Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 77,500 | A→T | 9.0% | L15H (CTC→CAC) | rsmB ← | ribosomal RNA small subunit methyltransferase B |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 77,500 | 0 | A | T | 9.0% | 196.7 / 10.0 | 67 | L15H (CTC→CAC) | rsmB | ribosomal RNA small subunit methyltransferase B |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/24); new base T (3/3); total (40/27) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.86e-01 |
GCTTTTGCAGCAGCTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCT > NC_002947/77351‑77644 | gCTTTTGCAGCAGCTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGa < 1:18157/150‑1 (MQ=255) cTTTTGCAGCAGCTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAg > 1:268208/1‑150 (MQ=255) cagcagCTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGc > 1:373664/1‑150 (MQ=255) agcagcTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCg > 2:1027008/1‑150 (MQ=255) agcagcTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCg > 2:1206978/1‑150 (MQ=255) gcTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGTGCTCAGCGGcaa < 1:1309490/150‑3 (MQ=255) tgCGGCCAGCAGGTCGACGCGTGGCAGACAGCGTGTGGTACGGAACGCGAAGGGCTGGGTGAAGCCGAGGTGGCGTTCATCTTCTTTATCTAGTTGCGCCGGCCGCGAGCTGTTCAGAGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAgcgc > 2:521405/1‑150 (MQ=255) gCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACgg < 1:676620/150‑1 (MQ=255) ccAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGTGCTCAGCGGCAAg > 2:539662/1‑142 (MQ=255) ccAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGTGCTCAGCGGCAAg < 1:539662/142‑1 (MQ=255) gcagGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGc < 2:1177118/136‑1 (MQ=255) gcagGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGc > 1:1177118/1‑136 (MQ=255) gcagGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGggcgg > 2:139504/1‑150 (MQ=255) ggCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGTCGACGCCACGGTCATCTACCTTGTCCAGTTGAACCTGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTggg < 1:1385987/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTc > 2:150515/1‑150 (MQ=255) cctggCGTTCGGTACCGCACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGTGCTCAGCGGcaa < 2:1405772/116‑3 (MQ=255) cctggCGTTCGGTACCGCACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGTGCTCAGCGGcaa > 1:1405772/5‑118 (MQ=255) cAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCAtt > 1:183580/1‑150 (MQ=255) cAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCAtt > 2:684517/1‑150 (MQ=255) cAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCAtt < 1:1376344/150‑1 (MQ=255) aGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTg < 2:268208/150‑1 (MQ=255) gCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTgg < 1:150515/150‑1 (MQ=255) ggTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGc > 2:778926/1‑150 (MQ=255) tACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGt < 2:812542/131‑1 (MQ=255) tACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTACAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGt > 1:812542/1‑131 (MQ=255) aaCGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGc > 2:1077653/1‑150 (MQ=255) aCGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGcc < 1:213348/150‑1 (MQ=255) aGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCcggcgg < 1:684517/150‑1 (MQ=255) tCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGa > 2:390006/1‑150 (MQ=255) ccTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGaa < 1:584928/150‑1 (MQ=255) cTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAGGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGTCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAAc > 1:1203069/1‑150 (MQ=255) ggTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTtc > 1:171732/1‑150 (MQ=255) gCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTTTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGCACTTCTCgcgg > 1:57277/1‑150 (MQ=255) cgcgGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCtt < 1:608382/126‑1 (MQ=255) cgcgGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCtt > 2:608382/1‑126 (MQ=255) gcgGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGcggcgg > 1:815826/1‑150 (MQ=255) gTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTg > 2:1352984/1‑150 (MQ=255) gcgTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTg < 2:171732/150‑1 (MQ=255) gTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAAc > 2:1089327/1‑130 (MQ=255) gTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAAc < 1:1089327/130‑1 (MQ=255) tgtaTCTACCTTGTGCAGTTGCTCCTGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAAc > 2:1090560/4‑150 (MQ=255) tCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCTTCGGCTGTTAAGCAGGt > 2:793003/1‑150 (MQ=255) tCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGt < 2:815826/150‑1 (MQ=255) cTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTc > 2:82842/1‑150 (MQ=255) aCCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCAc > 2:537076/1‑150 (MQ=255) ccTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACt < 1:96624/150‑1 (MQ=255) ccTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACt > 1:986301/1‑150 (MQ=255) ttGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGa > 1:1090990/1‑150 (MQ=255) tGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGaa < 1:139504/150‑1 (MQ=255) tGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGaa < 2:1090990/150‑1 (MQ=255) gTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGACGTGTTCGCCG‑GCAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAg < 1:1027008/150‑1 (MQ=255) ttGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAAt < 1:1206978/150‑1 (MQ=255) gCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGACGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTgcc > 1:110703/1‑150 (MQ=255) cGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGCACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCa < 1:741672/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTgcc < 1:492243/140‑1 (MQ=255) gTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTgcc > 2:492243/1‑140 (MQ=255) ttCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGtt > 1:947976/1‑150 (MQ=255) ttCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACCTCTTTCCTGTGCCGGCTAACTGGTGAGGGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGtt < 1:603991/150‑1 (MQ=255) cAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGc < 1:476299/150‑1 (MQ=255) gCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAg > 2:438920/1‑150 (MQ=255) cGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAgg > 1:504652/1‑150 (MQ=255) aaGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCg > 1:136105/1‑150 (MQ=255) cTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTc > 1:744995/1‑150 (MQ=255) tt‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCa > 2:901623/1‑150 (MQ=255) tggCCGCTGTGCTCAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGAGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCa > 2:392049/3‑150 (MQ=255) ccGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAgg > 2:1154629/1‑130 (MQ=255) ccGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGCTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAgg < 1:1154629/130‑1 (MQ=255) cGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCt > 1:893811/1‑150 (MQ=255) | GCTTTTGCAGCAGCTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTT‑GCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCCCAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCT > NC_002947/77351‑77644 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |