| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 683,826 | T→C | 7.1% | S10G (AGC→GGC) | PP_0585 ← | MerR family metal‑sensitive transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 683,826 | 0 | T | C | 7.1% | 243.1 / 6.6 | 84 | S10G (AGC→GGC) | PP_0585 | MerR family metal‑sensitive transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/43); new base C (4/2); total (39/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.09e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.89e-01 | |||||||||||
AAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAGGTAACCCA > NC_002947/683679‑683971 | aaaaGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGGTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTgc > 2:819110/1‑150 (MQ=255) gCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCCgcagcg > 1:515713/1‑150 (MQ=255) cccAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGcggcgg < 1:490359/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCggcgggc > 1:817519/1‑150 (MQ=255) aGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCggcgggcg > 2:62247/1‑150 (MQ=255) ggTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCCGCagcgggctc < 2:515713/150‑3 (MQ=255) gTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGggcggc > 2:1425486/1‑150 (MQ=255) gcTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGt < 1:1133102/150‑1 (MQ=255) gcTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGt > 2:285523/1‑150 (MQ=255) gatgaAGGCCAGGTTGTGCAAGCCTTGCGCCGGGTACAGGCGGTAGCCGCTGGCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCAt < 1:200464/150‑1 (MQ=255) tgaAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATgg > 1:1389926/1‑150 (MQ=255) tgaAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATgg < 1:653605/150‑1 (MQ=255) ccAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGcctc > 1:288694/1‑150 (MQ=255) cAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGcctcc > 2:1325231/1‑150 (MQ=255) ggTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTg < 1:41807/150‑1 (MQ=255) gTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTgcgg < 1:1389782/115‑1 (MQ=255) gTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTgcgg > 2:1389782/1‑115 (MQ=255) gTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTgg < 1:644579/150‑1 (MQ=255) gTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCAgg < 1:1425486/150‑1 (MQ=255) aaGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGtgctgc > 1:502800/1‑150 (MQ=255) ttGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCtggtg > 1:1166355/1‑150 (MQ=255) ttGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCtggtg < 2:160953/150‑1 (MQ=255) ttGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCtggtg > 1:317201/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCtggtgg < 2:502800/150‑1 (MQ=255) tGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCtggtgg < 2:821548/150‑1 (MQ=255) tGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCtggtgg < 1:1400402/150‑1 (MQ=255) ccTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGcggcgg < 2:478252/101‑1 (MQ=255) ccTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGcggcgg > 1:478252/1‑101 (MQ=255) ccTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTggg > 2:262435/1‑147 (MQ=255) ccTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTggg < 1:262435/147‑1 (MQ=255) ccTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGttt < 1:825979/150‑1 (MQ=255) cTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTGTGAGCAGGCCGATGGATTCGGAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGGCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTc > 2:53830/1‑150 (MQ=255) gTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGGGCCCCCTGGGTGTTGCTGGTAGGCTTCCAc > 2:605648/1‑150 (MQ=255) cAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGGGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTTCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGtt < 2:169669/150‑1 (MQ=255) ggTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAg < 2:1389926/150‑1 (MQ=255) gTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGc < 2:1166355/150‑1 (MQ=255) ccGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCcaca < 2:817519/150‑1 (MQ=255) cGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAg < 1:1407611/150‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTg > 1:869310/1‑150 (MQ=255) tGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGc < 1:1401372/150‑1 (MQ=255) tGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCt > 2:419083/1‑150 (MQ=255) cGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTga < 2:869310/150‑1 (MQ=255) gAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTgac > 1:1378396/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGc < 1:125542/150‑1 (MQ=255) cGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCt < 1:62247/150‑1 (MQ=255) tttGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCAt < 2:442655/81‑1 (MQ=255) tttGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCAt > 1:442655/1‑81 (MQ=255) gAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTg < 1:192802/150‑1 (MQ=255) gCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGCCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGCGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTAACGCCGCTGACACTGGACAgg > 1:1321325/1‑150 (MQ=255) ccGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAggg < 1:605648/150‑1 (MQ=255) ccGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAggg < 2:41071/150‑1 (MQ=255) cGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGc > 1:858432/1‑150 (MQ=255) ggATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGt < 2:985133/93‑1 (MQ=255) ggATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGt > 1:985133/1‑93 (MQ=255) gATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGTCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATgg < 1:419083/150‑1 (MQ=255) gATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAg > 1:1339544/1‑142 (MQ=255) gATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAg < 2:1339544/142‑1 (MQ=255) tCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATggcgg < 1:181041/150‑1 (MQ=255) 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ggATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCACTGTGGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAg > 1:154690/1‑150 (MQ=255) gATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCa < 2:868707/83‑1 (MQ=255) gATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCa > 1:868707/1‑83 (MQ=255) atcTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCg < 1:285523/150‑1 (MQ=255) cTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCggg > 2:854059/1‑150 (MQ=255) ttGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGt > 2:639341/1‑150 (MQ=255) tGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGtt > 2:188910/1‑150 (MQ=255) tGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGtt < 1:378398/150‑1 (MQ=255) gTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGa < 2:31846/150‑1 (MQ=255) tGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAg < 2:858432/150‑1 (MQ=255) gCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAgg < 2:317201/150‑1 (MQ=255) gAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCTGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAGGTaa < 1:650499/150‑1 (MQ=255) cgCCCGCCGCAGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGt < 2:1109759/61‑1 (MQ=255) cgCCCGCCGCAGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGt > 1:1109759/2‑62 (MQ=255) cgCCCGCCGCAGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAGGTAAc > 1:1233586/2‑150 (MQ=255) cgCCCGCCGCAGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAGGTAAc > 2:849165/2‑150 (MQ=255) aGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAGGTAAc > 2:783584/1‑150 (MQ=255) cccGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCa > 1:81223/1‑130 (MQ=255) cccGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCa < 2:81223/130‑1 (MQ=255) ccGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCAAAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAGGTAACCCa < 2:288694/150‑1 (MQ=255) | AAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAGGTAACCCA > NC_002947/683679‑683971 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |