| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 612,761 | T→C | 8.6% | N475S (AAC→AGC) | dxs ← | 1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 612,761 | 0 | T | C | 8.6% | 223.8 / 8.2 | 81 | N475S (AAC→AGC) | dxs | 1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/41); new base C (4/3); total (37/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.97e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.43e-01 | |||||||||||
CTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGCCGTCCTCGCCGACCAGGCCG > NC_002947/612613‑612901 | cTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCttt < 2:1236158/150‑1 (MQ=255)cTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGtt < 1:926118/150‑1 (MQ=255) tCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTg > 1:527730/1‑150 (MQ=255) ccAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAACGGCCCGGCCGCTGTAcg < 1:1304060/150‑2 (MQ=255) cAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAg < 1:753741/150‑1 (MQ=255) cAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAg < 2:1337342/150‑1 (MQ=255) gTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGc < 1:370350/150‑1 (MQ=255) gCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGt > 1:696616/1‑150 (MQ=255) ccGAACACCCGAGTGGCCATTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGGGGGTTTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCACGTCCCCCGCA‑TCTACTTTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTg < 1:1391128/150‑1 (MQ=255) cagcagGGCCACTTTGTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCAt > 1:343963/1‑150 (MQ=255) gcagGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCt > 2:116158/1‑150 (MQ=255) ggggCCCCTTTTTCGCCCTGGCGGCGCACCACTCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTg < 1:262651/149‑1 (MQ=255) agGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTg < 2:1289759/150‑1 (MQ=255) ccACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCa < 1:215711/150‑1 (MQ=255) gCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTtctc < 1:116158/150‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCtcg > 1:1382893/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCtcgt < 2:723036/150‑1 (MQ=255) cggcggACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTg < 1:284367/150‑1 (MQ=255) ggcggACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAACGGCCCGGCCGCTGTAc < 2:1353436/104‑1 (MQ=255) ggcggACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAACGGCCCGGCCGCTGTAc > 1:1353436/1‑104 (MQ=255) cggACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGGAGGTCTCCGCTGATCGGCGCAGTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTgggg < 1:23739/150‑1 (MQ=255) cggACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGAGCAGTTCGTTCTCGTCGCTgggg < 1:226369/150‑1 (MQ=255) cggACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTCATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTgggg < 1:587063/150‑1 (MQ=255) cggACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCAGCTGAGCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑AGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTgggg < 1:1163582/150‑1 (MQ=255) cACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCg < 2:605/106‑1 (MQ=255) cACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCg > 1:605/1‑106 (MQ=255) cACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGtcat < 2:712063/150‑1 (MQ=255) cACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGtcat > 1:64682/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGGGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCa > 1:661649/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCa < 2:1382893/150‑1 (MQ=255) ttGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGc < 1:331632/150‑1 (MQ=255) tGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCa < 2:343963/150‑1 (MQ=255) cGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCa < 2:539792/144‑1 (MQ=255) cGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCa > 1:539792/1‑144 (MQ=255) gATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGcc > 1:197536/1‑150 (MQ=255) tctcCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCg < 2:1200214/150‑1 (MQ=255) ctcCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCgg < 1:211646/150‑1 (MQ=255) ccAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGa > 2:1323462/1‑150 (MQ=255) ccAGTGGTTGCAGGTCCCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGCCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGa < 1:1023618/150‑1 (MQ=255) cAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGc > 1:806075/1‑97 (MQ=255) cAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGc < 2:806075/97‑1 (MQ=255) gTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAgc > 2:81730/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGc < 1:877430/89‑1 (MQ=255) gCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGc > 2:877430/1‑89 (MQ=255) gCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCa > 1:353702/1‑150 (MQ=255) aGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGtc < 2:170558/120‑1 (MQ=255) aGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGtc > 1:170558/1‑120 (MQ=255) gTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCGCGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCa < 2:311044/125‑1 (MQ=255) gTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCGCGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCa > 1:311044/1‑125 (MQ=255) gTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTa > 2:259001/1‑150 (MQ=255) tcCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGa < 2:353702/150‑1 (MQ=255) gCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCtcgtc < 2:481776/102‑1 (MQ=255) gCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCtcgtc > 1:481776/1‑102 (MQ=255) tGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGt < 2:197536/150‑1 (MQ=255) ggCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAg > 1:488102/1‑150 (MQ=255) cgcATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCa < 1:1063748/110‑1 (MQ=255) cgcATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCa > 2:1063748/1‑110 (MQ=255) cATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGc < 2:527730/150‑1 (MQ=255) ttCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGtca < 1:674405/100‑1 (MQ=255) ttCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGtca > 2:674405/1‑100 (MQ=255) gggCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTtctc < 2:893908/83‑1 (MQ=255) gggCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTtctc > 1:893908/1‑83 (MQ=255) gggCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCg > 2:385234/1‑150 (MQ=255) gCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTg < 1:1323462/150‑1 (MQ=255) ccGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTgg < 1:81730/150‑1 (MQ=255) acGGTACC‑CGCGTGGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATACCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTgg > 1:340687/2‑150 (MQ=255) aCCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCgg < 1:259001/150‑1 (MQ=255) aCGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGcc > 1:423151/1‑150 (MQ=255) gcgtggTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGctg > 2:1100829/5‑148 (MQ=255) gcgtggTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGCCg > 1:631066/5‑150 (MQ=255) g‑ggTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCa > 1:575563/1‑88 (MQ=255) g‑ggTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCa < 2:575563/88‑1 (MQ=255) ccacctgTACAACGGCCCGGCCGCTGTACGGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGCCGTCCt > 2:534625/7‑150 (MQ=255) ccacctgTACAACGGCCCGGCCGCTGTAC‑GGTGGCCTGTCGTTAACGTCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGCCGTCCTc > 2:984769/7‑150 (MQ=255) gTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGCCGTCCTc < 1:85709/150‑1 (MQ=255) tACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGCCGTCCTCg > 1:1282415/1‑150 (MQ=255) ccGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGCCGTCCTCGcc > 1:997350/1‑150 (MQ=255) tgTACAACGGCCCGGCCGCTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGCTACGACCTGTCGTACCTGc > 2:560058/2‑124 (MQ=255) tgTACAACGGCCCGGCCGCTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGCTACGACCTGTCGTACCTGc < 1:560058/123‑1 (MQ=255) tACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGCCGTCCTCGCCGAc > 1:926871/1‑150 (MQ=255) cAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGCCGTCCTCGCCGACCa < 1:315972/150‑1 (MQ=255) gctgcgtcgTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGCCGTCCTCGCCGACCAGGCCg > 2:1421957/8‑150 (MQ=255) gccgggccgTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGCCGTCCTCGCCGACCAGGCCg < 1:385234/150‑1 (MQ=255) | CTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGCCGTCCTCGCCGACCAGGCCG > NC_002947/612613‑612901 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |