Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 873,428 | T→C | 8.9% | L20P (CTT→CCT) | PP_5457 → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 873,428 | 0 | T | C | 8.9% | 178.5 / 4.2 | 64 | L20P (CTT→CCT) | PP_5457 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/28); new base C (3/3); total (33/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ATTGCCAGGTGTGCTGTCAGCCTGTGGTGTGCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCC > NC_002947/873279‑873577 | aTTGCCAGGTGTGCTGTCAGCCTGTGGTGTGCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCt > 2:1030147/1‑150 (MQ=255) ttGCCAGGTGTGCTGTCAGCCTGTGGTGTGCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCtt < 1:565622/150‑1 (MQ=255) ttGCCAGGTGTGCTGTCAGCCTGTGGTGTGCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCtt < 2:680349/150‑1 (MQ=255) gCCAGGTGTGCTGTCAGCCTGTGGTGTGCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAAGCATGCCTGc < 1:566301/150‑1 (MQ=255) ccAGGTGTGCTGTCAGCCTGTGGTGTGCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGcc > 1:650432/1‑150 (MQ=255) aGGTGTGCTGTCAGCCTGTGGTGTGCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAg > 2:1294561/1‑150 (MQ=255) tgtgCTGTCAGCCTGTGGTGTGCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGCAAAGCGATGTAGCATATCTACGAACCGGGAAGCCTGCTTCCGGC‑CAAATTCTTTTCAGGGATGCTTGCCAGCGa > 1:1095991/1‑150 (MQ=255) tgtgCTGTCAGCCTGTGGTGTGCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGa < 1:736771/150‑1 (MQ=255) tgCTGTCAGCCTGTGGTGTGCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAgg < 1:1079119/150‑1 (MQ=255) tGTCAGCCTGTGGTATGCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGa < 1:648789/150‑1 (MQ=255) gCCTGTGGTGTGCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGAt < 1:1188244/150‑1 (MQ=255) tgtgGTGTGCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTa < 2:1120323/150‑1 (MQ=255) gtgCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAAGCATGCCTGCCAGcat > 2:1145600/1‑129 (MQ=255) gtgCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAAGCATGCCTGCCAGcat < 1:1145600/131‑3 (MQ=255) tgCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGGGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTgg > 1:1205257/1‑150 (MQ=255) gCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGt > 1:1114488/1‑150 (MQ=255) gCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGt > 2:1212195/1‑150 (MQ=255) gCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGt < 1:1212195/150‑1 (MQ=255) aGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGt > 1:771462/1‑148 (MQ=255) aGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGt < 2:771462/148‑1 (MQ=255) ggTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGAc < 1:932665/150‑1 (MQ=255) gTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGAcc > 1:492600/1‑150 (MQ=255) cATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAgg < 1:937696/117‑1 (MQ=255) cATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAgg > 2:937696/1‑117 (MQ=255) tGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGt < 2:492600/150‑1 (MQ=255) gtaCGAAGCGATGCTTGCAGTCAGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGt < 1:878249/148‑1 (MQ=255) gAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTgccg > 2:645732/1‑150 (MQ=255) aaTGGATGCTTGAAGTACCCCAGGTGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACAGGAACGCCTTCTCGAGGCGTCTTGAC‑CGGGACTTCTTCTTGCCAGCGAGGGGATCGATTTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTgccgc < 1:1142296/150‑1 (MQ=255) ttGAAGTCCGCCGCGAGGACTACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCt > 1:489551/1‑150 (MQ=255) ttGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCt > 2:913137/1‑150 (MQ=255) ttGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCt > 2:1213842/1‑150 (MQ=255) gccgcGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCa < 1:1294561/150‑1 (MQ=255) aGGACGGCACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCct > 1:857254/1‑150 (MQ=255) gacgacACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCctgc > 2:123962/1‑150 (MQ=255) gacgacACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCctgc < 2:1114488/150‑1 (MQ=255) gacACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGc < 1:69677/143‑1 (MQ=255) gacACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGc > 2:69677/1‑143 (MQ=255) cacCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTgggg < 2:1205257/150‑1 (MQ=255) cacCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTgggg < 1:123962/150‑1 (MQ=255) ccTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCt > 2:446860/1‑150 (MQ=255) aTGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGAt > 2:1205983/1‑78 (MQ=255) aTGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGAt < 1:1205983/78‑1 (MQ=255) gCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGAGGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTcgtcgt < 2:489551/150‑1 (MQ=255) ccgatctccGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCAAGCGTTGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCtgatga < 2:1046897/143‑1 (MQ=255) cTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCtgatga > 1:250611/1‑150 (MQ=255) cGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCa < 1:446860/150‑1 (MQ=255) gAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAg < 1:178865/150‑1 (MQ=255) gAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAg > 2:178865/1‑150 (MQ=255) aCCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGAAGGATATACACGTGGCTTCCTGTGAGCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCGCGTCGTGGCTGATGAGCAGGc > 1:530897/1‑150 (MQ=255) cGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAgagatcgg > 1:1046897/1‑143 (MQ=255) ggAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTc > 1:751110/1‑85 (MQ=255) ggAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTc < 2:751110/85‑1 (MQ=255) gAAAGCCGGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGaa > 2:240216/1‑150 (MQ=255) aaaGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAAt > 1:92054/1‑150 (MQ=255) aaaGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAAt < 1:645732/150‑1 (MQ=255) ccTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGATAGCAAACGACCGGATAGATGTACATATGGGCGGCCGTGTGGTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATgcgc > 1:387734/1‑150 (MQ=255) cTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACgg < 2:250611/150‑1 (MQ=255) gcgcAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTcgtcgt > 2:492909/1‑116 (MQ=255) gcgcAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTcgtcgt < 1:492909/116‑1 (MQ=255) gcAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGAt < 1:1030147/150‑1 (MQ=255) ctcgC‑TGGCAAGCATGCCTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGa > 2:1209505/4‑150 (MQ=255) gcaggcaTGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTAc > 2:1297398/1‑150 (MQ=255) aggcaTGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACaa > 2:917987/1‑150 (MQ=255) gcaTGCCTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCg > 2:399947/1‑54 (MQ=255) gcaTGCCTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCg < 1:399947/54‑1 (MQ=255) aTGCTTGCCAGCGAGGTGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTGGTCGGTGCCGCCGGCACGCTGCCCCGTCAGGGCCTGCATAGGCTCGTCGTGACTGATGTTCAGGGCGACTCACCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAatgat > 2:94802/1‑150 (MQ=255) aTGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAatgat < 1:913137/150‑1 (MQ=255) ttGCCGGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGccc > 2:717428/1‑150 (MQ=255) | ATTGCCAGGTGTGCTGTCAGCCTGTGGTGTGCATTCTGCAGGTGCATGGTGACGAATGGATGCTTGAAGTCCGCCGCGAGGACGACACCTGATGCAGCGTATCTACGAACCGGAAAGCCTGCTTGAGGCGCAAATGC‑TGGCAGGCATGCTTGCCAGCGAGGGGATCGATGTACACGTGGTCGGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCC > NC_002947/873279‑873577 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |