1003579/150‑1 (MQ=255) cAAGCG‑CTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGc < 1:804338/150‑1 (MQ=255) gCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGgc > 2:1306950/1‑150 (MQ=255) aCGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGgccgc < 1:99534/150‑1 (MQ=255) cGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGgccgcc > 2:632004/1‑150 (MQ=255) gTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGcc < 2:360458/150‑1 (MQ=255) ttGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTg < 1:1338576/129‑1 (MQ=255) ttGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTg > 2:1338576/1‑129 (MQ=255) gAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCAtt < 1:517246/150‑1 (MQ=255) cAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTAcc < 2:435875/150‑1 (MQ=255) aaGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGt < 1:382540/106‑1 (MQ=255) aaGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGt > 2:382540/1‑106 (MQ=255) ggCACGGTACTGCTGAACCGTGGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGCTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCCGGCAATACCACTGCTCAGGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCgg < 1:434412/150‑1 (MQ=255) gCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGc > 1:1147149/1‑150 (MQ=255) aCGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAg > 2:816563/1‑150 (MQ=255) ggTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGat < 2:627755/150‑1 (MQ=255) tgctgcAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGatca > 1:937071/1‑147 (MQ=255) tgctgcAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGatca < 2:937071/147‑1 (MQ=255) cagccagATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTgcg > 2:710796/1‑150 (MQ=255) atgatgACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAaca > 2:220952/1‑150 (MQ=255) atgaCCGCTTCGCAAACCGAGGGGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTg < 1:384088/150‑1 (MQ=255) gaCCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCt > 1:148627/1‑135 (MQ=255) gaCCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCt < 2:148627/135‑1 (MQ=255) cGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCctgct > 1:1191773/1‑93 (MQ=255) cGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCctgct < 2:1191773/93‑1 (MQ=255) cTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGcgccg < 2:1147149/150‑1 (MQ=255) ttCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACAATACGcgccga > 2:153934/1‑149 (MQ=255) tCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACAGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGCGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCa < 2:412908/150‑1 (MQ=255) gCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCaga < 1:808228/150‑1 (MQ=255) aaaCCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTTGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGc < 1:456669/150‑1 (MQ=255) cGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGNCAGATCNTCATTCCGCTGCNCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCgtgt < 1:1241800/150‑1 (MQ=255) cGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCgtgt < 2:399902/150‑1 (MQ=255) gcgcGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAg > 1:113660/1‑150 (MQ=255) gATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGga < 1:613605/150‑1 (MQ=255) gccgctgccgcGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGAc < 1:632004/150‑1 (MQ=255) cgctgccgcGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCt > 1:160413/1‑150 (MQ=255) gctgccgcGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTg > 1:994932/1‑150 (MQ=255) gctgccgcGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTg > 1:795967/1‑150 (MQ=255) ctgccgcGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGa < 2:160413/150‑1 (MQ=255) tgccgcGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGAc < 1:1306950/150‑1 (MQ=255) ccAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGc > 1:149598/1‑150 (MQ=255) ccAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTAGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGc < 1:816563/150‑1 (MQ=255) cAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTgc > 1:85488/1‑104 (MQ=255) cAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTgc < 2:85488/104‑1 (MQ=255) cAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCa > 2:612976/1‑150 (MQ=255) acacTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTa > 1:756982/1‑150 (MQ=255) cagcACGGTGGCAACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGa > 2:142830/4‑128 (MQ=255) cagcACGGTGGCAACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGa < 1:142830/125‑1 (MQ=255) cagcACGGTGGCAACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAAcg > 2:421839/4‑150 (MQ=255) tCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCgggg < 2:1022575/51‑1 (MQ=255) tCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTggg > 1:1022575/1‑51 (MQ=255) aCGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAAcgccgc > 1:764581/1‑150 (MQ=255) ggTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAACGCCGcga < 1:710796/150‑1 (MQ=255) gTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAACGCCGcgac < 1:585632/150‑1 (MQ=255) | CGGCAATGCCCAGCTCGCCAGCGAGCAAGCG‑CTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAACGCCGCGAC > NC_002947/5718083‑5718377 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |