Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,896,392 | C→T | 7.5% | intergenic (‑161/+24) | cysU ← / ← sbp‑II | sulfate ABC transporter permease CysT/sulfate ABC transporter substrate‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,896,392 | 0 | C | T | 7.5% | 184.9 / 5.5 | 68 | intergenic (‑161/+24) | cysU/sbp‑II | sulfate ABC transporter permease CysT/sulfate ABC transporter substrate‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/35); new base T (3/2); total (30/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.50e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.99e-01 |
TGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCACCAGGTCCAGTTTCGGGAAC > NC_002947/5896245‑5896530 | tGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCAcgc > 2:952813/1‑150 (MQ=255) aCGCACTAAGCCCGGAAACAATCGCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCACACGCGGc < 1:16229/150‑1 (MQ=255) cACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCCGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGAGATACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGcccc < 1:1240910/150‑1 (MQ=255) aCTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGcccc < 2:1069088/149‑1 (MQ=255) aCTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGcccc > 1:1069088/1‑149 (MQ=255) aCTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCg > 2:104914/1‑150 (MQ=255) tAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑Ct > 1:542541/1‑150 (MQ=255) ggAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCAcgc < 1:585545/134‑1 (MQ=255) ggAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCAcgc > 2:585545/1‑134 (MQ=255) gAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTg < 1:540076/150‑1 (MQ=255) gAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTg < 1:1412223/150‑1 (MQ=255) aaTCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCGTGCGGcccattcgc < 2:1363606/139‑7 (MQ=39) aaTCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCGTGCGGcccattcgc > 1:1363606/1‑133 (MQ=39) aaTCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTgg < 2:1270447/146‑1 (MQ=255) aaTCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTgg > 1:1270447/1‑146 (MQ=255) tCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTa < 2:542541/150‑1 (MQ=255) cGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTTCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGACTGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACGGGGCCt < 2:132345/150‑1 (MQ=255) tGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGAt > 2:1292031/1‑150 (MQ=255) aaGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGa > 2:928992/1‑146 (MQ=255) aaGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGa < 1:928992/146‑1 (MQ=255) ttttGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTg > 1:827403/1‑150 (MQ=255) ttttGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTg < 1:97464/150‑1 (MQ=255) ttttGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTg > 2:530171/1‑150 (MQ=255) ttttGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTg > 2:533389/1‑150 (MQ=255) tGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTc < 2:861364/150‑1 (MQ=255) tCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑Ct > 1:213660/1‑110 (MQ=255) tCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑Ct < 2:213660/110‑1 (MQ=255) tCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAac > 2:632325/1‑150 (MQ=255) ccTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAaca < 2:827403/150‑1 (MQ=255) gggCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACAcc > 2:85455/1‑150 (MQ=255) gatctctTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGCGATCTTGGTTCCTTGCGGAAGCAACCTTGTGCCGCGAATGCGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCg < 2:518934/145‑1 (MQ=255) ctgctTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGcc > 1:371396/1‑150 (MQ=255) ttGGCAGCCTATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑GTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGcagatc > 1:518934/1‑145 (MQ=255) ttGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCcatca < 2:371396/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCAtt < 2:1387898/150‑1 (MQ=255) cAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCCCAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTga < 2:690433/150‑1 (MQ=255) aGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTgaa < 1:1035262/150‑1 (MQ=255) cATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCca > 1:470098/1‑138 (MQ=255) cATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCca < 2:470098/138‑1 (MQ=255) cATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAAt > 1:858832/1‑150 (MQ=255) gACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATc < 2:568028/113‑1 (MQ=255) gACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATc > 1:568028/1‑113 (MQ=255) acacAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTtg < 1:781109/150‑1 (MQ=255) aaGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGGCATCAGTGAAGAATTTCGGTTGTGCa > 2:330740/1‑150 (MQ=255) aaGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCa > 2:1038819/1‑150 (MQ=255) aaGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCATTGCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCa > 1:727757/1‑150 (MQ=255) aGGCTGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCGGCTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAg < 1:330740/150‑1 (MQ=255) tCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTcca < 1:530171/150‑1 (MQ=255) acaGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTgaagaa > 1:344897/1‑125 (MQ=255) acaGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTgaagaa < 2:344897/125‑1 (MQ=255) acaGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGCCAGTGCAGTCTTccacctt < 2:1022183/150‑3 (MQ=255) aTCATGGTGCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGCGCCGCACGCTGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCAGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGACTTTCGGTTGTGCATTCTTCCACCCACCAAAGt > 2:1350627/1‑150 (MQ=255) tCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTg < 2:821769/65‑1 (MQ=255) tCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTg > 1:821769/1‑65 (MQ=255) cATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTcc > 1:948289/1‑150 (MQ=255) aTGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCt > 2:1361847/1‑68 (MQ=255) aTGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGACGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCt < 1:1361847/68‑1 (MQ=255) tgtgcgtgtgGAAGCGGACGTGTGCCGCGAATGCGTTGCA‑TCGGCCGCGACTTCCCGTTGGCTCGTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGt < 2:727757/144‑1 (MQ=255) cTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGAt < 2:858832/150‑1 (MQ=255) cTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGAt < 2:1382676/150‑1 (MQ=255) aGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCACCa < 2:948289/150‑1 (MQ=255) aCCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCANTCTTCCACCCACNAAAGTCCTTGTCGATGGTCACCAGGTc < 1:1038819/150‑1 (MQ=255) ttGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCACCAGGTCCAg > 1:921824/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCACCAGGTCCAGTTTCg < 1:952813/150‑1 (MQ=255) cgcgAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCACCAGGTCCAGTTTCgg < 1:104914/150‑1 (MQ=255) aagcggggCCGCGTGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCACCAGGTCCAGTTTCGGGa > 1:617614/6‑150 (MQ=255) gcggggCCGCGTGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTc > 1:1421578/4‑102 (MQ=255) gcggggCCGCGTGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTc < 2:1421578/99‑1 (MQ=255) aaTGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCACCAGGTCCAGTTTCg < 2:1104418/145‑1 (MQ=255) aaTGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCACCAGGTCCAGTTTCg > 1:1104418/1‑145 (MQ=255) aaTGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCACCAGGTCCAGTTTCGGGAAc < 2:1199517/150‑1 (MQ=255) | TGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCGCACGCGGCCCCG‑CTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCACCAGGTCCAGTTTCGGGAAC > NC_002947/5896245‑5896530 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |