| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 516,282 | A→T | 5.6% | L238Q (CTG→CAG) | PP_0429 ← | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 516,282 | 0 | A | T | 5.6% | 217.9 / 3.6 | 71 | L238Q (CTG→CAG) | PP_0429 | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/33); new base T (2/2); total (36/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.53e-01 | |||||||||||
GGAATAGATCGTCCACAGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATGCG > NC_002947/516133‑516424 | ggAATAGATCGTCCACAGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGgca > 1:1342969/1‑150 (MQ=255) gAATAGATCGTCCACAGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGgcag > 1:1208343/1‑150 (MQ=255) aTAGATCGTCCACAGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGgcagca < 2:348308/150‑1 (MQ=255) aTAGATCGTCCACAGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGgcagca < 2:387056/150‑1 (MQ=255) tCGTCCACAGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCACCGCGGCTGCTGCcgc > 1:626038/1‑150 (MQ=255) tCCACAGCACTTGCTCCGTGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGt > 2:285603/1‑150 (MQ=255) cacaGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCACCGCGGCTGCTGCCGCGCTgg < 2:626038/150‑2 (MQ=255) tCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACgccagcca < 2:1208343/150‑1 (MQ=255) cATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCcagccagc < 1:224306/150‑1 (MQ=255) cATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCcagccagc > 1:40333/1‑150 (MQ=255) cATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCcagccagc < 1:946903/150‑1 (MQ=255) cATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGAGGTGAGAACGCcagccagc > 1:1064090/1‑150 (MQ=255) aTGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGaa < 1:1272580/138‑1 (MQ=255) aTGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGaa > 2:1272580/1‑138 (MQ=255) aTGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCg < 2:40333/150‑1 (MQ=255) gAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTgc < 1:503590/150‑1 (MQ=255) ggTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCgcc > 1:429963/1‑150 (MQ=255) cGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGAGGTGAGAACGCCAGCCAGCGGTTGCgccggc < 2:1064090/150‑1 (MQ=255) gCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGtt > 2:1062619/1‑139 (MQ=255) gCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGtt < 1:1062619/139‑1 (MQ=255) gCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGccggccgg < 2:579658/150‑1 (MQ=255) tCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGaa > 1:1370362/1‑113 (MQ=255) tCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGaa < 2:1370362/113‑1 (MQ=255) tCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGt > 2:1228826/1‑150 (MQ=255) cAGCCTTGAGCCGCTCTCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGGCGGGCATGATCAGTg < 1:49227/150‑1 (MQ=255) aGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGt > 1:315095/1‑99 (MQ=255) aGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGt < 2:315095/99‑1 (MQ=255) ccGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCtt < 1:123879/150‑1 (MQ=255) cGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTg > 2:61306/1‑150 (MQ=255) cTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTc > 1:1109669/1‑150 (MQ=255) tCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTcc < 1:1159740/150‑1 (MQ=255) cccAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGt < 1:290711/150‑1 (MQ=255) ccAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTg > 1:1397112/1‑150 (MQ=255) gTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCAt < 2:1181941/121‑1 (MQ=255) gTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCAt > 1:1181941/1‑121 (MQ=255) gCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCtt < 2:604575/136‑1 (MQ=255) gCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCtt > 1:604575/1‑136 (MQ=255) gCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCa < 1:61306/150‑1 (MQ=255) cTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCAc < 1:605272/150‑1 (MQ=255) aTTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACgg > 1:637334/1‑150 (MQ=255) ttCCATGCCTGAGGGGCAATCGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCGGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGGGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACggc > 2:158719/1‑149 (MQ=255) ttCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGgt > 2:951100/1‑150 (MQ=255) cATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAAc < 1:1169744/82‑1 (MQ=255) cATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAAc > 2:1169744/1‑82 (MQ=255) ccTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAgc < 2:637334/150‑1 (MQ=255) ccTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAgc < 2:1342969/150‑1 (MQ=255) cTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCGAGGGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGAATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTCCAggg > 2:145367/1‑148 (MQ=255) tGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAgcgc > 2:787592/1‑150 (MQ=255) aGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCa < 2:429963/150‑1 (MQ=255) ggcggTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCGGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAgcgc > 1:529695/1‑136 (MQ=255) ggcggTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCGGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAgcgc < 2:529695/136‑1 (MQ=255) ggATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGc > 2:284994/1‑150 (MQ=255) ccccGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCgg < 2:857316/92‑1 (MQ=255) ccccGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCgg > 1:857316/1‑92 (MQ=255) ccccGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGcgcg > 2:1159099/1‑150 (MQ=255) ccccGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGcgcg > 1:314584/1‑150 (MQ=255) ccGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGc > 2:108156/1‑150 (MQ=255) ccGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGc < 2:1397112/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCtt < 1:1228826/150‑1 (MQ=255) aGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCa < 1:105031/150‑1 (MQ=255) gCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCAt > 1:487295/1‑150 (MQ=255) ttGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCg > 1:229641/1‑150 (MQ=255) cgcACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGc < 1:108156/150‑1 (MQ=255) cgcACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGc > 1:1198703/1‑150 (MQ=255) gcACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGcc > 1:1139855/1‑150 (MQ=255) aCCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCTGCGGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCcgc < 2:550315/150‑1 (MQ=255) aCCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCcgc > 1:38927/1‑150 (MQ=255) gccagcGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCaa < 1:145367/150‑1 (MQ=255) gccagcGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCaa > 2:1039302/1‑150 (MQ=255) ccagcGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAgcgc < 1:972142/102‑1 (MQ=255) ccagcGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAgcgc > 2:972142/1‑102 (MQ=255) ccagcGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAAt < 1:951100/150‑1 (MQ=255) accgcgGCTGCTGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCtt < 2:216515/128‑1 (MQ=255) accgcgGCTGCTGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCtt > 1:216515/3‑130 (MQ=255) gcgcGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATgcg > 1:1216808/1‑150 (MQ=255) | GGAATAGATCGTCCACAGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATGCG > NC_002947/516133‑516424 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |