| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,002,280 | G→C | 9.2% | A26G (GCC→GGC) | amaA ← | L‑pipecolate oxidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,002,280 | 0 | G | C | 9.2% | 225.9 / 13.0 | 76 | A26G (GCC→GGC) | amaA | L‑pipecolate oxidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/30); new base C (3/4); total (42/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.37e-01 | |||||||||||
ACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCT > NC_002947/6002133‑6002429 | aCGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGcc < 1:288357/150‑1 (MQ=255) cGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGCCCAGGCCCTGGCCGGTGa < 2:1254089/150‑1 (MQ=255) aCCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTAGCGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGAcggtcgg > 2:824234/1‑150 (MQ=255) cGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGtt > 2:1067982/1‑150 (MQ=255) cGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGtt < 2:277243/150‑1 (MQ=255) cGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGa < 1:1067982/150‑1 (MQ=255) gATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTTGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGAc < 1:819395/150‑1 (MQ=255) gATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGAc > 1:919011/1‑150 (MQ=255) gATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGAc < 2:1291415/150‑1 (MQ=255) tCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCCGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGtt < 1:824234/150‑1 (MQ=255) aGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTccc > 2:168387/1‑150 (MQ=255) aGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTccc > 2:828719/1‑150 (MQ=255) tCCAGCACAATCACCGCCCTGCACTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACCGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTAACCGGGCAGGGCCTGGGCGGCGACGGCCGATGTGCTGTGGGGTTACCCCAAg < 2:558011/150‑1 (MQ=255) cAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCa > 2:686538/1‑150 (MQ=255) cAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCa > 1:770357/1‑150 (MQ=255) cAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCa > 1:682234/1‑150 (MQ=255) gCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCAtt < 1:1214067/150‑1 (MQ=255) gCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCAtt > 2:812487/1‑150 (MQ=255) gCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCAtt > 1:612774/1‑150 (MQ=255) aCGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCAttgt < 2:612774/150‑1 (MQ=255) gATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGCCCAGGCCCTGgccggtg > 2:280371/1‑110 (MQ=255) gATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGCCCAGGCCCTGgccggtg < 1:280371/112‑3 (MQ=255) cACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACg < 1:1197390/150‑1 (MQ=255) ttGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCg > 1:922704/1‑150 (MQ=255) gCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGa < 1:813705/150‑1 (MQ=255) cccTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGAc > 1:1172483/1‑150 (MQ=255) ccTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACa > 2:1367824/1‑150 (MQ=255) ccTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACa > 2:700338/1‑150 (MQ=255) ccTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGCCCAGGCCCTGgccggt < 1:517241/97‑2 (MQ=255) ccTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGCCCAGGCCCTGgccggt > 2:517241/1‑96 (MQ=255) ccTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGCCCAGGCCCTGGCCGGTGa > 2:87264/1‑99 (MQ=255) ccTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGCCCAGGCCCTGGCCGGTGa < 1:87264/99‑1 (MQ=255) ccTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGATCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCGCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACa > 1:454641/1‑150 (MQ=255) tCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGcc < 2:180998/150‑1 (MQ=255) aGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACAAACTTCGGACATGGCCGGc < 1:825405/150‑1 (MQ=255) aGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTcc > 2:284267/1‑150 (MQ=255) gATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCaa < 1:812487/150‑1 (MQ=255) tgccgccGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAAttt > 2:94063/2‑150 (MQ=255) cgccgACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGtt > 2:597057/1‑150 (MQ=255) gCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTggg > 1:893060/1‑150 (MQ=255) ccGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACgtgt > 2:597166/1‑87 (MQ=255) ccGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACgtgt < 1:597166/87‑1 (MQ=255) ccGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTgggg > 1:350076/1‑150 (MQ=255) cGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGc < 1:178181/121‑1 (MQ=255) cGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGc > 2:178181/1‑121 (MQ=255) cGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGc > 1:18468/1‑150 (MQ=255) tAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATAGCCGGCGCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGc > 2:824081/1‑150 (MQ=255) tACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCAttgt < 1:1104543/95‑1 (MQ=255) tACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCAttgt > 2:1104543/1‑95 (MQ=255) tACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTCTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAgg < 2:922704/150‑1 (MQ=255) gATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCttt < 2:855246/150‑1 (MQ=255) gATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTCCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCttt > 2:966727/1‑150 (MQ=255) aTCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTc < 2:18468/150‑1 (MQ=255) cacaGACATCGGCTTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTAGGCGGAGACGGTCGAACTGGCGGCACACCCTGACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCgg < 1:168387/150‑1 (MQ=255) cacaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCgg > 2:131850/1‑150 (MQ=255) cacaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCgg < 2:753912/150‑1 (MQ=255) cacaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCgg < 1:131850/150‑1 (MQ=255) cacaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCgg < 2:1330319/150‑1 (MQ=255) acaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGTCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCggg > 1:1321805/1‑150 (MQ=255) acaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGAc > 2:243804/1‑83 (MQ=255) acaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGAc < 1:243804/83‑1 (MQ=255) acaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCggg > 1:390555/1‑150 (MQ=255) aGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTa > 1:453286/1‑150 (MQ=255) aTCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAAcc > 1:862285/1‑150 (MQ=255) ggCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:1199521/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGc < 2:1172483/150‑1 (MQ=255) ccTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 1:16918/1‑150 (MQ=255) ccTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 2:718398/1‑150 (MQ=255) ccTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 2:1120529/1‑150 (MQ=255) cTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgg < 2:362149/150‑1 (MQ=255) cTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgg < 1:1037952/150‑1 (MQ=255) tCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggg > 1:913043/1‑150 (MQ=255) aCCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCGGGGt > 2:1249853/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCgg < 1:1120529/150‑1 (MQ=255) gCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGgt > 2:488591/1‑150 (MQ=255) cAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGgtgt > 1:400098/1‑150 (MQ=255) gCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCt > 1:408969/1‑150 (MQ=255) | ACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCT > NC_002947/6002133‑6002429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |