| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 87,956 | G→C | 7.1% | R454R (CGC→CGG) | betC ← | choline‑sulfatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 87,956 | 0 | G | C | 7.1% | 273.0 / 10.2 | 85 | R454R (CGC→CGG) | betC | choline‑sulfatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (45/34); new base C (4/2); total (49/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.73e-01 | |||||||||||
AGGGGGGCGGGCTGTGGATAACGTGCCTTGCGTTCGAGGTCATCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCTCAGGTCATAGA > NC_002947/87807‑88104 | aGGGGGGCGGGCTGTGGATAACGTGCCTTGCGTTCGAGGTCATCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCcggcgg > 2:682178/1‑150 (MQ=255) ggcgggcTGTGGATAACGTGCCTTGCGTTCGAGGTCATCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGgcggcggcg > 2:996156/1‑150 (MQ=255) gggcTGTGGATAACGTGCCTTGCGTTCGAGGTCATCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCAGGAGGCGGCgctg > 2:101823/1‑150 (MQ=255) ggcTGTGGATAACGTGCCTTGCGTTCGAGGTCATCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCgctgg < 1:867548/150‑1 (MQ=255) tgtgGATAACGTGCCTTGCGTTCGAGGTCATCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCgctgg < 2:430808/147‑1 (MQ=255) tgtgGATAACGTGCCTTGCGTTCGAGGTCATCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCgctgg > 1:430808/1‑147 (MQ=255) gATAACGTGCCTTGCGTTCGAGGTCATCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCCGACTGCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCa > 1:1071392/1‑150 (MQ=255) tAACGTGCCTTGCGTTCGAGGTCATCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGt > 2:388039/1‑150 (MQ=255) cTTGCGTTCGAGGTCATCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACctgctg > 2:411309/1‑150 (MQ=255) ttGCGTTCGAGGTCATCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTgg > 1:310358/1‑150 (MQ=255) tGCGTTCGAGGTCATCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTATTGGCTGGCATCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGgc > 1:1038711/1‑150 (MQ=255) ggTCATCGAGATCGAGGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTgg < 2:249702/150‑1 (MQ=255) aTCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACctgc < 2:679814/133‑1 (MQ=255) aTCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACctgc > 1:679814/1‑133 (MQ=255) tCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATg > 1:814478/1‑150 (MQ=255) tCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATg > 2:411766/1‑150 (MQ=255) cGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCACTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGt < 2:15883/150‑1 (MQ=255) gATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAgcg > 2:1281674/1‑150 (MQ=255) 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gcATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCa > 2:1154447/1‑136 (MQ=255) gcATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCa < 1:1154447/136‑1 (MQ=255) cATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTc < 1:682178/150‑1 (MQ=255) cATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTc < 2:846704/150‑1 (MQ=255) tACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCAGCGCCGCCGccggct‑‑‑gg < 1:551449/97‑1 (MQ=255) tACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCAGCGCCGCCGccggct‑‑‑gg > 2:551449/1‑97 (MQ=255) aCTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCGTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGa > 1:608516/1‑150 (MQ=255) tGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTTAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACa > 1:625750/1‑150 (MQ=255) tGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACa > 1:898696/1‑150 (MQ=255) tGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACa > 2:216860/1‑150 (MQ=255) tGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCAGCGCCGCCGccggct‑‑‑gg > 2:806926/1‑94 (MQ=38) tGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCAGCGCCGCCGccggct‑‑‑gg < 1:806926/94‑1 (MQ=38) ttGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCtggct‑‑‑ggc > 2:761152/1‑93 (MQ=255) ttGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCtggct‑‑‑ggc < 1:761152/93‑1 (MQ=255) tggcGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCt > 1:138474/1‑150 (MQ=255) tggcGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCt < 1:996156/150‑1 (MQ=255) aggcGTGCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCt > 2:1065482/2‑150 (MQ=255) accaGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTgcagcagc > 2:405431/1‑150 (MQ=255) ccaGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTgcagcagca > 1:1220419/1‑150 (MQ=255) caGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCAc > 2:1092827/1‑150 (MQ=255) gTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGa > 1:17521/1‑102 (MQ=255) gTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGa < 2:17521/102‑1 (MQ=255) tggttggtGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCtg < 2:608516/150‑1 (MQ=255) gttggtGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCtggt > 2:99451/1‑150 (MQ=255) ttggtGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCtggtg < 2:138474/150‑1 (MQ=255) gtCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCgg < 1:216860/150‑1 (MQ=255) tCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTAATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCggg > 1:946141/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTa > 1:1388833/1‑68 (MQ=255) ccAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTa < 2:1388833/68‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCAt < 2:120161/113‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCAt > 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2:25721/1‑150 (MQ=255) cAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTg > 2:1130791/1‑150 (MQ=255) aGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGc < 2:898696/150‑1 (MQ=255) aGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGc < 1:1224803/150‑1 (MQ=255) gcgcTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTtc > 1:755243/1‑137 (MQ=255) gcgcTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTtc < 2:755243/137‑1 (MQ=255) gCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCgg < 2:1071392/150‑1 (MQ=255) ggccagccagCGCCGCCGCCGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCt > 2:276604/3‑150 (MQ=255) caccaGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTcgcg > 2:1258255/1‑150 (MQ=255) caccaGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCt > 1:53860/1‑150 (MQ=255) caccaGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCACGCTCGTGCGGGGCGCGGCt > 2:1327261/1‑150 (MQ=255) accaGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCTc > 2:915190/1‑150 (MQ=255) cagccagcGCCGCCGCCGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCTCAg > 1:130311/1‑150 (MQ=255) aGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCggg < 2:1263987/108‑1 (MQ=255) aGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCggg > 1:1263987/1‑108 (MQ=255) aGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCTCAgg < 2:583917/150‑1 (MQ=255) aGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCTCAgg < 1:1281674/150‑1 (MQ=255) aGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCTCAgg > 1:1261863/1‑150 (MQ=255) cggcggcggCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCTCAGGTCa > 1:1150388/1‑150 (MQ=255) gcggcggcgCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCTCAGGTCATa < 1:654163/150‑1 (MQ=255) ggcggcgCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCTCAGGTCATaga < 1:355166/150‑1 (MQ=255) ggcggcgCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCTCAGGTCATaga < 2:310358/150‑1 (MQ=255) | AGGGGGGCGGGCTGTGGATAACGTGCCTTGCGTTCGAGGTCATCGAGATCGATGTGGTTGCGCATGTACTGTTGGCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCT‑‑‑GGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCTCAGGTCATAGA > NC_002947/87807‑88104 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |