| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 741,501 | G→T | 7.5% | intergenic (+98/‑402) | PP_t12 → / → PP_0635 | tRNA‑Thr/group II intron‑encoding maturase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 741,501 | 0 | G | T | 7.5% | 203.8 / 5.5 | 67 | intergenic (+98/‑402) | PP_t12/PP_0635 | tRNA‑Thr/group II intron‑encoding maturase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/28); new base T (2/3); total (36/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.47e-01 | |||||||||||
CGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACC > NC_002947/741361‑741613 | cGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCaa < 2:713329/150‑1 (MQ=255) gTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCTTACGCGCAAc < 2:1004365/150‑1 (MQ=255) gTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAAc > 2:401733/1‑150 (MQ=255) tAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAAcc > 1:570668/1‑150 (MQ=255) gcgAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCTTACGCGCaa < 2:183775/144‑1 (MQ=255) gcgAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCTTACGCGCaa > 1:183775/1‑144 (MQ=255) tcacAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTtgt < 2:1120111/147‑1 (MQ=255) gCAGGTTCGATTGCAGACTCTGGCACCAGAATCAGTTAGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAATCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCAAAGCATTGCGCGTTGCGCGTAAGCGCGACCCGCTTGGTTgtgg < 2:236322/150‑1 (MQ=255) gCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCACCCCGCTTGGTTgtgg > 1:236322/1‑150 (MQ=255) gCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTgtgg > 1:497927/1‑150 (MQ=255) aGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTgtggtg < 2:569236/150‑1 (MQ=255) gTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGc > 2:1119312/1‑150 (MQ=255) gATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAg > 1:894922/1‑150 (MQ=255) tCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTgg > 1:990089/1‑150 (MQ=255) cTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGt < 2:497927/150‑1 (MQ=255) cTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGt < 2:1038127/150‑1 (MQ=255) cTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCACTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGt > 1:1212003/1‑150 (MQ=255) cGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTgg > 1:384951/1‑150 (MQ=255) gCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAg < 1:401733/150‑1 (MQ=255) aCCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGt < 1:191278/150‑1 (MQ=255) ccAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGgtggtg > 1:979529/1‑150 (MQ=255) cAGAATCAGTTTGGCTATGCCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGa < 2:790640/150‑1 (MQ=255) cAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTgg < 1:1119312/150‑2 (MQ=255) cAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGa > 1:422585/1‑150 (MQ=255) gAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGaaa > 2:1234373/1‑150 (MQ=255) gAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGaaa < 1:706900/150‑1 (MQ=255) tCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGGCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGACAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTc > 1:413930/1‑150 (MQ=255) gTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGCAAGTcccc < 2:844413/150‑3 (MQ=255) gTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCctc < 1:500635/150‑1 (MQ=255) gTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTaca > 1:1339034/1‑150 (MQ=255) cTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTacaca > 1:334745/1‑150 (MQ=255) tATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTacacac < 1:1215381/150‑1 (MQ=255) tGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTgg < 2:1075122/118‑1 (MQ=255) tGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTgg > 1:1075122/1‑118 (MQ=255) gCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGt > 2:677024/1‑114 (MQ=255) gCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGt < 1:677024/114‑1 (MQ=255) gCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCgg > 1:1012898/1‑150 (MQ=255) tcGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCTTACGCGCAAcgc < 1:745090/85‑3 (MQ=25) tcGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCTTACGCGCAAcgc > 2:745090/1‑83 (MQ=25) tcGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGa > 1:1372681/1‑150 (MQ=255) gCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAg < 1:1234373/150‑1 (MQ=255) gCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAg > 1:507109/1‑150 (MQ=255) tACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAgtg > 2:209042/1‑150 (MQ=255) aCCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAgtgt > 2:83650/1‑150 (MQ=255) aCCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCgg > 2:459899/1‑150 (MQ=255) aCCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTCTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCgg > 2:426345/1‑150 (MQ=255) cAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAg < 1:459899/150‑1 (MQ=255) cAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGCGTTAGCCGGAg < 2:422585/150‑1 (MQ=255) aaTAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAgg > 1:1229422/1‑150 (MQ=255) aaTAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAgg < 2:507109/150‑1 (MQ=255) aaTAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAgg < 2:990089/150‑1 (MQ=255) aTAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGc > 2:1388157/1‑150 (MQ=255) tAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCa > 2:259377/1‑150 (MQ=255) gAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAg < 1:916973/150‑1 (MQ=255) gAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAACCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAg < 1:209042/150‑1 (MQ=255) aaGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGTGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAgg < 2:979529/150‑1 (MQ=255) gCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGT > 2:1315358‑M1/1‑150 (MQ=255) cccGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTG > 1:890211‑M1/1‑150 (MQ=255) ccGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGTTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGgtgt > 2:343909/1‑150 (MQ=38) ttGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCgg < 2:334745/150‑1 (MQ=34) ttGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCgg > 2:271384/1‑150 (MQ=34) gtgCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGt < 1:363913/150‑1 (MQ=32) cGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCct < 2:569252/96‑1 (MQ=32) cGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCct > 1:569252/1‑96 (MQ=32) gggCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTGTACTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGAcc > 1:375039/1‑150 (MQ=12) ttGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGT > 2:705356‑M1/1‑106 (MQ=255) ttGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGT < 1:705356‑M1/106‑1 (MQ=255) | CGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACC > NC_002947/741361‑741613 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |