| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,024,313 | G→C | 6.4% | S279R (AGC→AGG) | opdP ← | glycine‑glutamate dipeptide porin |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,024,313 | 0 | G | C | 6.4% | 246.4 / 5.3 | 77 | S279R (AGC→AGG) | opdP | glycine‑glutamate dipeptide porin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/40); new base C (2/3); total (34/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
TCATTGCCGTTGACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCAC > NC_002947/1024164‑1024462 | tCATTGCCGTTGACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAgg > 1:462007/1‑150 (MQ=255)tCATTGCCGTTGACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAgg < 1:41931/150‑1 (MQ=255) ttGCCGTTGACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTg < 2:730111/150‑1 (MQ=255) ttGCCGTTGACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGCCTg > 2:1405556/1‑150 (MQ=255) gTTGACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCAc > 1:1074320/1‑150 (MQ=255) ttGACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGCGTGTTGGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACt < 1:1022931/150‑1 (MQ=255) tGACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGCCTGAGCAccg < 1:1323299/150‑3 (MQ=255) tGACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGCCTGAGCAccg < 1:186767/150‑3 (MQ=255) gACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTgc < 2:1323773/150‑1 (MQ=255) gACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTgc > 1:284002/1‑150 (MQ=255) gACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGCCTGAGCAccgg < 1:1405556/150‑4 (MQ=255) ctgctgCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCt > 2:231550/1‑150 (MQ=255) ctgctgCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCt > 2:1041096/1‑150 (MQ=255) ctgctgCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCt < 2:102987/150‑1 (MQ=255) gctgcCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGt < 1:372682/150‑1 (MQ=255) aggaggCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGTGCTGTCGCCGa > 1:9813/1‑150 (MQ=255) cgcTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACAt < 1:1424634/150‑1 (MQ=255) gcTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCCGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATg < 1:362035/150‑1 (MQ=255) gcTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATg > 2:362035/1‑150 (MQ=255) cTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATgg < 2:1158841/150‑1 (MQ=255) aGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTg < 2:427907/150‑1 (MQ=255) gggTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAgg < 1:526701/116‑1 (MQ=255) gggTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAgg > 2:526701/1‑116 (MQ=255) gCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAag < 1:231550/150‑1 (MQ=255) ttGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGgc > 2:6653/1‑141 (MQ=255) ttGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGgc < 1:6653/141‑1 (MQ=255) ttGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAagta < 2:678995/150‑1 (MQ=255) ttGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAagta < 1:593401/150‑1 (MQ=255) aTGCGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAgtagta < 2:462007/150‑1 (MQ=255) aGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTc > 2:634994/1‑150 (MQ=255) ccAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGa > 2:639649/1‑150 (MQ=255) ccAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGa > 2:379261/1‑150 (MQ=255) ccAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGa > 2:382877/1‑150 (MQ=255) cactcaCAGGCTGTAATTTTCGTTTTCGATCTTTCCCATTTTCTGGCTACCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTTAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGCTTCCAGaa < 2:518836/145‑1 (MQ=255) cAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGaa > 1:786193/1‑150 (MQ=255) cAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCAGAAGTAGTACTGGTTCCAGaa > 2:865276/1‑150 (MQ=255) cAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGACGGCATAGACGTGCTCTTAGGAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGaa < 1:878765/150‑1 (MQ=255) cAGTGACAGGCGGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGTGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGaa < 1:181673/150‑1 (MQ=255) gACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTcc < 2:786193/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTc < 1:183408/150‑1 (MQ=255) aGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTc < 1:595616/149‑1 (MQ=255) aGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTc > 2:595616/1‑149 (MQ=255) tggaaGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGGAGCGACGGTATTGCCTGAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGGGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCt > 2:760645/4‑150 (MQ=255) tAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTtg < 1:848412/150‑1 (MQ=255) tCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTgg > 1:734787/1‑100 (MQ=255) tCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTgg < 2:734787/100‑1 (MQ=255) cGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGc < 1:1276712/150‑1 (MQ=255) gATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCt > 1:1389879/1‑150 (MQ=255) aTCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTg < 1:1041096/150‑1 (MQ=255) tCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTgg > 1:557626/1‑150 (MQ=255) ccATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTg < 1:951274/143‑1 (MQ=255) ccATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTg < 1:951168/143‑1 (MQ=255) ccATGTTCTTGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTg > 2:951274/1‑143 (MQ=255) ccATGTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTg > 2:951168/1‑143 (MQ=255) cATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAagtag < 1:404892/100‑1 (MQ=255) cATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAagtag > 2:404892/1‑100 (MQ=255) cATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAagta > 2:1097059/1‑99 (MQ=255) cATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAagta < 1:1097059/99‑1 (MQ=255) cATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAg < 1:379261/150‑1 (MQ=255) ggCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGa < 2:1074320/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGTGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGaa < 2:9813/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACg > 2:1189752/1‑150 (MQ=255) ggCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTg > 2:650826/1‑150 (MQ=255) gTCGACGGTACTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCGGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCTCCCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTAAACGGCTggaa < 2:709277/150‑3 (MQ=255) gACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAg < 2:238392/39‑1 (MQ=255) gACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAg > 1:238392/1‑39 (MQ=255) ggTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGAt < 2:1389879/150‑1 (MQ=255) cTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACACGGTGAGACCCGGGCACTGTAACGTCGGGGGGTTGATGcc > 2:373028/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCAcg > 1:1319802/1‑150 (MQ=255) gcagTGCTCAGCCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTCAACGAGCTGAATTAGTTGCTTGCACGGCAGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCAcgg > 2:397643/4‑150 (MQ=255) cGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTTGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCAcggt < 1:634994/150‑1 (MQ=255) cGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCAcggt < 2:557626/150‑1 (MQ=255) tGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCAcg < 1:216851/145‑1 (MQ=255) tGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCAcg > 2:216851/1‑145 (MQ=255) cTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGctct > 1:186141/1‑106 (MQ=255) cTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGctct < 2:186141/106‑1 (MQ=255) cTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGtt < 1:382877/150‑1 (MQ=255) tCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTg < 1:901223/92‑1 (MQ=255) tCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTg > 2:901223/1‑92 (MQ=255) tCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGttt > 1:1210363/1‑150 (MQ=255) tCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGttt > 2:266693/1‑150 (MQ=255) gCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCAc > 1:620652/1‑150 (MQ=255) | TCATTGCCGTTGACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCGACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCAC > NC_002947/1024164‑1024462 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |