| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 946,895 | G→C | 6.2% | T159T (ACC→ACG) | norR ← | DNA‑binding transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 946,895 | 0 | G | C | 6.2% | 235.9 / 4.7 | 75 | T159T (ACC→ACG) | norR | DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/37); new base C (2/3); total (35/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGACGAATTTCCTCCACCAGGCGTTTGTGCGCGGGGCTCTGGCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCATCAACGGGCAGCCCATGCAGTCGTGCACTTCAAGGTC > NC_002947/946746‑947044 | aGACGAATTTCCTCCACCAGGCGTTTGTGCGCGGGGCTCTGGCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACg > 2:1209736/1‑150 (MQ=255) gACGAATTTCCTCCACCAGGCGTTTGTGCGCGGGGCTCTGGCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACgg > 1:445431/1‑150 (MQ=255) cGAATTTCCTCCACCAGGCGTTTGTGCGCGGGGCTCTGGCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTg < 1:12096/150‑1 (MQ=255) aTTTCCTCCACCAGGCGTTTGTGCGCGGGGCTCTGGCCAATCAGCTCCCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTggcg > 2:1271910/1‑150 (MQ=255) ttCCTCCACCAGGCGTTTGTGCGCGGGGCTCTGGCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACCGTTACCGTggccga < 2:505970/150‑4 (MQ=255) ttCCTCCACCAGGCGTTTGTGCGCGGGGCTCTGGCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACCGTTACCGTggccga < 1:910503/150‑4 (MQ=255) tccACCAGGCGTTTGTGCGCGGGGCTCTGGCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGt < 1:675811/140‑1 (MQ=255) tccACCAGGCGTTTGTGCGCGGGGCTCTGGCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGt > 2:675811/1‑140 (MQ=255) caccaGGCGTTTGTGCGCGGGGCTCTGGCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAg < 2:1152118/150‑1 (MQ=255) aGGCGTTTGTGCGCGGGGCTCTGGCCACTTAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTg > 1:970077/1‑150 (MQ=255) aGGCGTTTGTGCGCGGGGCTCTGGCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGATTTATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTg > 1:13349/1‑150 (MQ=255) ggCGTTTGTGCGCGGGGCTCTGGACAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTgg < 2:538671/150‑1 (MQ=255) gCGTTTGTGCGCGGGGCTCTGGCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGc > 1:1077555/1‑150 (MQ=255) gattGTGCGCGGGGCTCTGGCCAATCAGCTGTCTATGCTGGCCGCTGGACTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGACCGGCCACGGCAACGGTGGCGGCAGCCGGGCTGGCaa > 2:592710/3‑150 (MQ=255) tttGTGCGCGGGGCTCTGGCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACCGTGGCGGCAGCCAGTCGGGCaaa > 2:81813/1‑150 (MQ=255) cgGGGCTCTGGCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCa < 1:1248007/150‑1 (MQ=255) gggCTCTGGCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTAGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGTCTGCAgg < 1:1324786/150‑1 (MQ=255) ctGGCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATc < 1:432742/150‑1 (MQ=255) gCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAg > 2:435523/1‑141 (MQ=255) gCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAg < 1:435523/141‑1 (MQ=255) tCAGCTCCCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCa < 1:1271910/150‑1 (MQ=255) ctctctATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACCGTTACCGTggccga > 1:1116048/1‑105 (MQ=255) ctctctATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACCGTTACCGTggccga < 2:1116048/108‑4 (MQ=255) ctctATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGctct < 2:1236335/150‑1 (MQ=255) tctATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTg > 2:193108/1‑150 (MQ=255) tCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGc > 2:492176/1‑123 (MQ=255) tCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGc < 1:492176/123‑1 (MQ=255) tCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAAc < 2:320084/150‑1 (MQ=255) ctagCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTg > 2:153163/4‑150 (MQ=255) cTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTggcgg > 2:887017/1‑98 (MQ=255) cTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTggcgg < 1:887017/98‑1 (MQ=255) cTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGACGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTg > 2:897759/1‑150 (MQ=255) cGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCa < 1:440583/117‑1 (MQ=255) cGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCa > 2:440583/1‑117 (MQ=255) gCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCggg > 1:110280/1‑150 (MQ=255) tggcctggcGGTAGAGCTCGGCGCGAAGGTGTTCGTCTTCGGCGAGAGGGCCCAGGCGCCGGATAGGCCCAGCTACGCTAACGGTGGGGGAACAAAGGCTGTCAAAGCCCTGCAGCACCGCAAACTCCGGGCGCTCGACGTGCCCgggtg > 2:594275/1‑148 (MQ=255) gcctggcGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTg > 1:1261507/1‑150 (MQ=255) ctggcGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGAATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAg > 1:339152/1‑150 (MQ=255) tggcGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTACCGGTGGCGGCCGCCAGGGCCGCAAAGGCCTGCAGTGCATCCATCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAgg < 1:27119/150‑1 (MQ=255) tggcGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAgg < 1:81813/150‑1 (MQ=255) tggcGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGAATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAgg < 2:339152/150‑1 (MQ=255) agagCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGa < 1:153163/150‑1 (MQ=255) gagCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGGAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAg < 1:173553/150‑1 (MQ=255) ggCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAgg < 1:139001/149‑1 (MQ=255) ggCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAgg < 2:1226164/136‑1 (MQ=255) ggCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAgg > 1:1226164/1‑136 (MQ=255) gcgcGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGAcc > 1:928435/1‑150 (MQ=255) gATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATAAGCTAGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGc > 1:1316501/1‑150 (MQ=255) tGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGccc > 2:354274/1‑150 (MQ=255) tGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGccc > 2:193367/1‑150 (MQ=255) ttCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAgg < 1:1341968/85‑1 (MQ=255) ttCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATgg < 1:193367/150‑1 (MQ=255) ttCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGACCTGCAgg > 2:1341968/1‑85 (MQ=255) gTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAgg > 2:1001530/1‑82 (MQ=255) gTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAgg < 1:1001530/82‑1 (MQ=255) gTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCa < 2:570498/137‑1 (MQ=255) gTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCa > 1:570498/1‑137 (MQ=255) ggCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATc > 1:212355/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATc < 2:1077555/150‑1 (MQ=255) cgcgcAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGt > 2:868468/1‑124 (MQ=255) cgcgcAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGt < 1:868468/124‑1 (MQ=255) cgcgcAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTTACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGa < 1:193108/150‑1 (MQ=255) gcAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGAGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCa < 1:1209736/150‑1 (MQ=255) gCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCATCAAc < 2:928435/150‑1 (MQ=255) gTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCATCAACGGGCa < 1:354274/150‑1 (MQ=255) gTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCATCAACGGGCa < 2:1261507/150‑1 (MQ=255) gTGCCCGATACGCTCCGCCACCGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCTAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCATCAACGGGCa < 1:594275/150‑1 (MQ=255) gATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCAAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGAGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCCTCGACCATCACCGGGCAGCCCAt > 2:1360165/1‑150 (MQ=255) tACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCATCAACGGGCAGCCCATGc > 1:242583/1‑150 (MQ=255) tCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCATCAACGGGCAGCCCATg > 1:571379/1‑144 (MQ=255) tCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCATCAACGGGCAGCCCATg < 2:571379/144‑1 (MQ=255) tCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCATCAACGGGCAGCCCATGCAGTCg > 2:297166/1‑150 (MQ=255) gCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCATCAACGGGCAGCCCATGCAGTCGTGc > 2:96660/1‑150 (MQ=255) ccACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCATCAACGGGCAGCCCATGCAGTCGTGCa > 1:726009/1‑150 (MQ=255) aCGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGAAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCATCAACGGGCAGCCCATGCAGTCGTGCACt < 2:445431/150‑1 (MQ=255) tAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCATCAACGGGCAGCCCATGCAGTCGTGCACTTCaa < 1:96660/150‑1 (MQ=255) aaCGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCATCAACGGGCAGCCCATGCAGTCGTGCACTTCAAg < 1:833369/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCATCAACGGGCAGCCCATGCAGTCGTGCACTTCAAGGTc < 2:1256966/150‑1 (MQ=255) | AGACGAATTTCCTCCACCAGGCGTTTGTGCGCGGGGCTCTGGCCAATCAGCTCTCTATCCTGGCCGCTGGCCTGGCGGTAGAGCTCGGCGCGATGGTGTTCGTCTTCGGCGCGCAGGGCCAGGTGCTCGATACGCTCGGCCACGGTAACGGTGGCGGCAGCCAGGCTGGCAAAGGCCTGCAGGGCATCCAGCTCCAGGCTCTGGAACTGCCCGGGGGTGAGGGCGTCGAGGGTGACCAGGCCCCATGGGCGCTCATCGACCATCAACGGGCAGCCCATGCAGTCGTGCACTTCAAGGTC > NC_002947/946746‑947044 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |